RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312060.9

CTU2-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene CTU2, Length 1,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-201ENST00000312060 PRYO14603 147 aa13.81□□□□□ -0.2
CTU2-201ENST00000312060 TRIAP1O43715 76 aa13.81□□□□□ -0.2
CTU2-201ENST00000312060 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP13.81□□□□□ -0.2
CTU2-201ENST00000312060 C6orf99Q4VX62 202 aa13.81□□□□□ -0.2
CTU2-201ENST00000312060 REG3GQ6UW15 175 aa13.79□□□□□ -0.2
CTU2-201ENST00000312060 DIRC1Q969H9 104 aa13.79□□□□□ -0.2
CTU2-201ENST00000312060 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
CTU2-201ENST00000312060 COX6CP09669 75 aa13.77□□□□□ -0.21
CTU2-201ENST00000312060 SCGB1C2P0DMR2 95 aa13.77□□□□□ -0.21
CTU2-201ENST00000312060 SPRR1AP35321 89 aa13.76□□□□□ -0.21
CTU2-201ENST00000312060 XGP55808 180 aa13.76□□□□□ -0.21
CTU2-201ENST00000312060 A0A1W2PPM0 123 aa13.75□□□□□ -0.21
CTU2-201ENST00000312060 VAMP3Q15836 100 aa13.75□□□□□ -0.21
CTU2-201ENST00000312060 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa13.72□□□□□ -0.21
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
CTU2-201ENST00000312060 H0YGX0 51 aa13.72□□□□□ -0.21
CTU2-201ENST00000312060 FABP2P12104 132 aa13.72□□□□□ -0.21
CTU2-201ENST00000312060 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa13.72□□□□□ -0.21
CTU2-201ENST00000312060 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa13.71□□□□□ -0.21
CTU2-201ENST00000312060 COX7BP24311 80 aa13.71□□□□□ -0.21
CTU2-201ENST00000312060 LYRM7Q5U5X0 104 aa13.71□□□□□ -0.21
CTU2-201ENST00000312060 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
CTU2-201ENST00000312060 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa13.69□□□□□ -0.22
CTU2-201ENST00000312060 CLEC2BQ92478 149 aa13.69□□□□□ -0.22
CTU2-201ENST00000312060 B5MCH6 92 aa13.68□□□□□ -0.22
CTU2-201ENST00000312060 BCE1O60756 84 aa13.67□□□□□ -0.22
CTU2-201ENST00000312060 C1orf137Q5JT78 98 aa13.66□□□□□ -0.22
CTU2-201ENST00000312060 Q6ZRX8 168 aa13.66□□□□□ -0.22
CTU2-201ENST00000312060 LINC00528Q8N1L1 170 aa13.66□□□□□ -0.22
CTU2-201ENST00000312060 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa13.64□□□□□ -0.23
CTU2-201ENST00000312060 TCL1BO95988 128 aa13.64□□□□□ -0.23
CTU2-201ENST00000312060 PRLHP81277 87 aa13.64□□□□□ -0.23
CTU2-201ENST00000312060 FAM218AQ96MZ4 157 aa13.64□□□□□ -0.23
CTU2-201ENST00000312060 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa13.63□□□□□ -0.23
CTU2-201ENST00000312060 LINC00575Q6W349 94 aa13.63□□□□□ -0.23
CTU2-201ENST00000312060 SPCS1Q9Y6A9 102 aa13.63□□□□□ -0.23
CTU2-201ENST00000312060 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
CTU2-201ENST00000312060 UBE2AP49459 152 aa13.63□□□□□ -0.23
CTU2-201ENST00000312060 CDK2AP2O75956 126 aa13.62□□□□□ -0.23
CTU2-201ENST00000312060 SLC25A20O43772 301 aa13.61□□□□□ -0.23
CTU2-201ENST00000312060 LST1O00453 97 aa13.6□□□□□ -0.23
CTU2-201ENST00000312060 ATXN8Q156A1 80 aa13.6□□□□□ -0.23
CTU2-201ENST00000312060 Q9BRP9 147 aa13.6□□□□□ -0.23
CTU2-201ENST00000312060 FAT1Q14517 4588 aa13.6□□□□□ -0.23
CTU2-201ENST00000312060 H0Y9J4 135 aa13.59□□□□□ -0.23
CTU2-201ENST00000312060 INAFM2P0DMQ5 153 aa13.59□□□□□ -0.23
CTU2-201ENST00000312060 RYR1P21817 5038 aa13.59□□□□□ -0.23
CTU2-201ENST00000312060 hADV29S1A0JD25 119 aa13.59□□□□□ -0.23
