RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617158.4

CSAG3-202, Transcript of CSAG family member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG3, Length 789 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG3-202ENST00000617158 LRP1BQ9NZR2 4599 aa13.29□□□□□ -0.28
CSAG3-202ENST00000617158 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa13.28□□□□□ -0.28
CSAG3-202ENST00000617158 ARL17AQ8IVW1 177 aa13.28□□□□□ -0.28
CSAG3-202ENST00000617158 SPACA4Q8TDM5 124 aa13.28□□□□□ -0.28
CSAG3-202ENST00000617158 FAM168BA1KXE4 195 aa13.27□□□□□ -0.29
CSAG3-202ENST00000617158 TMEM238C9JI98 176 aa13.27□□□□□ -0.29
CSAG3-202ENST00000617158 NPC2P61916 151 aa13.27□□□□□ -0.29
CSAG3-202ENST00000617158 LINC00308Q8TCZ7 52 aa13.27□□□□□ -0.29
CSAG3-202ENST00000617158 A0A1W2PNN7 141 aa13.26□□□□□ -0.29
CSAG3-202ENST00000617158 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
CSAG3-202ENST00000617158 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa13.24□□□□□ -0.29
CSAG3-202ENST00000617158 MUSTN1Q8IVN3 82 aa13.24□□□□□ -0.29
CSAG3-202ENST00000617158 PKIGQ9Y2B9 76 aa13.24□□□□□ -0.29
CSAG3-202ENST00000617158 EPM2AB3EWF7 344 aa13.23□□□□□ -0.29
CSAG3-202ENST00000617158 VPREB1P12018 145 aa13.21□□□□□ -0.29
CSAG3-202ENST00000617158 Q6ZVH6 145 aa13.21□□□□□ -0.29
CSAG3-202ENST00000617158 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa13.21□□□□□ -0.29
CSAG3-202ENST00000617158 A0A087WYN8 130 aa13.2□□□□□ -0.3
CSAG3-202ENST00000617158 TSTD3H0UI37 97 aa13.2□□□□□ -0.3
CSAG3-202ENST00000617158 IFITM1P13164 125 aa13.2□□□□□ -0.3
CSAG3-202ENST00000617158 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
CSAG3-202ENST00000617158 PRR3P79522 188 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
CSAG3-202ENST00000617158 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP13.2□□□□□ -0.3
CSAG3-202ENST00000617158 HIST1H4GQ99525 98 aa13.19□□□□□ -0.3
CSAG3-202ENST00000617158 PPDPFQ9H3Y8 114 aa13.19□□□□□ -0.3
CSAG3-202ENST00000617158 LINC00474Q9P2X8 69 aa13.19□□□□□ -0.3
CSAG3-202ENST00000617158 HAMPP81172 84 aa13.18□□□□□ -0.3
CSAG3-202ENST00000617158 PLAC8Q9NZF1 115 aa13.18□□□□□ -0.3
CSAG3-202ENST00000617158 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa13.17□□□□□ -0.3
CSAG3-202ENST00000617158 TAL2Q16559 108 aa13.17□□□□□ -0.3
CSAG3-202ENST00000617158 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
CSAG3-202ENST00000617158 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa13.16□□□□□ -0.3
CSAG3-202ENST00000617158 APOBP04114 4563 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
CSAG3-202ENST00000617158 XGP55808 180 aa13.15□□□□□ -0.3
CSAG3-202ENST00000617158 HSD52Q0P140 79 aa13.15□□□□□ -0.3
CSAG3-202ENST00000617158 SCXQ7RTU7 201 aa13.15□□□□□ -0.3
CSAG3-202ENST00000617158 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa13.14□□□□□ -0.31
CSAG3-202ENST00000617158 IGKV2D-28P01615 120 aa13.14□□□□□ -0.31
CSAG3-202ENST00000617158 CTAG1AP78358 180 aa13.14□□□□□ -0.31
CSAG3-202ENST00000617158 CEND1Q8N111 149 aa13.14□□□□□ -0.31
CSAG3-202ENST00000617158 A4D1N5 150 aa13.13□□□□□ -0.31
CSAG3-202ENST00000617158 NDUFC2O95298 119 aa13.13□□□□□ -0.31
CSAG3-202ENST00000617158 DDTP30046 118 aa13.13□□□□□ -0.31
CSAG3-202ENST00000617158 FXYD2P54710 66 aa13.13□□□□□ -0.31
CSAG3-202ENST00000617158 C22orf24Q9Y442 160 aa13.13□□□□□ -0.31
CSAG3-202ENST00000617158 DPH3Q96FX2 82 aa13.12□□□□□ -0.31
CSAG3-202ENST00000617158 NCR3O14931 201 aa13.11□□□□□ -0.31
CSAG3-202ENST00000617158 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
CSAG3-202ENST00000617158 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa13.11□□□□□ -0.31
