RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352068.5

SNX15-201, Transcript of sorting nexin 15, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SNX15, Length 771 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15-201ENST00000352068 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
SNX15-201ENST00000352068 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.86□□□□□ -1.31
SNX15-201ENST00000352068 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
SNX15-201ENST00000352068 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.86□□□□□ -1.31
SNX15-201ENST00000352068 IFITM1P13164 125 aa6.85□□□□□ -1.31
SNX15-201ENST00000352068 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.85□□□□□ -1.31
SNX15-201ENST00000352068 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.85□□□□□ -1.31
SNX15-201ENST00000352068 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.85□□□□□ -1.31
SNX15-201ENST00000352068 SPANXCQ9NY87 97 aa6.85□□□□□ -1.31
SNX15-201ENST00000352068 SMIM13P0DJ93 91 aa6.84□□□□□ -1.31
SNX15-201ENST00000352068 LINC00158P58513 81 aa6.84□□□□□ -1.31
SNX15-201ENST00000352068 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.84□□□□□ -1.31
SNX15-201ENST00000352068 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.84□□□□□ -1.31
SNX15-201ENST00000352068 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.84□□□□□ -1.31
SNX15-201ENST00000352068 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.84□□□□□ -1.31
SNX15-201ENST00000352068 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.83□□□□□ -1.32
SNX15-201ENST00000352068 C14orf144Q96I85 54 aa6.83□□□□□ -1.32
SNX15-201ENST00000352068 C12orf57Q99622 126 aa6.83□□□□□ -1.32
SNX15-201ENST00000352068 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.83□□□□□ -1.32
SNX15-201ENST00000352068 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.82□□□□□ -1.32
SNX15-201ENST00000352068 NDUFC2O95298 119 aa6.82□□□□□ -1.32
SNX15-201ENST00000352068 PFN2P35080 140 aa6.82□□□□□ -1.32
SNX15-201ENST00000352068 TAL2Q16559 108 aa6.82□□□□□ -1.32
SNX15-201ENST00000352068 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.82□□□□□ -1.32
SNX15-201ENST00000352068 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.82□□□□□ -1.32
SNX15-201ENST00000352068 GAGE2EQ4V326 116 aa6.81□□□□□ -1.32
SNX15-201ENST00000352068 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
SNX15-201ENST00000352068 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.81□□□□□ -1.32
SNX15-201ENST00000352068 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
SNX15-201ENST00000352068 XP32Q5T750 250 aa6.8□□□□□ -1.32
SNX15-201ENST00000352068 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.8□□□□□ -1.32
SNX15-201ENST00000352068 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.8□□□□□ -1.32
SNX15-201ENST00000352068 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.8□□□□□ -1.32
SNX15-201ENST00000352068 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.79□□□□□ -1.32
SNX15-201ENST00000352068 NEBP20929 6669 aa6.78□□□□□ -1.32
SNX15-201ENST00000352068 TSTD3H0UI37 97 aa6.78□□□□□ -1.32
SNX15-201ENST00000352068 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.78□□□□□ -1.32
SNX15-201ENST00000352068 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SNX15-201ENST00000352068 BCE1O60756 84 aa6.77□□□□□ -1.33
SNX15-201ENST00000352068 VPREB1P12018 145 aa6.77□□□□□ -1.33
SNX15-201ENST00000352068 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.77□□□□□ -1.33
SNX15-201ENST00000352068 A0A0U1RRA0 63 aa6.76□□□□□ -1.33
SNX15-201ENST00000352068 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SNX15-201ENST00000352068 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.76□□□□□ -1.33
SNX15-201ENST00000352068 DAND5Q8N907 189 aa6.76□□□□□ -1.33
SNX15-201ENST00000352068 M0R378 163 aa6.75□□□□□ -1.33
SNX15-201ENST00000352068 HSD52Q0P140 79 aa6.75□□□□□ -1.33
SNX15-201ENST00000352068 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.75□□□□□ -1.33
SNX15-201ENST00000352068 HIST1H4GQ99525 98 aa6.75□□□□□ -1.33
SNX15-201ENST00000352068 C22orf24Q9Y442 160 aa6.75□□□□□ -1.33
SNX15-201ENST00000352068 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SNX15-201ENST00000352068 CFC1P0CG37 223 aa6.74□□□□□ -1.33
SNX15-201ENST00000352068 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.74□□□□□ -1.33
SNX15-201ENST00000352068 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SNX15-201ENST00000352068 CEND1Q8N111 149 aa6.73□□□□□ -1.33
SNX15-201ENST00000352068 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.72□□□□□ -1.33
SNX15-201ENST00000352068 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.72□□□□□ -1.33
SNX15-201ENST00000352068 A6NJY4 79 aa6.72□□□□□ -1.33
SNX15-201ENST00000352068 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.72□□□□□ -1.33
SNX15-201ENST00000352068 Q8NDZ9 215 aa6.72□□□□□ -1.33
SNX15-201ENST00000352068 PRO1933Q9H354 126 aa6.72□□□□□ -1.33
SNX15-201ENST00000352068 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.71□□□□□ -1.34
SNX15-201ENST00000352068 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.71□□□□□ -1.34
SNX15-201ENST00000352068 IGKV2D-28P01615 120 aa6.71□□□□□ -1.34
SNX15-201ENST00000352068 IGLV6-57P01721 117 aa6.71□□□□□ -1.34
SNX15-201ENST00000352068 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.71□□□□□ -1.34
SNX15-201ENST00000352068 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.71□□□□□ -1.34
SNX15-201ENST00000352068 TMEM126AQ9H061 195 aa6.71□□□□□ -1.34
SNX15-201ENST00000352068 A0A1B0GWB2 263 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX15-201ENST00000352068 A4D1N5 150 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX15-201ENST00000352068 LINC00167Q96N53 147 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX15-201ENST00000352068 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX15-201ENST00000352068 A0A0B4J2C4 111 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX15-201ENST00000352068 M0R143 59 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX15-201ENST00000352068 DDTP30046 118 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX15-201ENST00000352068 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX15-201ENST00000352068 PCOTHQ58A44 107 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX15-201ENST00000352068 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX15-201ENST00000352068 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX15-201ENST00000352068 SPRR1AP35321 89 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX15-201ENST00000352068 NPC2P61916 151 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX15-201ENST00000352068 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX15-201ENST00000352068 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX15-201ENST00000352068 PRYO14603 147 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX15-201ENST00000352068 UBE2AP49459 152 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX15-201ENST00000352068 FXYD2P54710 66 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX15-201ENST00000352068 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX15-201ENST00000352068 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX15-201ENST00000352068 NCR3O14931 201 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX15-201ENST00000352068 LINC00846Q9NV44 126 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX15-201ENST00000352068 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX15-201ENST00000352068 A6NDN8 102 aa6.63□□□□□ -1.35
SNX15-201ENST00000352068 SPINK1P00995 79 aa6.63□□□□□ -1.35
SNX15-201ENST00000352068 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.62□□□□□ -1.35
SNX15-201ENST00000352068 RAB37Q96AX2 223 aa6.62□□□□□ -1.35
SNX15-201ENST00000352068 GAGE10A6NGK3 116 aa6.61□□□□□ -1.35
SNX15-201ENST00000352068 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.61□□□□□ -1.35
SNX15-201ENST00000352068 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
SNX15-201ENST00000352068 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.61□□□□□ -1.35
SNX15-201ENST00000352068 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms