RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
SPCS1-201ENST00000233025 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa9.51□□□□□ -0.89
SPCS1-201ENST00000233025 SMIM1B2RUZ4 78 aa9.51□□□□□ -0.89
SPCS1-201ENST00000233025 M0QXV9 152 aa9.51□□□□□ -0.89
SPCS1-201ENST00000233025 H3BS24 57 aa9.5□□□□□ -0.89
SPCS1-201ENST00000233025 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SPCS1-201ENST00000233025 LINC01561Q8N1V8 128 aa9.5□□□□□ -0.89
SPCS1-201ENST00000233025 A0A0J9YXY3 114 aa9.49□□□□□ -0.89
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1B0GV90 55 aa9.49□□□□□ -0.89
SPCS1-201ENST00000233025 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa9.49□□□□□ -0.89
SPCS1-201ENST00000233025 SMIM13P0DJ93 91 aa9.49□□□□□ -0.89
SPCS1-201ENST00000233025 HERV-K104P63124 156 aa9.49□□□□□ -0.89
SPCS1-201ENST00000233025 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa9.49□□□□□ -0.89
SPCS1-201ENST00000233025 TYMSOSQ8TAI1 123 aa9.49□□□□□ -0.89
SPCS1-201ENST00000233025 COX7B2Q8TF08 81 aa9.49□□□□□ -0.89
SPCS1-201ENST00000233025 SFTA2Q6UW10 78 aa9.48□□□□□ -0.89
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF861PO60384 105 aa9.47□□□□□ -0.89
SPCS1-201ENST00000233025 TIMM17BO60830 172 aa9.47□□□□□ -0.89
SPCS1-201ENST00000233025 PRSS2P07478 247 aa9.47□□□□□ -0.89
SPCS1-201ENST00000233025 FXYD2P54710 66 aa9.47□□□□□ -0.89
SPCS1-201ENST00000233025 Q6ZVH6 145 aa9.47□□□□□ -0.89
SPCS1-201ENST00000233025 TOMM7Q9P0U1 55 aa9.47□□□□□ -0.89
SPCS1-201ENST00000233025 COPS9Q8WXC6 57 aa9.46□□□□□ -0.9
SPCS1-201ENST00000233025 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
SPCS1-201ENST00000233025 UBE2BP63146 152 aa9.45□□□□□ -0.9
SPCS1-201ENST00000233025 RPL24P83731 157 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
SPCS1-201ENST00000233025 MEIG1Q5JSS6 88 aa9.45□□□□□ -0.9
SPCS1-201ENST00000233025 TAX1BP3O14907 124 aa9.44□□□□□ -0.9
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa9.44□□□□□ -0.9
SPCS1-201ENST00000233025 C6orf226Q5I0X4 101 aa9.44□□□□□ -0.9
SPCS1-201ENST00000233025 SPANXDQ9BXN6 97 aa9.44□□□□□ -0.9
SPCS1-201ENST00000233025 PPDPFQ9H3Y8 114 aa9.44□□□□□ -0.9
SPCS1-201ENST00000233025 SPANXCQ9NY87 97 aa9.44□□□□□ -0.9
SPCS1-201ENST00000233025 IFITM1P13164 125 aa9.43□□□□□ -0.9
SPCS1-201ENST00000233025 Q8IZM0 81 aa9.43□□□□□ -0.9
SPCS1-201ENST00000233025 CFC1BP0CG36 223 aa9.42□□□□□ -0.9
SPCS1-201ENST00000233025 MT1HP80294 61 aa9.42□□□□□ -0.9
SPCS1-201ENST00000233025 RAB37Q96AX2 223 aa9.42□□□□□ -0.9
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
SPCS1-201ENST00000233025 CXCL5P42830 114 aa9.41□□□□□ -0.9
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa9.41□□□□□ -0.9
SPCS1-201ENST00000233025 LCE1DQ5T752 114 aa9.41□□□□□ -0.9
SPCS1-201ENST00000233025 C9orf118A6NHY6 69 aa9.4□□□□□ -0.9
SPCS1-201ENST00000233025 CKS1BP61024 79 aa9.4□□□□□ -0.9
SPCS1-201ENST00000233025 MUSTN1Q8IVN3 82 aa9.4□□□□□ -0.9
SPCS1-201ENST00000233025 LINC00304Q8N9R0 145 aa9.4□□□□□ -0.9
SPCS1-201ENST00000233025 XAGE1AQ9HD64 81 aa9.4□□□□□ -0.9
SPCS1-201ENST00000233025 VAMP3Q15836 100 aa9.39□□□□□ -0.91
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa9.39□□□□□ -0.91
SPCS1-201ENST00000233025 C22orf24Q9Y442 160 aa9.39□□□□□ -0.91
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1B0GWB2 263 aa9.38□□□□□ -0.91
