RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618698.4

CPEB1-217, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CPEB1, Length 2,885 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB1-217ENST00000618698 COX7B2Q8TF08 81 aa6.62□□□□□ -1.35
CPEB1-217ENST00000618698 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
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CPEB1-217ENST00000618698 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.62□□□□□ -1.35
CPEB1-217ENST00000618698 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.62□□□□□ -1.35
CPEB1-217ENST00000618698 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.62□□□□□ -1.35
CPEB1-217ENST00000618698 X6R8D5 127 aa6.62□□□□□ -1.35
CPEB1-217ENST00000618698 H7BZZ5 65 aa6.61□□□□□ -1.35
CPEB1-217ENST00000618698 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.61□□□□□ -1.35
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CPEB1-217ENST00000618698 B9D2Q9BPU9 175 aa6.6□□□□□ -1.35
CPEB1-217ENST00000618698 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
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CPEB1-217ENST00000618698 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.58□□□□□ -1.36
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CPEB1-217ENST00000618698 F8WEM9 126 aa6.57□□□□□ -1.36
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CPEB1-217ENST00000618698 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.56□□□□□ -1.36
CPEB1-217ENST00000618698 RETNQ9HD89 108 aa6.56□□□□□ -1.36
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CPEB1-217ENST00000618698 COL7A1Q02388 2944 aa6.55□□□□□ -1.36
CPEB1-217ENST00000618698 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.55□□□□□ -1.36
CPEB1-217ENST00000618698 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.55□□□□□ -1.36
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CPEB1-217ENST00000618698 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.54□□□□□ -1.36
CPEB1-217ENST00000618698 FBN3Q75N90 2809 aa6.53□□□□□ -1.36
CPEB1-217ENST00000618698 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.53□□□□□ -1.36
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CPEB1-217ENST00000618698 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.53□□□□□ -1.36
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CPEB1-217ENST00000618698 Q6ZVQ6 151 aa6.49□□□□□ -1.37
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CPEB1-217ENST00000618698 C6orf99Q4VX62 202 aa6.48□□□□□ -1.37
CPEB1-217ENST00000618698 C1orf195Q5TG92 126 aa6.48□□□□□ -1.37
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CPEB1-217ENST00000618698 BCE1O60756 84 aa6.47□□□□□ -1.37
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CPEB1-217ENST00000618698 V9GYY9 64 aa6.46□□□□□ -1.38
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CPEB1-217ENST00000618698 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.44□□□□□ -1.38
CPEB1-217ENST00000618698 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.44□□□□□ -1.38
CPEB1-217ENST00000618698 DEFB130BP0DP73 79 aa6.44□□□□□ -1.38
CPEB1-217ENST00000618698 DEFB130AP0DP74 79 aa6.44□□□□□ -1.38
CPEB1-217ENST00000618698 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CPEB1-217ENST00000618698 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.44□□□□□ -1.38
CPEB1-217ENST00000618698 LINC00575Q6W349 94 aa6.44□□□□□ -1.38
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