CTU2-201ENST00000312060 SNCGO76070 127 aa13.59□□□□□ -0.23
CTU2-201ENST00000312060 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa13.59□□□□□ -0.23
CTU2-201ENST00000312060 A0A1B0GX51 115 aa13.58□□□□□ -0.24
CTU2-201ENST00000312060 HSPG2P98160 4391 aa13.58□□□□□ -0.24
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa13.57□□□□□ -0.24
CTU2-201ENST00000312060 K7EP34 96 aa13.56□□□□□ -0.24
CTU2-201ENST00000312060 IGLV7-43P04211 117 aa13.56□□□□□ -0.24
CTU2-201ENST00000312060 HIGD2AQ9BW72 106 aa13.56□□□□□ -0.24
CTU2-201ENST00000312060 SMCR5Q8TEV8 140 aa13.56□□□□□ -0.24
CTU2-201ENST00000312060 H3BMG7 143 aa13.55□□□□□ -0.24
CTU2-201ENST00000312060 TRACP01848 142 aa13.55□□□□□ -0.24
CTU2-201ENST00000312060 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa13.55□□□□□ -0.24
CTU2-201ENST00000312060 ZNF861PO60384 105 aa13.54□□□□□ -0.24
CTU2-201ENST00000312060 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
CTU2-201ENST00000312060 DNAL4O96015 105 aa13.53□□□□□ -0.24
CTU2-201ENST00000312060 KIAA1109Q2LD37 5005 aa13.53□□□□□ -0.24
CTU2-201ENST00000312060 ERC2-IT1O76042 136 aa13.52□□□□□ -0.25
CTU2-201ENST00000312060 Q6ZQY7 126 aa13.5□□□□□ -0.25
CTU2-201ENST00000312060 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
CTU2-201ENST00000312060 UBE2V1Q13404 147 aa13.47□□□□□ -0.25
CTU2-201ENST00000312060 C9JAW5 83 aa13.46□□□□□ -0.26
CTU2-201ENST00000312060 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa13.46□□□□□ -0.26
CTU2-201ENST00000312060 FAM229AH3BQW9 127 aa13.45□□□□□ -0.26
CTU2-201ENST00000312060 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
CTU2-201ENST00000312060 ORMDL1Q9P0S3 153 aa13.44□□□□□ -0.26
CTU2-201ENST00000312060 MTURNQ8N3F0 131 aa13.43□□□□□ -0.26
CTU2-201ENST00000312060 OCIAD2Q56VL3 154 aa13.42□□□□□ -0.26
CTU2-201ENST00000312060 DEFB105AQ8NG35 78 aa13.42□□□□□ -0.26
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
CTU2-201ENST00000312060 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
CTU2-201ENST00000312060 BAALC-AS2P0C853 105 aa13.4□□□□□ -0.26
CTU2-201ENST00000312060 BIRC6Q9NR09 4857 aa13.4□□□□□ -0.26
CTU2-201ENST00000312060 GHRHP01286 108 aa13.4□□□□□ -0.26
CTU2-201ENST00000312060 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
CTU2-201ENST00000312060 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa13.37□□□□□ -0.27
CTU2-201ENST00000312060 Q5VSD8 79 aa13.37□□□□□ -0.27
CTU2-201ENST00000312060 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa13.37□□□□□ -0.27
CTU2-201ENST00000312060 Q8N377 158 aa13.37□□□□□ -0.27
CTU2-201ENST00000312060 PRO0461Q9UI25 63 aa13.37□□□□□ -0.27
CTU2-201ENST00000312060 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
CTU2-201ENST00000312060 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa13.36□□□□□ -0.27
CTU2-201ENST00000312060 H3BQ85 93 aa13.36□□□□□ -0.27
CTU2-201ENST00000312060 GAGE2AQ6NT46 116 aa13.36□□□□□ -0.27
CTU2-201ENST00000312060 SPINK6Q6UWN8 80 aa13.36□□□□□ -0.27
CTU2-201ENST00000312060 SPRR4Q96PI1 79 aa13.36□□□□□ -0.27
CTU2-201ENST00000312060 H3BT86 120 aa13.35□□□□□ -0.27
CTU2-201ENST00000312060 F8W1H4 67 aa13.34□□□□□ -0.27
CTU2-201ENST00000312060 Q8N1X5 172 aa13.34□□□□□ -0.27
CTU2-201ENST00000312060 ANKRD29Q8N6D5 301 aa13.34□□□□□ -0.27
CTU2-201ENST00000312060 PPDPFLQ8WWR9 84 aa13.34□□□□□ -0.27
CTU2-201ENST00000312060 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.1 ms