RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373159.1

TRAPPC3-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-201ENST00000373159 LIMD2Q9BT23 127 aa7.09□□□□□ -1.27
TRAPPC3-201ENST00000373159 HSBP1O75506 76 aa7.08□□□□□ -1.28
TRAPPC3-201ENST00000373159 C9orf92A6NGG3 77 aa7.07□□□□□ -1.28
TRAPPC3-201ENST00000373159 H0Y8G0 127 aa7.07□□□□□ -1.28
TRAPPC3-201ENST00000373159 PLNP26678 52 aa7.07□□□□□ -1.28
TRAPPC3-201ENST00000373159 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
TRAPPC3-201ENST00000373159 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
TRAPPC3-201ENST00000373159 SLC25A34Q6PIV7 304 aa7.07□□□□□ -1.28
TRAPPC3-201ENST00000373159 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
TRAPPC3-201ENST00000373159 APOC3P02656 99 aa7.06□□□□□ -1.28
TRAPPC3-201ENST00000373159 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.06□□□□□ -1.28
TRAPPC3-201ENST00000373159 YPEL4Q96NS1 127 aa7.06□□□□□ -1.28
TRAPPC3-201ENST00000373159 CBY1Q9Y3M2 126 aa7.06□□□□□ -1.28
TRAPPC3-201ENST00000373159 SNAPINO95295 136 aa7.05□□□□□ -1.28
TRAPPC3-201ENST00000373159 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
TRAPPC3-201ENST00000373159 HERVK_113P61574 105 aa7.05□□□□□ -1.28
TRAPPC3-201ENST00000373159 HRCT1Q6UXD1 115 aa7.05□□□□□ -1.28
TRAPPC3-201ENST00000373159 LEPROTL1O95214 131 aa7.04□□□□□ -1.28
TRAPPC3-201ENST00000373159 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.04□□□□□ -1.28
TRAPPC3-201ENST00000373159 SVBPQ8N300 66 aa7.04□□□□□ -1.28
TRAPPC3-201ENST00000373159 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.04□□□□□ -1.28
TRAPPC3-201ENST00000373159 DPM2O94777 84 aa7.03□□□□□ -1.28
TRAPPC3-201ENST00000373159 CD164Q04900 197 aa7.03□□□□□ -1.28
TRAPPC3-201ENST00000373159 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa7.03□□□□□ -1.28
TRAPPC3-201ENST00000373159 A0A0J9YXY3 114 aa7.02□□□□□ -1.29
TRAPPC3-201ENST00000373159 NPC2P61916 151 aa7.02□□□□□ -1.29
TRAPPC3-201ENST00000373159 IGKCP01834 107 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3-201ENST00000373159 NDUFA5Q16718 116 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3-201ENST00000373159 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC3-201ENST00000373159 M0R2T5 61 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC3-201ENST00000373159 LINC00310P59036 64 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC3-201ENST00000373159 Q5XG85 94 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC3-201ENST00000373159 PMCHL2Q9BQD1 86 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC3-201ENST00000373159 HSPB8Q9UJY1 196 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC3-201ENST00000373159 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC3-201ENST00000373159 PRO1933Q9H354 126 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC3-201ENST00000373159 SPANXCQ9NY87 97 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC3-201ENST00000373159 SERF1AO75920 110 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC3-201ENST00000373159 E9PLD3 99 aa6.97□□□□□ -1.29
TRAPPC3-201ENST00000373159 H7C2G1 150 aa6.97□□□□□ -1.29
TRAPPC3-201ENST00000373159 FABP4P15090 132 aa6.97□□□□□ -1.29
TRAPPC3-201ENST00000373159 TAL2Q16559 108 aa6.97□□□□□ -1.29
TRAPPC3-201ENST00000373159 C1orf195Q5TG92 126 aa6.97□□□□□ -1.29
TRAPPC3-201ENST00000373159 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.97□□□□□ -1.29
TRAPPC3-201ENST00000373159 LITAFQ99732 161 aa6.97□□□□□ -1.29
TRAPPC3-201ENST00000373159 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.97□□□□□ -1.29
