RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 SMCR5Q8TEV8 140 aa8.77□□□□□ -1.01
CSAG1-201ENST00000361211 B5MCH6 92 aa8.76□□□□□ -1.01
CSAG1-201ENST00000361211 SCGB1D4Q6XE38 83 aa8.76□□□□□ -1.01
CSAG1-201ENST00000361211 SPRR4Q96PI1 79 aa8.76□□□□□ -1.01
CSAG1-201ENST00000361211 SPANXCQ9NY87 97 aa8.76□□□□□ -1.01
CSAG1-201ENST00000361211 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa8.75□□□□□ -1.01
CSAG1-201ENST00000361211 AKR1D1P51857 326 aa8.75□□□□□ -1.01
CSAG1-201ENST00000361211 S100A12P80511 92 aa8.75□□□□□ -1.01
CSAG1-201ENST00000361211 SPANXDQ9BXN6 97 aa8.75□□□□□ -1.01
CSAG1-201ENST00000361211 C3orf22Q8N5N4 141 aa8.74□□□□□ -1.01
CSAG1-201ENST00000361211 ERC2-IT1O76042 136 aa8.73□□□□□ -1.01
CSAG1-201ENST00000361211 Q9BRP9 147 aa8.73□□□□□ -1.01
CSAG1-201ENST00000361211 LPAP08519 4548 aa8.73□□□□□ -1.01
CSAG1-201ENST00000361211 C5orf52A6NGY3 159 aa8.72□□□□□ -1.01
CSAG1-201ENST00000361211 TSPAN13O95857 204 aa8.72□□□□□ -1.01
CSAG1-201ENST00000361211 Q6ZRX8 168 aa8.72□□□□□ -1.01
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
CSAG1-201ENST00000361211 OR13C6PQ8NH95 151 aa8.71□□□□□ -1.02
CSAG1-201ENST00000361211 PPDPFQ9H3Y8 114 aa8.71□□□□□ -1.02
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
CSAG1-201ENST00000361211 LINC00304Q8N9R0 145 aa8.69□□□□□ -1.02
CSAG1-201ENST00000361211 MUSTN1Q8IVN3 82 aa8.68□□□□□ -1.02
CSAG1-201ENST00000361211 HSBP1L1C9JCN9 74 aa8.67□□□□□ -1.02
CSAG1-201ENST00000361211 IFITM1P13164 125 aa8.67□□□□□ -1.02
CSAG1-201ENST00000361211 LINC00483Q53H64 154 aa8.67□□□□□ -1.02
CSAG1-201ENST00000361211 GAGE2AQ6NT46 116 aa8.67□□□□□ -1.02
CSAG1-201ENST00000361211 SCGB1D1O95968 90 aa8.66□□□□□ -1.02
CSAG1-201ENST00000361211 Q6ZVH6 145 aa8.66□□□□□ -1.02
CSAG1-201ENST00000361211 LINC00518Q8N0U6 118 aa8.66□□□□□ -1.02
CSAG1-201ENST00000361211 PRR4Q16378 134 aa8.65□□□□□ -1.02
CSAG1-201ENST00000361211 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CSAG1-201ENST00000361211 COPS9Q8WXC6 57 aa8.64□□□□□ -1.03
CSAG1-201ENST00000361211 CBY1Q9Y3M2 126 aa8.64□□□□□ -1.03
CSAG1-201ENST00000361211 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa8.63□□□□□ -1.03
CSAG1-201ENST00000361211 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CSAG1-201ENST00000361211 C6orf99Q4VX62 202 aa8.62□□□□□ -1.03
CSAG1-201ENST00000361211 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CSAG1-201ENST00000361211 RETNLBQ9BQ08 111 aa8.61□□□□□ -1.03
CSAG1-201ENST00000361211 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa8.6□□□□□ -1.03
CSAG1-201ENST00000361211 A6NDN8 102 aa8.6□□□□□ -1.03
CSAG1-201ENST00000361211 COX7BP24311 80 aa8.6□□□□□ -1.03
CSAG1-201ENST00000361211 Q8NBF4 154 aa8.6□□□□□ -1.03
CSAG1-201ENST00000361211 MOBPQ13875 183 aa8.59□□□□□ -1.03
CSAG1-201ENST00000361211 RNF213Q63HN8 5207 aa8.58□□□□□ -1.04
CSAG1-201ENST00000361211 COX8AP10176 69 aa8.58□□□□□ -1.04
CSAG1-201ENST00000361211 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa8.57□□□□□ -1.04
CSAG1-201ENST00000361211 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa8.56□□□□□ -1.04
CSAG1-201ENST00000361211 A4D1N5 150 aa8.56□□□□□ -1.04
CSAG1-201ENST00000361211 PAM16Q9Y3D7 125 aa8.56□□□□□ -1.04
CSAG1-201ENST00000361211 CTAG1AP78358 180 aa8.55□□□□□ -1.04
CSAG1-201ENST00000361211 SPAG11AQ6PDA7 123 aa8.55□□□□□ -1.04
