RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311160.13

TNS3-201, Transcript of tensin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS3, Length 7,618 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3-201ENST00000311160 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
TNS3-201ENST00000311160 CDSNQ15517 529 aa7.16□□□□□ -1.26
TNS3-201ENST00000311160 ABCA12Q86UK0 2595 aa7.16□□□□□ -1.26
TNS3-201ENST00000311160 A0A0G2JQZ4 141 aa7.16□□□□□ -1.26
TNS3-201ENST00000311160 A0A1W2PNN7 141 aa7.16□□□□□ -1.26
TNS3-201ENST00000311160 Q6ZPA2 131 aa7.15□□□□□ -1.26
TNS3-201ENST00000311160 PRR26Q8N8Z3 221 aa7.15□□□□□ -1.27
TNS3-201ENST00000311160 IGFL1Q6UW32 110 aa7.14□□□□□ -1.27
TNS3-201ENST00000311160 ZNF861PO60384 105 aa7.14□□□□□ -1.27
TNS3-201ENST00000311160 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
TNS3-201ENST00000311160 A0A1B0GU33 70 aa7.13□□□□□ -1.27
TNS3-201ENST00000311160 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.12□□□□□ -1.27
TNS3-201ENST00000311160 UTRNP46939 3433 aa7.12□□□□□ -1.27
TNS3-201ENST00000311160 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa7.11□□□□□ -1.27
TNS3-201ENST00000311160 MTORP42345 2549 aa7.11□□□□□ -1.27
TNS3-201ENST00000311160 CENPFP49454 3210 aa7.1□□□□□ -1.27
TNS3-201ENST00000311160 EPG5Q9HCE0 2579 aa7.1□□□□□ -1.27
TNS3-201ENST00000311160 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.09□□□□□ -1.27
TNS3-201ENST00000311160 LITAFQ99732 161 aa7.09□□□□□ -1.27
TNS3-201ENST00000311160 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.09□□□□□ -1.27
TNS3-201ENST00000311160 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
TNS3-201ENST00000311160 R4GN34 69 aa7.08□□□□□ -1.28
TNS3-201ENST00000311160 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.07□□□□□ -1.28
TNS3-201ENST00000311160 S4R3F8 94 aa7.07□□□□□ -1.28
TNS3-201ENST00000311160 Q5VSD8 79 aa7.06□□□□□ -1.28
TNS3-201ENST00000311160 H3BNG1 76 aa7.06□□□□□ -1.28
TNS3-201ENST00000311160 C15orf56Q8N910 161 aa7.06□□□□□ -1.28
TNS3-201ENST00000311160 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
TNS3-201ENST00000311160 EP400Q96L91 3159 aa7.05□□□□□ -1.28
TNS3-201ENST00000311160 SPTBN4Q9H254 2564 aa7.04□□□□□ -1.28
TNS3-201ENST00000311160 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
TNS3-201ENST00000311160 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa7.04□□□□□ -1.28
TNS3-201ENST00000311160 POLQO75417 2590 aa7.03□□□□□ -1.28
TNS3-201ENST00000311160 PCSK5Q92824 1860 aa7.03□□□□□ -1.28
TNS3-201ENST00000311160 CSAG1Q6PB30 78 aa7.03□□□□□ -1.28
TNS3-201ENST00000311160 IGLV7-43P04211 117 aa7.03□□□□□ -1.28
TNS3-201ENST00000311160 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
TNS3-201ENST00000311160 A0A096LNJ9 63 aa7.02□□□□□ -1.29
TNS3-201ENST00000311160 LINC00310P59036 64 aa7.01□□□□□ -1.29
TNS3-201ENST00000311160 DMAC1Q96GE9 116 aa7□□□□□ -1.29
TNS3-201ENST00000311160 H7BZZ5 65 aa7□□□□□ -1.29
TNS3-201ENST00000311160 A0A087WTM6 91 aa6.99□□□□□ -1.29
TNS3-201ENST00000311160 PRAC1Q96KF2 57 aa6.97□□□□□ -1.29
TNS3-201ENST00000311160 Q8NAQ8 132 aa6.97□□□□□ -1.29
TNS3-201ENST00000311160 USP24Q9UPU5 2620 aa6.97□□□□□ -1.29
TNS3-201ENST00000311160 PCNTO95613 3336 aa6.97□□□□□ -1.29
TNS3-201ENST00000311160 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
TNS3-201ENST00000311160 Q8N377 158 aa6.96□□□□□ -1.29
TNS3-201ENST00000311160 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.95□□□□□ -1.3
TNS3-201ENST00000311160 CRIP3Q6Q6R5 217 aa6.94□□□□□ -1.3
