RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP10-11P60412 298 aa11.49□□□□□ -0.57
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SH3BP4-202ENST00000392011 TM2D3Q9BRN9 247 aa11.47□□□□□ -0.57
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SH3BP4-202ENST00000392011 CASC10Q5T4H9 136 aa11.26□□□□□ -0.61
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SH3BP4-202ENST00000392011 A8MWP4 228 aa11.26□□□□□ -0.61
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SH3BP4-202ENST00000392011 H3BPC8 53 aa11.25□□□□□ -0.61
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SH3BP4-202ENST00000392011 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 A0A1B0GU69 56 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 CDH23Q9H251 3354 aa11.23□□□□□ -0.61
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SH3BP4-202ENST00000392011 C9orf163Q8N9P6 203 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 UNC79Q9P2D8 2635 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 FREM2Q5SZK8 3169 aa11.21□□□□□ -0.62
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SH3BP4-202ENST00000392011 ANAPC11Q9NYG5 84 aa11.17□□□□□ -0.62
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SH3BP4-202ENST00000392011 PRR15Q8IV56 129 aa11.15□□□□□ -0.62
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SH3BP4-202ENST00000392011 FAM104AQ969W3 186 aa11.13□□□□□ -0.63
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SH3BP4-202ENST00000392011 C8orf17Q9NRJ1 99 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 C8orf87E5RJ46 101 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 APLNQ9ULZ1 77 aa11.09□□□□□ -0.63
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SH3BP4-202ENST00000392011 KLKP1Q107X0 134 aa11.08□□□□□ -0.64
SH3BP4-202ENST00000392011 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa11.06□□□□□ -0.64
SH3BP4-202ENST00000392011 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa11.06□□□□□ -0.64
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SH3BP4-202ENST00000392011 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP4-202ENST00000392011 A0A1B0GVX0 72 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP4-202ENST00000392011 COA5Q86WW8 74 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP4-202ENST00000392011 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP4-202ENST00000392011 LAMA1P25391 3075 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 TACC2O95359 2948 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 H7BZZ5 65 aa11.02□□□□□ -0.65
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SH3BP4-202ENST00000392011 SPRR4Q96PI1 79 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 IGLV7-43P04211 117 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 VCANP13611 3396 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 FLNCQ14315 2725 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 LINC00304Q8N9R0 145 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 SZT2Q5T011 3432 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 ATMQ13315 3056 aa10.96□□□□□ -0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa10.96□□□□□ -0.66
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