RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616		M0QY20	66 aa		3.09	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	UBE2L6	O14933	153 aa		3.09	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	SEC11A	P67812	179 aa		3.09	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		3.09	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		3.09	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		3.09	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	SPANXC	Q9NY87	97 aa		3.09	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A0B4J2C4	111 aa		3.08	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		3.08	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		3.08	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616		A8MTW9	85 aa		3.08	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616		F8VRH5	84 aa		3.08	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	DSCR10	P59022	87 aa		3.08	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	HSD52	Q0P140	79 aa		3.08	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF56	Q15929	161 aa		3.08	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		3.08	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		3.08	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM141	Q96I45	108 aa		3.08	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	HIGD1B	Q9P298	99 aa		3.08	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		3.08	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	IGIP	A6NJ69	53 aa		3.08	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616		A8MWV9	139 aa		3.08	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616		I3L3M4	83 aa		3.08	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616		M0R2P5	195 aa		3.08	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	TAX1BP3	O14907	124 aa		3.08	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	LEPROT	O15243	131 aa		3.08	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	RRN3P1	Q2M238	152 aa		3.08	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		3.08	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		3.08	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		3.07	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616		H3BRM9	83 aa		3.07	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	SMIM13	P0DJ93	91 aa		3.07	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	RHOH	Q15669	191 aa		3.07	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		3.07	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	VPS25	Q9BRG1	176 aa		3.07	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	CST9L	Q9H4G1	147 aa		3.07	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	COL7A1	Q02388	2944 aa		3.06	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		3.06	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		3.06	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		3.06	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616		M0R378	163 aa		3.06	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	CCL25	O15444	150 aa		3.06	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		3.06	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		3.06	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		3.06	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		3.06	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	FBN3	Q75N90	2809 aa		3.05	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	C16orf90	A8MZG2	172 aa		3.05	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616		H3BQ85	93 aa		3.05	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616		P0DMU3	169 aa		3.05	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM231A	P0DMU4	169 aa		3.05	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM231C	P0DMU5	169 aa		3.05	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	LINC01554	Q52M75	96 aa		3.05	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		3.05	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	PRR15	Q8IV56	129 aa		3.05	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		3.05	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		3.05	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		3.05	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616		C9JAW5	83 aa		3.04	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	IGHV3-53	P01767	116 aa		3.04	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	AZU1	P20160	251 aa		3.04	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		3.04	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	RAB37	Q96AX2	223 aa		3.04	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		3.04	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		3.04	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	C11orf86	A6NJI1	115 aa		3.04	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF815P	A8K554	130 aa		3.04	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616		H3BUT2	72 aa		3.04	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	IGLV7-43	P04211	117 aa		3.04	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		3.04	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		3.04	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	MUC7	Q8TAX7	377 aa		3.04	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		3.04	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	MUC4	Q99102	2169 aa		3.04	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	FABP2	P12104	132 aa		3.03	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	FXYD2	P54710	66 aa		3.03	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	KRTAP10-5	P60370	271 aa		3.03	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616		Q5XG85	94 aa		3.03	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
EFHC1-223	ENST00000636616	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.93
EFHC1-223	ENST00000636616	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		3.02	□□□□□ -1.93
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A1W2PPM0	123 aa		3.02	□□□□□ -1.93
EFHC1-223	ENST00000636616		J3QQQ9	107 aa		3.02	□□□□□ -1.93
EFHC1-223	ENST00000636616	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
EFHC1-223	ENST00000636616	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		3.02	□□□□□ -1.93
EFHC1-223	ENST00000636616	AMELX	Q99217	191 aa		3.02	□□□□□ -1.93
EFHC1-223	ENST00000636616	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
EFHC1-223	ENST00000636616	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
EFHC1-223	ENST00000636616	TG	P01266	2768 aa		3.01	□□□□□ -1.93
EFHC1-223	ENST00000636616	AGRN	O00468	2067 aa		3.01	□□□□□ -1.93
EFHC1-223	ENST00000636616	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		3.01	□□□□□ -1.93
EFHC1-223	ENST00000636616		K7EIL1	84 aa		3.01	□□□□□ -1.93
EFHC1-223	ENST00000636616		K7EP34	96 aa		3.01	□□□□□ -1.93
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		3.01	□□□□□ -1.93
EFHC1-223	ENST00000636616		Q6ZTI0	123 aa		3.01	□□□□□ -1.93
EFHC1-223	ENST00000636616	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93

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