RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 ZNF575Q86XF7 245 aa10.52□□□□□ -0.72
CTIF-201ENST00000256413 CHTF8P0CG12 524 aa10.52□□□□□ -0.72
CTIF-201ENST00000256413 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa10.5□□□□□ -0.73
CTIF-201ENST00000256413 Q96NJ1 140 aa10.5□□□□□ -0.73
CTIF-201ENST00000256413 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa10.49□□□□□ -0.73
CTIF-201ENST00000256413 C15orf56Q8N910 161 aa10.48□□□□□ -0.73
CTIF-201ENST00000256413 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
CTIF-201ENST00000256413 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
CTIF-201ENST00000256413 DNAH10OSP0CZ25 163 aa10.46□□□□□ -0.73
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CTIF-201ENST00000256413 Q5VV11 94 aa10.42□□□□□ -0.74
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CTIF-201ENST00000256413 TYMSOSQ8TAI1 123 aa10.37□□□□□ -0.75
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CTIF-201ENST00000256413 A0A0D9SG42 100 aa10.21□□□□□ -0.77
CTIF-201ENST00000256413 MTORP42345 2549 aa10.21□□□□□ -0.78
CTIF-201ENST00000256413 CEP295Q9C0D2 2601 aa10.19□□□□□ -0.78
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CTIF-201ENST00000256413 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
CTIF-201ENST00000256413 HRES1P13985 223 aa10.19□□□□□ -0.78
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CTIF-201ENST00000256413 C9orf92A6NGG3 77 aa10.07□□□□□ -0.8
CTIF-201ENST00000256413 POLQO75417 2590 aa10.07□□□□□ -0.8
CTIF-201ENST00000256413 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa10.06□□□□□ -0.8
CTIF-201ENST00000256413 LINC00304Q8N9R0 145 aa10.06□□□□□ -0.8
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CTIF-201ENST00000256413 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa10.02□□□□□ -0.8
CTIF-201ENST00000256413 ACANP16112 2415 aa10.02□□□□□ -0.81
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CTIF-201ENST00000256413 LINC00472Q9H8W2 130 aa9.98□□□□□ -0.81
CTIF-201ENST00000256413 A0A087WTM6 91 aa9.97□□□□□ -0.81
CTIF-201ENST00000256413 A0A0A0MQY5 61 aa9.96□□□□□ -0.81
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP10-11P60412 298 aa9.95□□□□□ -0.82
CTIF-201ENST00000256413 SPTBN4Q9H254 2564 aa9.93□□□□□ -0.82
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CTIF-201ENST00000256413 Q5W150 140 aa9.9□□□□□ -0.82
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CTIF-201ENST00000256413 M0R2T5 61 aa9.82□□□□□ -0.84
CTIF-201ENST00000256413 ROMO1P60602 79 aa9.81□□□□□ -0.84
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CTIF-201ENST00000256413 Q6ZR54 194 aa9.78□□□□□ -0.84
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CTIF-201ENST00000256413 SPATA8Q6RVD6 105 aa9.77□□□□□ -0.84
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CTIF-201ENST00000256413 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa9.75□□□□□ -0.85
CTIF-201ENST00000256413 RPL37P61927 97 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
CTIF-201ENST00000256413 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
CTIF-201ENST00000256413 BPTFQ12830 3046 aa9.73□□□□□ -0.85
CTIF-201ENST00000256413 Q6ZSA8 131 aa9.72□□□□□ -0.85
CTIF-201ENST00000256413 LCE6AA0A183 80 aa9.71□□□□□ -0.86
CTIF-201ENST00000256413 A8MU10 97 aa9.69□□□□□ -0.86
CTIF-201ENST00000256413 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa9.69□□□□□ -0.86
CTIF-201ENST00000256413 USP24Q9UPU5 2620 aa9.67□□□□□ -0.86
CTIF-201ENST00000256413 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa9.67□□□□□ -0.86
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