CSAG1-201ENST00000361211 SMIM11BQ8TCY0 68 aa8.55□□□□□ -1.04
CSAG1-201ENST00000361211 C14orf144Q96I85 54 aa8.55□□□□□ -1.04
CSAG1-201ENST00000361211 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa8.54□□□□□ -1.04
CSAG1-201ENST00000361211 SPATA45Q537H7 98 aa8.54□□□□□ -1.04
CSAG1-201ENST00000361211 A0A1B0GWB2 263 aa8.53□□□□□ -1.04
CSAG1-201ENST00000361211 DLEU1O43261 78 aa8.53□□□□□ -1.04
CSAG1-201ENST00000361211 SPRR1BP22528 89 aa8.53□□□□□ -1.04
CSAG1-201ENST00000361211 C4orf48Q5BLP8 95 aa8.53□□□□□ -1.04
CSAG1-201ENST00000361211 C9orf153Q5TBE3 101 aa8.53□□□□□ -1.04
CSAG1-201ENST00000361211 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa8.53□□□□□ -1.04
CSAG1-201ENST00000361211 HIST1H4GQ99525 98 aa8.52□□□□□ -1.05
CSAG1-201ENST00000361211 C12orf57Q99622 126 aa8.52□□□□□ -1.05
CSAG1-201ENST00000361211 VAMP8Q9BV40 100 aa8.52□□□□□ -1.05
CSAG1-201ENST00000361211 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CSAG1-201ENST00000361211 SPINK1P00995 79 aa8.49□□□□□ -1.05
CSAG1-201ENST00000361211 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CSAG1-201ENST00000361211 C2orf91Q6ZV80 131 aa8.49□□□□□ -1.05
CSAG1-201ENST00000361211 DEFB105AQ8NG35 78 aa8.49□□□□□ -1.05
CSAG1-201ENST00000361211 PYY3Q5JQD4 70 aa8.48□□□□□ -1.05
CSAG1-201ENST00000361211 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa8.47□□□□□ -1.05
CSAG1-201ENST00000361211 TAL2Q16559 108 aa8.47□□□□□ -1.05
CSAG1-201ENST00000361211 SLC25A34Q6PIV7 304 aa8.47□□□□□ -1.05
CSAG1-201ENST00000361211 HIGD1BQ9P298 99 aa8.47□□□□□ -1.05
CSAG1-201ENST00000361211 Q1RN00 199 aa8.46□□□□□ -1.06
CSAG1-201ENST00000361211 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa8.46□□□□□ -1.06
CSAG1-201ENST00000361211 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa8.45□□□□□ -1.06
CSAG1-201ENST00000361211 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa8.45□□□□□ -1.06
CSAG1-201ENST00000361211 SMIM29Q86T20 159 aa8.45□□□□□ -1.06
CSAG1-201ENST00000361211 Q8N377 158 aa8.45□□□□□ -1.06
CSAG1-201ENST00000361211 RPS29P62273 56 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CSAG1-201ENST00000361211 TPRXLQ17RH7 258 aa8.44□□□□□ -1.06
CSAG1-201ENST00000361211 MUC17Q685J3 4493 aa8.44□□□□□ -1.06
CSAG1-201ENST00000361211 CFC1BP0CG36 223 aa8.43□□□□□ -1.06
CSAG1-201ENST00000361211 CFC1P0CG37 223 aa8.43□□□□□ -1.06
CSAG1-201ENST00000361211 LINC00575Q6W349 94 aa8.43□□□□□ -1.06
CSAG1-201ENST00000361211 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
CSAG1-201ENST00000361211 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
CSAG1-201ENST00000361211 VAMP3Q15836 100 aa8.41□□□□□ -1.06
CSAG1-201ENST00000361211 HRCT1Q6UXD1 115 aa8.41□□□□□ -1.06
CSAG1-201ENST00000361211 H7C2G1 150 aa8.4□□□□□ -1.06
CSAG1-201ENST00000361211 SLC25A20O43772 301 aa8.4□□□□□ -1.06
CSAG1-201ENST00000361211 CEND1Q8N111 149 aa8.4□□□□□ -1.06
CSAG1-201ENST00000361211 A0A0B4J2C4 111 aa8.39□□□□□ -1.07
CSAG1-201ENST00000361211 hADV29S1A0JD25 119 aa8.39□□□□□ -1.07
CSAG1-201ENST00000361211 A0A0G2JQZ4 141 aa8.38□□□□□ -1.07
CSAG1-201ENST00000361211 FXYD2P54710 66 aa8.38□□□□□ -1.07
CSAG1-201ENST00000361211 Q6ZQY7 126 aa8.38□□□□□ -1.07
CSAG1-201ENST00000361211 RAB37Q96AX2 223 aa8.38□□□□□ -1.07
CSAG1-201ENST00000361211 CDIP1Q9H305 208 aa8.38□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 489.8 ms