TRAPPC3-201ENST00000373159 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3-201ENST00000373159 TRGC2P03986 189 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3-201ENST00000373159 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3-201ENST00000373159 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3-201ENST00000373159 COX7BP24311 80 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3-201ENST00000373159 AKR1D1P51857 326 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3-201ENST00000373159 Q1RN00 199 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3-201ENST00000373159 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3-201ENST00000373159 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3-201ENST00000373159 TIMM17BO60830 172 aa6.94□□□□□ -1.3
TRAPPC3-201ENST00000373159 SMIM29Q86T20 159 aa6.94□□□□□ -1.3
TRAPPC3-201ENST00000373159 C6orf99Q4VX62 202 aa6.93□□□□□ -1.3
TRAPPC3-201ENST00000373159 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.93□□□□□ -1.3
TRAPPC3-201ENST00000373159 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.92□□□□□ -1.3
TRAPPC3-201ENST00000373159 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.89□□□□□ -1.31
TRAPPC3-201ENST00000373159 A0A0G2JQZ4 141 aa6.88□□□□□ -1.31
TRAPPC3-201ENST00000373159 A0A1B0GWB2 263 aa6.87□□□□□ -1.31
TRAPPC3-201ENST00000373159 ZNF815PA8K554 130 aa6.86□□□□□ -1.31
TRAPPC3-201ENST00000373159 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.86□□□□□ -1.31
TRAPPC3-201ENST00000373159 TCL1BO95988 128 aa6.86□□□□□ -1.31
TRAPPC3-201ENST00000373159 USH2AO75445 5202 aa6.86□□□□□ -1.31
TRAPPC3-201ENST00000373159 SSPOA2VEC9 5147 aa6.84□□□□□ -1.31
TRAPPC3-201ENST00000373159 LINC01545Q5VT33 79 aa6.84□□□□□ -1.31
TRAPPC3-201ENST00000373159 A4D1N5 150 aa6.83□□□□□ -1.32
TRAPPC3-201ENST00000373159 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.83□□□□□ -1.32
TRAPPC3-201ENST00000373159 A6NDN8 102 aa6.81□□□□□ -1.32
TRAPPC3-201ENST00000373159 COLCA2A8K830 154 aa6.81□□□□□ -1.32
TRAPPC3-201ENST00000373159 PET117Q6UWS5 81 aa6.81□□□□□ -1.32
TRAPPC3-201ENST00000373159 COPS9Q8WXC6 57 aa6.81□□□□□ -1.32
TRAPPC3-201ENST00000373159 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.8□□□□□ -1.32
TRAPPC3-201ENST00000373159 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
TRAPPC3-201ENST00000373159 IFITM1P13164 125 aa6.8□□□□□ -1.32
TRAPPC3-201ENST00000373159 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.8□□□□□ -1.32
TRAPPC3-201ENST00000373159 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
TRAPPC3-201ENST00000373159 Q6Q795 121 aa6.79□□□□□ -1.32
TRAPPC3-201ENST00000373159 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.78□□□□□ -1.32
TRAPPC3-201ENST00000373159 Q6ZVH6 145 aa6.78□□□□□ -1.32
TRAPPC3-201ENST00000373159 Q75L30 129 aa6.78□□□□□ -1.32
TRAPPC3-201ENST00000373159 CFC1P0CG37 223 aa6.77□□□□□ -1.33
TRAPPC3-201ENST00000373159 PCP2Q8IVA1 136 aa6.77□□□□□ -1.33
TRAPPC3-201ENST00000373159 F8WEM9 126 aa6.76□□□□□ -1.33
TRAPPC3-201ENST00000373159 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.76□□□□□ -1.33
TRAPPC3-201ENST00000373159 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.75□□□□□ -1.33
TRAPPC3-201ENST00000373159 Q6JHZ5 121 aa6.75□□□□□ -1.33
TRAPPC3-201ENST00000373159 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.75□□□□□ -1.33
TRAPPC3-201ENST00000373159 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.75□□□□□ -1.33
TRAPPC3-201ENST00000373159 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.75□□□□□ -1.33
TRAPPC3-201ENST00000373159 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.74□□□□□ -1.33
TRAPPC3-201ENST00000373159 HIST1H2BKO60814 126 aa6.74□□□□□ -1.33
TRAPPC3-201ENST00000373159 HIST1H2BJP06899 126 aa6.74□□□□□ -1.33
TRAPPC3-201ENST00000373159 C3orf79P0CE67 100 aa6.74□□□□□ -1.33
TRAPPC3-201ENST00000373159 HIST1H2BOP23527 126 aa6.74□□□□□ -1.33
TRAPPC3-201ENST00000373159 HIST1H2BBP33778 126 aa6.74□□□□□ -1.33
TRAPPC3-201ENST00000373159 HIST1H2BDP58876 126 aa6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.4 ms