RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000383974.1

RNU6-1040P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1040, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1040P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1040P-201ENST00000383974 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP-2.86□□□□□ -2.87
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TEX14Q8IWB6 1497 aa-2.87□□□□□ -2.87
RNU6-1040P-201ENST00000383974 E5RI56 91 aa-2.87□□□□□ -2.87
RNU6-1040P-201ENST00000383974 COMMD6Q7Z4G1 85 aa-2.87□□□□□ -2.87
RNU6-1040P-201ENST00000383974 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP-2.87□□□□□ -2.87
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ABCC5O15440 1437 aa-2.87□□□□□ -2.87
RNU6-1040P-201ENST00000383974 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP-2.88□□□□□ -2.87
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ASPMQ8IZT6 3477 aa-2.88□□□□□ -2.87
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa-2.88□□□□□ -2.87
RNU6-1040P-201ENST00000383974 NDUFB6O95139 128 aa-2.88□□□□□ -2.87
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa-2.88□□□□□ -2.87
RNU6-1040P-201ENST00000383974 A0A1B0GV72 72 aa-2.89□□□□□ -2.87
RNU6-1040P-201ENST00000383974 H0Y9P7 68 aa-2.89□□□□□ -2.87
RNU6-1040P-201ENST00000383974 M0QY20 66 aa-2.89□□□□□ -2.87
RNU6-1040P-201ENST00000383974 DNAH12Q6ZR08 3092 aa-2.89□□□□□ -2.87
RNU6-1040P-201ENST00000383974 DEFB107AQ8IZN7 70 aa-2.89□□□□□ -2.87
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP-2.89□□□□□ -2.87
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ARAP2Q8WZ64 1704 aa-2.89□□□□□ -2.87
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa-2.89□□□□□ -2.87
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1040P-201ENST00000383974 GNGT1P63211 74 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TAC4Q86UU9 113 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1040P-201ENST00000383974 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1040P-201ENST00000383974 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1040P-201ENST00000383974 GRIN2AQ12879 1464 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1040P-201ENST00000383974 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ACYP1P07311 99 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1040P-201ENST00000383974 NUP188Q5SRE5 1749 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-1040P-201ENST00000383974 A0A1B0GUL6 1792 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1040P-201ENST00000383974 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1040P-201ENST00000383974 H3BQF6 201 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1040P-201ENST00000383974 IGLC6P0CF74 106 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1040P-201ENST00000383974 S100PP25815 95 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1040P-201ENST00000383974 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1040P-201ENST00000383974 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-1040P-201ENST00000383974 PHLPP1O60346 1717 aa-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-1040P-201ENST00000383974 HSD52Q0P140 79 aa-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-1040P-201ENST00000383974 A2ML1A8K2U0 1454 aa-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SAMD9Q5K651 1589 aa-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CROCC2H7BZ55 1655 aa-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SCN7AQ01118 1682 aa-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-1040P-201ENST00000383974 KIF21BO75037 1637 aa-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ATP10BO94823 1461 aa-2.94□□□□□ -2.88
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ERVK-7P63135 1459 aa-2.94□□□□□ -2.88
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa-2.94□□□□□ -2.88
RNU6-1040P-201ENST00000383974 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa-2.94□□□□□ -2.88
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TTTY10Q9BZA0 68 aa-2.94□□□□□ -2.88
