RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428918.1

CDH23-AS1-201, CDH23 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDH23-AS1, Length 378 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IGLV6-57P01721 117 aa9.46□□□□□ -0.9
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SCGB1D4Q6XE38 83 aa9.46□□□□□ -0.9
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OR13C6PQ8NH95 151 aa9.46□□□□□ -0.9
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PPDPFQ9H3Y8 114 aa9.46□□□□□ -0.9
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SPANXCQ9NY87 97 aa9.46□□□□□ -0.9
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GAGE2AQ6NT46 116 aa9.45□□□□□ -0.9
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SPAG11AQ6PDA7 123 aa9.45□□□□□ -0.9
CDH23-AS1-201ENST00000428918 Q6ZRX8 168 aa9.45□□□□□ -0.9
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CDH23-AS1-201ENST00000428918 ANKRD39Q53RE8 183 aa9.37□□□□□ -0.91
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa9.35□□□□□ -0.91
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CDH23-AS1-201ENST00000428918 C9orf153Q5TBE3 101 aa9.34□□□□□ -0.91
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa9.34□□□□□ -0.91
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa9.34□□□□□ -0.91
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RNF213Q63HN8 5207 aa9.33□□□□□ -0.92
CDH23-AS1-201ENST00000428918 C5orf52A6NGY3 159 aa9.33□□□□□ -0.92
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HIST3H2BBQ8N257 126 aa9.33□□□□□ -0.92
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CDIP1Q9H305 208 aa9.33□□□□□ -0.92
CDH23-AS1-201ENST00000428918 COX7BP24311 80 aa9.32□□□□□ -0.92
CDH23-AS1-201ENST00000428918 C6orf99Q4VX62 202 aa9.32□□□□□ -0.92
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PCP2Q8IVA1 136 aa9.32□□□□□ -0.92
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HIST1H2BLQ99880 126 aa9.32□□□□□ -0.92
CDH23-AS1-201ENST00000428918 A6NDN8 102 aa9.31□□□□□ -0.92
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLC25A34Q6PIV7 304 aa9.31□□□□□ -0.92
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CDH23-AS1-201ENST00000428918 TPRXLQ17RH7 258 aa9.29□□□□□ -0.92
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CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLC25A20O43772 301 aa9.23□□□□□ -0.93
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CDH23-AS1-201ENST00000428918 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
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CDH23-AS1-201ENST00000428918 VAMP3Q15836 100 aa9.19□□□□□ -0.94
CDH23-AS1-201ENST00000428918 Q8N377 158 aa9.19□□□□□ -0.94
CDH23-AS1-201ENST00000428918 Q1RN00 199 aa9.18□□□□□ -0.94
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SMIM11BQ8TCY0 68 aa9.18□□□□□ -0.94
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LIMD2Q9BT23 127 aa9.18□□□□□ -0.94
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HRCT1Q6UXD1 115 aa9.16□□□□□ -0.94
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HIST1H4GQ99525 98 aa9.15□□□□□ -0.94
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PRO1933Q9H354 126 aa9.15□□□□□ -0.94
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa9.13□□□□□ -0.95
CDH23-AS1-201ENST00000428918 COX8AP10176 69 aa9.12□□□□□ -0.95
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa9.11□□□□□ -0.95
CDH23-AS1-201ENST00000428918 H7C2G1 150 aa9.11□□□□□ -0.95
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
CDH23-AS1-201ENST00000428918 C12orf57Q99622 126 aa9.1□□□□□ -0.95
CDH23-AS1-201ENST00000428918 F8WEM9 126 aa9.09□□□□□ -0.95
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CD164Q04900 197 aa9.09□□□□□ -0.95
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DLEU1O43261 78 aa9.08□□□□□ -0.96
CDH23-AS1-201ENST00000428918 VAMP8Q9BV40 100 aa9.08□□□□□ -0.96
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PAM16Q9Y3D7 125 aa9.08□□□□□ -0.96
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LINC00575Q6W349 94 aa9.07□□□□□ -0.96
CDH23-AS1-201ENST00000428918 hADV29S1A0JD25 119 aa9.06□□□□□ -0.96
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SPATA45Q537H7 98 aa9.06□□□□□ -0.96
CDH23-AS1-201ENST00000428918 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa9.06□□□□□ -0.96
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SMIM29Q86T20 159 aa9.06□□□□□ -0.96
CDH23-AS1-201ENST00000428918 C14orf144Q96I85 54 aa9.06□□□□□ -0.96
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RAB37Q96AX2 223 aa9.05□□□□□ -0.96
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LCE2BO14633 110 aa9.04□□□□□ -0.96
CDH23-AS1-201ENST00000428918 Q6ZQY7 126 aa9.04□□□□□ -0.96
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SNCGO76070 127 aa9.02□□□□□ -0.97
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MUC2Q02817 5179 aa9.02□□□□□ -0.97
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