RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412640.6

SOX9-AS1-201, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 635 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-201ENST00000412640 Q1RN00 199 aa6.09□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.08□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-201ENST00000412640 F8W1H4 67 aa6.08□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-201ENST00000412640 H3BMG7 143 aa6.08□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLPIP03973 132 aa6.08□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-201ENST00000412640 COX6CP09669 75 aa6.08□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.08□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.08□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CARD19Q96LW7 228 aa6.08□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PRO0461Q9UI25 63 aa6.08□□□□□ -1.44
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SOX9-AS1-201ENST00000412640 LINC01600Q96MT4 127 aa6.07□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LPAP08519 4548 aa6.06□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ATXN8Q156A1 80 aa6.06□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C14orf177Q52M58 125 aa6.06□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SVIPQ8NHG7 77 aa6.06□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM126AQ9H061 195 aa6.06□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.06□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-201ENST00000412640 M0QXV9 152 aa6.05□□□□□ -1.44
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SOX9-AS1-201ENST00000412640 Q6ZRP5 223 aa6.05□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.05□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IGLV6-57P01721 117 aa6.04□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-201ENST00000412640 VPREB1P12018 145 aa6.04□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-201ENST00000412640 WFDC2Q14508 124 aa6.04□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.04□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-201ENST00000412640 H0YGX0 51 aa6.03□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TRACP01848 142 aa6.03□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.03□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-201ENST00000412640 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.03□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.02□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-201ENST00000412640 A0A0U1RQV1 116 aa6.02□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.02□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NCR3O14931 201 aa6.02□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LECT2O14960 151 aa6.02□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CLEC2BQ92478 149 aa6.02□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-201ENST00000412640 M0R378 163 aa6.01□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CDIP1Q9H305 208 aa6.01□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-201ENST00000412640 A0A1B0GX51 115 aa6□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC25A20O43772 301 aa6□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GAGE2EQ4V326 116 aa6□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-201ENST00000412640 S100A7L2Q5SY68 101 aa6□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CBY1Q9Y3M2 126 aa6□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C9JAW5 83 aa5.99□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-201ENST00000412640 H3BT86 120 aa5.99□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FAM218AQ96MZ4 157 aa5.99□□□□□ -1.45
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SOX9-AS1-201ENST00000412640 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa5.98□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ANKRD29Q8N6D5 301 aa5.98□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C9orf163Q8N9P6 203 aa5.98□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa5.97□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ETDBQ3ZM63 59 aa5.97□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OCIAD2Q56VL3 154 aa5.97□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MTURNQ8N3F0 131 aa5.97□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LINC00167Q96N53 147 aa5.97□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-201ENST00000412640 A0A087WYN8 130 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C6orf99Q4VX62 202 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LCE2CQ5TA81 110 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TEN1Q86WV5 123 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KCNQ1DNQ9H478 68 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GAGE2BQ13066 116 aa5.95□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NKAPP1Q8N9T2 125 aa5.95□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C7orf33Q8WU49 177 aa5.95□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-201ENST00000412640 A0A096LNI7 61 aa5.94□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-201ENST00000412640 H3BS24 57 aa5.94□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-201ENST00000412640 K7ERU9 68 aa5.94□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LINC00575Q6W349 94 aa5.94□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DIRC1Q969H9 104 aa5.94□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa5.93□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FAM168BA1KXE4 195 aa5.93□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SDIM1Q6ZPB5 146 aa5.93□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PPDPFLQ8WWR9 84 aa5.93□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C22orf24Q9Y442 160 aa5.93□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PRYO14603 147 aa5.92□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SNCGO76070 127 aa5.92□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DNAL4O96015 105 aa5.92□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BAALC-AS2P0C853 105 aa5.92□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SPRR1AP35321 89 aa5.92□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LINC00474Q9P2X8 69 aa5.92□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-201ENST00000412640 hADV29S1A0JD25 119 aa5.91□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-201ENST00000412640 COX7BP24311 80 aa5.91□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-201ENST00000412640 A0A1W2PNN7 141 aa5.9□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-201ENST00000412640 H3BQ85 93 aa5.9□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-201ENST00000412640 J3QR89 54 aa5.9□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KRTAP10-8P60410 259 aa5.9□□□□□ -1.46
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