RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368213.9

PTPRK-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRK, Length 5,816 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-205ENST00000368213 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRK-205ENST00000368213 EYSQ5T1H1 3165 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRK-205ENST00000368213 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRK-205ENST00000368213 LINC00612Q8N6U2 182 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRK-205ENST00000368213 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRK-205ENST00000368213 A6NED7 52 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRK-205ENST00000368213 ITPR3Q14573 2671 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRK-205ENST00000368213 ATRQ13535 2644 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRK-205ENST00000368213 C7orf65Q6ZTY9 151 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRK-205ENST00000368213 PRR34Q9NV39 138 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRK-205ENST00000368213 ZNF575Q86XF7 245 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRK-205ENST00000368213 A0A0U1RQV1 116 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRK-205ENST00000368213 C15orf56Q8N910 161 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRK-205ENST00000368213 ZNF861PO60384 105 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRK-205ENST00000368213 MAST4O15021 2626 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRK-205ENST00000368213 SPAG11AQ6PDA7 123 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRK-205ENST00000368213 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRK-205ENST00000368213 A0A087WVE0 104 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRK-205ENST00000368213 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRK-205ENST00000368213 TRAV7A0A075B6U4 112 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRK-205ENST00000368213 TNP2Q05952 138 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRK-205ENST00000368213 TMEM254Q8TBM7 123 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRK-205ENST00000368213 DNAH14Q0VDD8 3507 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRK-205ENST00000368213 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
PTPRK-205ENST00000368213 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRK-205ENST00000368213 C1orf64Q8NEQ6 169 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRK-205ENST00000368213 IGLV7-43P04211 117 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRK-205ENST00000368213 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRK-205ENST00000368213 LINC00846Q9NV44 126 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRK-205ENST00000368213 AKAP13Q12802 2813 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRK-205ENST00000368213 COX7CP15954 63 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRK-205ENST00000368213 FRYLO94915 3013 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRK-205ENST00000368213 C9orf92A6NGG3 77 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRK-205ENST00000368213 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRK-205ENST00000368213 A0A1B0GW54 56 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRK-205ENST00000368213 IGLV6-57P01721 117 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRK-205ENST00000368213 CXCL6P80162 114 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRK-205ENST00000368213 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRK-205ENST00000368213 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRK-205ENST00000368213 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRK-205ENST00000368213 SMIM29Q86T20 159 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRK-205ENST00000368213 FREM2Q5SZK8 3169 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRK-205ENST00000368213 CNBPP62633 177 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PTPRK-205ENST00000368213 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRK-205ENST00000368213 SPEGQ15772 3267 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRK-205ENST00000368213 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PTPRK-205ENST00000368213 C8orf87E5RJ46 101 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRK-205ENST00000368213 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRK-205ENST00000368213 WIPF1O43516 503 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRK-205ENST00000368213 A0A1W2PNN7 141 aa7□□□□□ -1.29
PTPRK-205ENST00000368213 PMAIP1Q13794 54 aa7□□□□□ -1.29
PTPRK-205ENST00000368213 ANAPC11Q9NYG5 84 aa7□□□□□ -1.29
PTPRK-205ENST00000368213 BAHCC1Q9P281 2608 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRK-205ENST00000368213 REV3LO60673 3130 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRK-205ENST00000368213 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRK-205ENST00000368213 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRK-205ENST00000368213 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRK-205ENST00000368213 CHD6Q8TD26 2715 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRK-205ENST00000368213 Q6ZQT0 140 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRK-205ENST00000368213 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRK-205ENST00000368213 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRK-205ENST00000368213 DSCR10P59022 87 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRK-205ENST00000368213 CR1P17927 2039 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRK-205ENST00000368213 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRK-205ENST00000368213 ACYP2P14621 99 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRK-205ENST00000368213 LCE6AA0A183 80 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRK-205ENST00000368213 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRK-205ENST00000368213 A8MWP4 228 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRK-205ENST00000368213 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRK-205ENST00000368213 IGFL1Q6UW32 110 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRK-205ENST00000368213 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRK-205ENST00000368213 CCDC179H3BU77 68 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRK-205ENST00000368213 LITAFQ99732 161 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRK-205ENST00000368213 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRK-205ENST00000368213 FRYQ5TBA9 3013 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRK-205ENST00000368213 SPRR4Q96PI1 79 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRK-205ENST00000368213 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRK-205ENST00000368213 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRK-205ENST00000368213 IGSF10Q6WRI0 2623 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRK-205ENST00000368213 FLNCQ14315 2725 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRK-205ENST00000368213 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRK-205ENST00000368213 ATMQ13315 3056 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-205ENST00000368213 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-205ENST00000368213 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-205ENST00000368213 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-205ENST00000368213 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-205ENST00000368213 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-205ENST00000368213 ZZEF1O43149 2961 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-205ENST00000368213 A0A1B0GU69 56 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-205ENST00000368213 A0A0G2JQZ4 141 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-205ENST00000368213 Q8N377 158 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-205ENST00000368213 COL12A1Q99715 3063 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-205ENST00000368213 H3BPC8 53 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-205ENST00000368213 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-205ENST00000368213 A0A1B0GVX0 72 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-205ENST00000368213 K7EQZ3 153 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-205ENST00000368213 Q6ZSA8 131 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRK-205ENST00000368213 STAB1Q9NY15 2570 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRK-205ENST00000368213 DMXL1Q9Y485 3027 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRK-205ENST00000368213 TEX15Q9BXT5 2789 aa6.84□□□□□ -1.31
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