CSAG3-202ENST00000617158 RPL24P83731 157 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
CSAG3-202ENST00000617158 C7orf33Q8WU49 177 aa13.1□□□□□ -0.31
CSAG3-202ENST00000617158 M0QXV9 152 aa13.09□□□□□ -0.31
CSAG3-202ENST00000617158 COPS9Q8WXC6 57 aa13.08□□□□□ -0.32
CSAG3-202ENST00000617158 LINC00167Q96N53 147 aa13.08□□□□□ -0.32
CSAG3-202ENST00000617158 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa13.07□□□□□ -0.32
CSAG3-202ENST00000617158 LINC00337Q8N6G1 96 aa13.07□□□□□ -0.32
CSAG3-202ENST00000617158 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa13.06□□□□□ -0.32
CSAG3-202ENST00000617158 GAGE10A6NGK3 116 aa13.06□□□□□ -0.32
CSAG3-202ENST00000617158 M0R378 163 aa13.06□□□□□ -0.32
CSAG3-202ENST00000617158 CFC1BP0CG36 223 aa13.05□□□□□ -0.32
CSAG3-202ENST00000617158 CFC1P0CG37 223 aa13.05□□□□□ -0.32
CSAG3-202ENST00000617158 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
CSAG3-202ENST00000617158 NKAPP1Q8N9T2 125 aa13.05□□□□□ -0.32
CSAG3-202ENST00000617158 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
CSAG3-202ENST00000617158 RPL37AP8A6NKH3 93 aa13.02□□□□□ -0.33
CSAG3-202ENST00000617158 IGLV6-57P01721 117 aa13.02□□□□□ -0.33
CSAG3-202ENST00000617158 RYR1P21817 5038 aa13.01□□□□□ -0.33
CSAG3-202ENST00000617158 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa13.01□□□□□ -0.33
CSAG3-202ENST00000617158 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa13.01□□□□□ -0.33
CSAG3-202ENST00000617158 PCP4L1A6NKN8 68 aa13.01□□□□□ -0.33
CSAG3-202ENST00000617158 A0A1B0GWB2 263 aa13□□□□□ -0.33
CSAG3-202ENST00000617158 CDK2AP2O75956 126 aa12.99□□□□□ -0.33
CSAG3-202ENST00000617158 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
CSAG3-202ENST00000617158 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa12.99□□□□□ -0.33
CSAG3-202ENST00000617158 A0A0B4J2C4 111 aa12.98□□□□□ -0.33
CSAG3-202ENST00000617158 K7ERJ3 54 aa12.98□□□□□ -0.33
CSAG3-202ENST00000617158 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
CSAG3-202ENST00000617158 BIRC6Q9NR09 4857 aa12.98□□□□□ -0.33
CSAG3-202ENST00000617158 KIAA1109Q2LD37 5005 aa12.97□□□□□ -0.33
CSAG3-202ENST00000617158 M0R143 59 aa12.97□□□□□ -0.33
CSAG3-202ENST00000617158 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa12.96□□□□□ -0.33
CSAG3-202ENST00000617158 A6NJY4 79 aa12.96□□□□□ -0.33
CSAG3-202ENST00000617158 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
CSAG3-202ENST00000617158 OR13C6PQ8NH95 151 aa12.95□□□□□ -0.34
CSAG3-202ENST00000617158 KCNQ1DNQ9H478 68 aa12.95□□□□□ -0.34
CSAG3-202ENST00000617158 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa12.94□□□□□ -0.34
CSAG3-202ENST00000617158 A6NDN8 102 aa12.94□□□□□ -0.34
CSAG3-202ENST00000617158 S100A7L2Q5SY68 101 aa12.94□□□□□ -0.34
CSAG3-202ENST00000617158 SNHG12Q9BXW3 62 aa12.94□□□□□ -0.34
CSAG3-202ENST00000617158 HSPG2P98160 4391 aa12.94□□□□□ -0.34
CSAG3-202ENST00000617158 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
CSAG3-202ENST00000617158 UBE2BP63146 152 aa12.93□□□□□ -0.34
CSAG3-202ENST00000617158 TMEM126AQ9H061 195 aa12.93□□□□□ -0.34
CSAG3-202ENST00000617158 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa12.92□□□□□ -0.34
CSAG3-202ENST00000617158 SPRR1AP35321 89 aa12.91□□□□□ -0.34
CSAG3-202ENST00000617158 RAB37Q96AX2 223 aa12.91□□□□□ -0.34
CSAG3-202ENST00000617158 PRO1854Q9UHT4 67 aa12.91□□□□□ -0.34
CSAG3-202ENST00000617158 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
CSAG3-202ENST00000617158 BATFQ16520 125 aa12.9□□□□□ -0.34
CSAG3-202ENST00000617158 SMIM11BQ8TCY0 68 aa12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms