RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa7.67□□□□□ -1.18
EFTUD2-202ENST00000426333 IGKV2-30P06310 120 aa7.67□□□□□ -1.18
EFTUD2-202ENST00000426333 SMIM29Q86T20 159 aa7.66□□□□□ -1.18
EFTUD2-202ENST00000426333 C11orf72Q8NBR9 251 aa7.66□□□□□ -1.18
EFTUD2-202ENST00000426333 BCE1O60756 84 aa7.66□□□□□ -1.18
EFTUD2-202ENST00000426333 FSHBP01225 129 aa7.66□□□□□ -1.18
EFTUD2-202ENST00000426333 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
EFTUD2-202ENST00000426333 LINC00315P59091 139 aa7.65□□□□□ -1.18
EFTUD2-202ENST00000426333 Q9UF83 564 aa7.65□□□□□ -1.18
EFTUD2-202ENST00000426333 C1orf134Q5TEV5 83 aa7.65□□□□□ -1.18
EFTUD2-202ENST00000426333 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.19
EFTUD2-202ENST00000426333 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa7.63□□□□□ -1.19
EFTUD2-202ENST00000426333 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A1B0GU69 56 aa7.63□□□□□ -1.19
EFTUD2-202ENST00000426333 IGSF10Q6WRI0 2623 aa7.62□□□□□ -1.19
EFTUD2-202ENST00000426333 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A1B0GW54 56 aa7.62□□□□□ -1.19
EFTUD2-202ENST00000426333 LINC00167Q96N53 147 aa7.62□□□□□ -1.19
EFTUD2-202ENST00000426333 PRO0461Q9UI25 63 aa7.62□□□□□ -1.19
EFTUD2-202ENST00000426333 LINC01546A6NGU7 62 aa7.62□□□□□ -1.19
EFTUD2-202ENST00000426333 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.61□□□□□ -1.19
EFTUD2-202ENST00000426333 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
EFTUD2-202ENST00000426333 ITPR3Q14573 2671 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-202ENST00000426333 CUBNO60494 3623 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-202ENST00000426333 FBN2P35556 2912 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-202ENST00000426333 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-202ENST00000426333 ACYP2P14621 99 aa7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-202ENST00000426333 Q8NBF4 154 aa7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-202ENST00000426333 FHL3Q13643 280 aa7.58□□□□□ -1.2
EFTUD2-202ENST00000426333 SPAG11AQ6PDA7 123 aa7.58□□□□□ -1.2
EFTUD2-202ENST00000426333 MOBPQ13875 183 aa7.58□□□□□ -1.2
EFTUD2-202ENST00000426333 AKAP9Q99996 3911 aa7.57□□□□□ -1.2
EFTUD2-202ENST00000426333 C7orf65Q6ZTY9 151 aa7.57□□□□□ -1.2
EFTUD2-202ENST00000426333 SPACA4Q8TDM5 124 aa7.57□□□□□ -1.2
EFTUD2-202ENST00000426333 H3BPC8 53 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM19A4Q96LR4 140 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-202ENST00000426333 TRAV22A0A0B4J277 110 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-202ENST00000426333 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-202ENST00000426333 Q6ZQT0 140 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-202ENST00000426333 FLNCQ14315 2725 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-202ENST00000426333 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-202ENST00000426333 CHD6Q8TD26 2715 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-202ENST00000426333 C4orf26Q17RF5 130 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-202ENST00000426333 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-202ENST00000426333 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-202ENST00000426333 LINC00476Q8WZB0 136 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-202ENST00000426333 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-202ENST00000426333 Q6ZRX8 168 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-202ENST00000426333 TM2D3Q9BRN9 247 aa7.53□□□□□ -1.2
EFTUD2-202ENST00000426333 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.52□□□□□ -1.21
EFTUD2-202ENST00000426333 H3BNG1 76 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-202ENST00000426333 MDFIQ99750 246 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-202ENST00000426333 STAB1Q9NY15 2570 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-202ENST00000426333 TENM4Q6N022 2769 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-202ENST00000426333 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-202ENST00000426333 BAHCC1Q9P281 2608 aa7.47□□□□□ -1.21
EFTUD2-202ENST00000426333 C8orf87E5RJ46 101 aa7.47□□□□□ -1.21
EFTUD2-202ENST00000426333 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
EFTUD2-202ENST00000426333 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
EFTUD2-202ENST00000426333 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.46□□□□□ -1.21
EFTUD2-202ENST00000426333 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7.46□□□□□ -1.21
EFTUD2-202ENST00000426333 NOTCH1P46531 2555 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-202ENST00000426333 EPM2AB3EWF7 344 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-202ENST00000426333 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-202ENST00000426333 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-202ENST00000426333 LINC00313P59037 77 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-202ENST00000426333 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
EFTUD2-202ENST00000426333 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
EFTUD2-202ENST00000426333 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa7.43□□□□□ -1.22
EFTUD2-202ENST00000426333 C16orf90A8MZG2 172 aa7.43□□□□□ -1.22
EFTUD2-202ENST00000426333 LITAFQ99732 161 aa7.43□□□□□ -1.22
EFTUD2-202ENST00000426333 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
EFTUD2-202ENST00000426333 Q6ZRP5 223 aa7.42□□□□□ -1.22
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM229AH3BQW9 127 aa7.42□□□□□ -1.22
EFTUD2-202ENST00000426333 VPREB1P12018 145 aa7.42□□□□□ -1.22
EFTUD2-202ENST00000426333 LINC01600Q96MT4 127 aa7.42□□□□□ -1.22
EFTUD2-202ENST00000426333 TEX15Q9BXT5 2789 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-202ENST00000426333 A8MUN3 132 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-202ENST00000426333 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-202ENST00000426333 ERC2-IT1O76042 136 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-202ENST00000426333 IGLV6-57P01721 117 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-202ENST00000426333 Q8NAQ8 132 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-202ENST00000426333 A8MWP4 228 aa7.4□□□□□ -1.23
EFTUD2-202ENST00000426333 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-202ENST00000426333 K7EQZ3 153 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-202ENST00000426333 CHTF8P0CG12 524 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-202ENST00000426333 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-202ENST00000426333 LINC00588Q9Y4M8 146 aa7.39□□□□□ -1.23
EFTUD2-202ENST00000426333 RTL8CO15255 209 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-202ENST00000426333 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-202ENST00000426333 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-202ENST00000426333 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
EFTUD2-202ENST00000426333 SPINT4Q6UDR6 99 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-202ENST00000426333 UQCR11O14957 56 aa7.37□□□□□ -1.23
EFTUD2-202ENST00000426333 COA5Q86WW8 74 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-202ENST00000426333 Q96NJ1 140 aa7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-202ENST00000426333 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-202ENST00000426333 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.7 ms