SPCS1-201ENST00000233025 LITAFQ99732 161 aa9.38□□□□□ -0.91
SPCS1-201ENST00000233025 H3BUT2 72 aa9.37□□□□□ -0.91
SPCS1-201ENST00000233025 A4D1N5 150 aa9.36□□□□□ -0.91
SPCS1-201ENST00000233025 K7ERJ3 54 aa9.36□□□□□ -0.91
SPCS1-201ENST00000233025 LINC00158P58513 81 aa9.36□□□□□ -0.91
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
SPCS1-201ENST00000233025 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa9.36□□□□□ -0.91
SPCS1-201ENST00000233025 ANAPC11Q9NYG5 84 aa9.36□□□□□ -0.91
SPCS1-201ENST00000233025 A0A0U1RRA0 63 aa9.35□□□□□ -0.91
SPCS1-201ENST00000233025 A0A0B4J2C4 111 aa9.34□□□□□ -0.91
SPCS1-201ENST00000233025 FABP2P12104 132 aa9.34□□□□□ -0.91
SPCS1-201ENST00000233025 NPC2P61916 151 aa9.34□□□□□ -0.91
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa9.34□□□□□ -0.91
SPCS1-201ENST00000233025 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
SPCS1-201ENST00000233025 LINC00308Q8TCZ7 52 aa9.34□□□□□ -0.91
SPCS1-201ENST00000233025 PRO1854Q9UHT4 67 aa9.34□□□□□ -0.91
SPCS1-201ENST00000233025 CFC1P0CG37 223 aa9.33□□□□□ -0.92
SPCS1-201ENST00000233025 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
SPCS1-201ENST00000233025 LYRM7Q5U5X0 104 aa9.33□□□□□ -0.92
SPCS1-201ENST00000233025 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa9.33□□□□□ -0.92
SPCS1-201ENST00000233025 ERG28Q9UKR5 140 aa9.33□□□□□ -0.92
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1W2PPM0 123 aa9.32□□□□□ -0.92
SPCS1-201ENST00000233025 DAND5Q8N907 189 aa9.32□□□□□ -0.92
SPCS1-201ENST00000233025 GAGE10A6NGK3 116 aa9.31□□□□□ -0.92
SPCS1-201ENST00000233025 PFN2P35080 140 aa9.31□□□□□ -0.92
SPCS1-201ENST00000233025 COX17Q14061 63 aa9.31□□□□□ -0.92
SPCS1-201ENST00000233025 LINC00337Q8N6G1 96 aa9.31□□□□□ -0.92
SPCS1-201ENST00000233025 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
SPCS1-201ENST00000233025 SSPOA2VEC9 5147 aa9.3□□□□□ -0.92
SPCS1-201ENST00000233025 BCE1O60756 84 aa9.3□□□□□ -0.92
SPCS1-201ENST00000233025 UBE2V1Q13404 147 aa9.3□□□□□ -0.92
SPCS1-201ENST00000233025 Q1RN00 199 aa9.3□□□□□ -0.92
SPCS1-201ENST00000233025 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa9.3□□□□□ -0.92
SPCS1-201ENST00000233025 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa9.29□□□□□ -0.92
SPCS1-201ENST00000233025 RPL28P46779 137 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SPCS1-201ENST00000233025 LINC00167Q96N53 147 aa9.29□□□□□ -0.92
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa9.29□□□□□ -0.92
SPCS1-201ENST00000233025 SPCS1Q9Y6A9 102 aa9.29□□□□□ -0.92
SPCS1-201ENST00000233025 PSMB2P49721 201 aa9.28□□□□□ -0.92
SPCS1-201ENST00000233025 FAM229BQ4G0N7 80 aa9.28□□□□□ -0.92
SPCS1-201ENST00000233025 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa9.28□□□□□ -0.92
SPCS1-201ENST00000233025 RPL37AP8A6NKH3 93 aa9.27□□□□□ -0.93
SPCS1-201ENST00000233025 K7EP34 96 aa9.27□□□□□ -0.93
SPCS1-201ENST00000233025 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa9.26□□□□□ -0.93
SPCS1-201ENST00000233025 SCGB1C2P0DMR2 95 aa9.26□□□□□ -0.93
SPCS1-201ENST00000233025 ARL17AQ8IVW1 177 aa9.26□□□□□ -0.93
SPCS1-201ENST00000233025 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa9.26□□□□□ -0.93
SPCS1-201ENST00000233025 H7C2G1 150 aa9.25□□□□□ -0.93
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