RNU6-1040P-201ENST00000383974 MLH3Q9UHC1 1453 aa-2.95□□□□□ -2.88
RNU6-1040P-201ENST00000383974 QSER1Q2KHR3 1735 aa-2.95□□□□□ -2.88
RNU6-1040P-201ENST00000383974 RPS27P42677 84 aaKnown RBP-2.95□□□□□ -2.88
RNU6-1040P-201ENST00000383974 RPL38P63173 70 aaKnown RBP-2.95□□□□□ -2.88
RNU6-1040P-201ENST00000383974 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP-2.95□□□□□ -2.88
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CENPHQ9H3R5 247 aa-2.95□□□□□ -2.88
RNU6-1040P-201ENST00000383974 AP4S1Q9Y587 144 aa-2.95□□□□□ -2.88
RNU6-1040P-201ENST00000383974 UBR3Q6ZT12 1888 aa-2.95□□□□□ -2.88
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SMIM21Q3B7S5 101 aa-2.96□□□□□ -2.88
RNU6-1040P-201ENST00000383974 UQCR10Q9UDW1 63 aa-2.96□□□□□ -2.88
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SERP1Q9Y6X1 66 aa-2.96□□□□□ -2.88
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CDH23Q9H251 3354 aa-2.96□□□□□ -2.88
RNU6-1040P-201ENST00000383974 KIF20BQ96Q89 1820 aa-2.96□□□□□ -2.88
RNU6-1040P-201ENST00000383974 MED14O60244 1454 aa-2.96□□□□□ -2.88
RNU6-1040P-201ENST00000383974 MRC2Q9UBG0 1479 aa-2.96□□□□□ -2.88
RNU6-1040P-201ENST00000383974 PLIN4Q96Q06 1357 aa-2.97□□□□□ -2.88
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ITSN2Q9NZM3 1697 aa-2.97□□□□□ -2.88
RNU6-1040P-201ENST00000383974 C7orf77A4D0Y5 90 aa-2.97□□□□□ -2.88
RNU6-1040P-201ENST00000383974 H3BUA1 57 aa-2.97□□□□□ -2.88
RNU6-1040P-201ENST00000383974 IGLC2P0DOY2 106 aa-2.97□□□□□ -2.88
RNU6-1040P-201ENST00000383974 IGLC3P0DOY3 106 aa-2.97□□□□□ -2.88
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CCDC153Q494R4 210 aa-2.97□□□□□ -2.88
RNU6-1040P-201ENST00000383974 MORN2Q502X0 79 aa-2.97□□□□□ -2.88
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SFTA2Q6UW10 78 aa-2.97□□□□□ -2.88
RNU6-1040P-201ENST00000383974 GINS2Q9Y248 185 aa-2.97□□□□□ -2.88
RNU6-1040P-201ENST00000383974 HSPB11Q9Y547 144 aa-2.97□□□□□ -2.88
RNU6-1040P-201ENST00000383974 PLCH1Q4KWH8 1693 aa-2.98□□□□□ -2.89
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa-2.98□□□□□ -2.89
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CEP152O94986 1710 aa-2.98□□□□□ -2.89
RNU6-1040P-201ENST00000383974 DBIP07108 87 aaKnown RBP-2.98□□□□□ -2.89
RNU6-1040P-201ENST00000383974 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa-2.98□□□□□ -2.89
RNU6-1040P-201ENST00000383974 EEA1Q15075 1411 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1040P-201ENST00000383974 LINC00694P0DN24 101 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SPANXCQ9NY87 97 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1040P-201ENST00000383974 LINC00474Q9P2X8 69 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1040P-201ENST00000383974 NCOA2Q15596 1464 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SHPRHQ149N8 1683 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TSTD3H0UI37 97 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-1040P-201ENST00000383974 LEPROTL1O95214 131 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-1040P-201ENST00000383974 DDA1Q9BW61 102 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-1040P-201ENST00000383974 UBR1Q8IWV7 1749 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-1040P-201ENST00000383974 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa-3.01□□□□□ -2.89
RNU6-1040P-201ENST00000383974 OVOS2Q6IE36 1432 aa-3.01□□□□□ -2.89
RNU6-1040P-201ENST00000383974 KIF1AQ12756 1690 aa-3.01□□□□□ -2.89
RNU6-1040P-201ENST00000383974 LRRC7Q96NW7 1537 aa-3.01□□□□□ -2.89
RNU6-1040P-201ENST00000383974 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa-3.01□□□□□ -2.89
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TRAPPC2P0DI81 140 aa-3.01□□□□□ -2.89
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TRAPPC2BP0DI82 140 aa-3.01□□□□□ -2.89
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ARL11Q969Q4 196 aa-3.01□□□□□ -2.89
RNU6-1040P-201ENST00000383974 NESP48681 1621 aa-3.01□□□□□ -2.89
RNU6-1040P-201ENST00000383974 FAM135AQ9P2D6 1515 aa-3.02□□□□□ -2.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.8 ms