TNS3-201ENST00000311160 DNAH12Q6ZR08 3092 aa6.93□□□□□ -1.3
TNS3-201ENST00000311160 BPTFQ12830 3046 aa6.93□□□□□ -1.3
TNS3-201ENST00000311160 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.92□□□□□ -1.3
TNS3-201ENST00000311160 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
TNS3-201ENST00000311160 IGF2RP11717 2491 aa6.91□□□□□ -1.3
TNS3-201ENST00000311160 ROMO1P60602 79 aa6.9□□□□□ -1.3
TNS3-201ENST00000311160 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
TNS3-201ENST00000311160 KLKP1Q107X0 134 aa6.9□□□□□ -1.3
TNS3-201ENST00000311160 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.9□□□□□ -1.31
TNS3-201ENST00000311160 M0QZ58 72 aa6.9□□□□□ -1.31
TNS3-201ENST00000311160 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.9□□□□□ -1.31
TNS3-201ENST00000311160 SPRR4Q96PI1 79 aa6.89□□□□□ -1.31
TNS3-201ENST00000311160 A0A1W2PPR1 153 aa6.89□□□□□ -1.31
TNS3-201ENST00000311160 COX8CQ7Z4L0 72 aa6.89□□□□□ -1.31
TNS3-201ENST00000311160 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.87□□□□□ -1.31
TNS3-201ENST00000311160 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
TNS3-201ENST00000311160 PRO0461Q9UI25 63 aa6.86□□□□□ -1.31
TNS3-201ENST00000311160 K7EIL1 84 aa6.85□□□□□ -1.31
TNS3-201ENST00000311160 C5orf42Q9H799 3197 aa6.83□□□□□ -1.32
TNS3-201ENST00000311160 KLK9Q2XQG4 91 aa6.83□□□□□ -1.32
TNS3-201ENST00000311160 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
TNS3-201ENST00000311160 KRTAP10-11P60412 298 aa6.81□□□□□ -1.32
TNS3-201ENST00000311160 A0A1W2PNM2 257 aa6.81□□□□□ -1.32
TNS3-201ENST00000311160 LINC01546A6NGU7 62 aa6.8□□□□□ -1.32
TNS3-201ENST00000311160 FASNP49327 2511 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
TNS3-201ENST00000311160 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.79□□□□□ -1.32
TNS3-201ENST00000311160 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
TNS3-201ENST00000311160 CHD8Q9HCK8 2581 aa6.77□□□□□ -1.33
TNS3-201ENST00000311160 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
TNS3-201ENST00000311160 CEP350Q5VT06 3117 aa6.77□□□□□ -1.33
TNS3-201ENST00000311160 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
TNS3-201ENST00000311160 Q75L30 129 aa6.76□□□□□ -1.33
TNS3-201ENST00000311160 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
TNS3-201ENST00000311160 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.76□□□□□ -1.33
TNS3-201ENST00000311160 TNP2Q05952 138 aa6.75□□□□□ -1.33
TNS3-201ENST00000311160 COL4A2P08572 1712 aa6.75□□□□□ -1.33
TNS3-201ENST00000311160 XIRP2A4UGR9 3374 aa6.75□□□□□ -1.33
TNS3-201ENST00000311160 CASC10Q5T4H9 136 aa6.74□□□□□ -1.33
TNS3-201ENST00000311160 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.74□□□□□ -1.33
TNS3-201ENST00000311160 C10orf142B7Z368 130 aa6.71□□□□□ -1.34
TNS3-201ENST00000311160 Q8NDZ9 215 aa6.71□□□□□ -1.34
TNS3-201ENST00000311160 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TNS3-201ENST00000311160 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.67□□□□□ -1.34
TNS3-201ENST00000311160 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
TNS3-201ENST00000311160 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
TNS3-201ENST00000311160 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.65□□□□□ -1.34
TNS3-201ENST00000311160 PRR34Q9NV39 138 aa6.65□□□□□ -1.35
TNS3-201ENST00000311160 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
TNS3-201ENST00000311160 STAB1Q9NY15 2570 aa6.62□□□□□ -1.35
TNS3-201ENST00000311160 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.5 ms