RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598960.5

FCHO1-227, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-227ENST00000598960 Q6ZRP5 223 aa9.17□□□□□ -0.94
FCHO1-227ENST00000598960 LINC00337Q8N6G1 96 aa9.17□□□□□ -0.94
FCHO1-227ENST00000598960 XAGE1AQ9HD64 81 aa9.17□□□□□ -0.94
FCHO1-227ENST00000598960 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa9.16□□□□□ -0.94
FCHO1-227ENST00000598960 A0A1W2PPM0 123 aa9.16□□□□□ -0.94
FCHO1-227ENST00000598960 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
FCHO1-227ENST00000598960 Q8NDZ9 215 aa9.16□□□□□ -0.94
FCHO1-227ENST00000598960 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
FCHO1-227ENST00000598960 A0A087WTM6 91 aa9.15□□□□□ -0.94
FCHO1-227ENST00000598960 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa9.15□□□□□ -0.94
FCHO1-227ENST00000598960 H7C2G1 150 aa9.15□□□□□ -0.94
FCHO1-227ENST00000598960 Q1RN00 199 aa9.15□□□□□ -0.94
FCHO1-227ENST00000598960 GAGE2EQ4V326 116 aa9.15□□□□□ -0.94
FCHO1-227ENST00000598960 GAGE2DQ9UEU5 116 aa9.15□□□□□ -0.94
FCHO1-227ENST00000598960 FABP2P12104 132 aa9.14□□□□□ -0.95
FCHO1-227ENST00000598960 Q8N814 137 aa9.14□□□□□ -0.95
FCHO1-227ENST00000598960 VAMP3Q15836 100 aa9.13□□□□□ -0.95
FCHO1-227ENST00000598960 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
FCHO1-227ENST00000598960 NCR3O14931 201 aa9.12□□□□□ -0.95
FCHO1-227ENST00000598960 VPREB1P12018 145 aa9.12□□□□□ -0.95
FCHO1-227ENST00000598960 LYRM7Q5U5X0 104 aa9.12□□□□□ -0.95
FCHO1-227ENST00000598960 DNAH10Q8IVF4 4471 aa9.11□□□□□ -0.95
FCHO1-227ENST00000598960 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa9.11□□□□□ -0.95
FCHO1-227ENST00000598960 TRIAP1O43715 76 aa9.11□□□□□ -0.95
FCHO1-227ENST00000598960 PRR3P79522 188 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
FCHO1-227ENST00000598960 K7EP34 96 aa9.1□□□□□ -0.95
FCHO1-227ENST00000598960 PSMB2P49721 201 aa9.1□□□□□ -0.95
FCHO1-227ENST00000598960 GAGE2BQ13066 116 aa9.1□□□□□ -0.95
FCHO1-227ENST00000598960 C9orf163Q8N9P6 203 aa9.1□□□□□ -0.95
FCHO1-227ENST00000598960 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa9.1□□□□□ -0.95
FCHO1-227ENST00000598960 PKIGQ9Y2B9 76 aa9.1□□□□□ -0.95
FCHO1-227ENST00000598960 SPCS1Q9Y6A9 102 aa9.1□□□□□ -0.95
FCHO1-227ENST00000598960 OR13C6PQ8NH95 151 aa9.09□□□□□ -0.95
FCHO1-227ENST00000598960 A0A096LNI7 61 aa9.08□□□□□ -0.96
FCHO1-227ENST00000598960 LCE6AA0A183 80 aa9.08□□□□□ -0.96
FCHO1-227ENST00000598960 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa9.07□□□□□ -0.96
FCHO1-227ENST00000598960 C16orf90A8MZG2 172 aa9.07□□□□□ -0.96
FCHO1-227ENST00000598960 RTL8CO15255 209 aa9.07□□□□□ -0.96
FCHO1-227ENST00000598960 RPL28P46779 137 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
FCHO1-227ENST00000598960 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa9.07□□□□□ -0.96
FCHO1-227ENST00000598960 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa9.07□□□□□ -0.96
FCHO1-227ENST00000598960 SMIM11BQ8TCY0 68 aa9.07□□□□□ -0.96
FCHO1-227ENST00000598960 TMEM126AQ9H061 195 aa9.07□□□□□ -0.96
FCHO1-227ENST00000598960 GAGE10A6NGK3 116 aa9.06□□□□□ -0.96
FCHO1-227ENST00000598960 M0R378 163 aa9.06□□□□□ -0.96
FCHO1-227ENST00000598960 IGLV6-57P01721 117 aa9.06□□□□□ -0.96
FCHO1-227ENST00000598960 SCGB1C2P0DMR2 95 aa9.06□□□□□ -0.96
FCHO1-227ENST00000598960 TNP2Q05952 138 aa9.06□□□□□ -0.96
FCHO1-227ENST00000598960 S100A7L2Q5SY68 101 aa9.06□□□□□ -0.96
FCHO1-227ENST00000598960 KMT2AQ03164 3969 aa9.05□□□□□ -0.96
FCHO1-227ENST00000598960 COX6CP09669 75 aa9.05□□□□□ -0.96
FCHO1-227ENST00000598960 UBE2V1Q13404 147 aa9.05□□□□□ -0.96
FCHO1-227ENST00000598960 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa9.04□□□□□ -0.96
FCHO1-227ENST00000598960 TCL1BO95988 128 aa9.04□□□□□ -0.96
FCHO1-227ENST00000598960 NKAPP1Q8N9T2 125 aa9.04□□□□□ -0.96
FCHO1-227ENST00000598960 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa9.03□□□□□ -0.96
FCHO1-227ENST00000598960 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa9.03□□□□□ -0.96
FCHO1-227ENST00000598960 FAM168BA1KXE4 195 aa9.03□□□□□ -0.96
FCHO1-227ENST00000598960 SDIM1Q6ZPB5 146 aa9.03□□□□□ -0.96
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa9.03□□□□□ -0.96
FCHO1-227ENST00000598960 LINC01620Q4KN68 170 aa9.02□□□□□ -0.97
FCHO1-227ENST00000598960 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
FCHO1-227ENST00000598960 C7orf33Q8WU49 177 aa9.02□□□□□ -0.97
FCHO1-227ENST00000598960 DNAH17Q9UFH2 4485 aa9.01□□□□□ -0.97
FCHO1-227ENST00000598960 CHTF8P0CG12 524 aa9.01□□□□□ -0.97
FCHO1-227ENST00000598960 CLEC2BQ92478 149 aa9.01□□□□□ -0.97
FCHO1-227ENST00000598960 DNAH2Q9P225 4427 aa9.01□□□□□ -0.97
FCHO1-227ENST00000598960 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa9□□□□□ -0.97
FCHO1-227ENST00000598960 ATXN8Q156A1 80 aa9□□□□□ -0.97
FCHO1-227ENST00000598960 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa8.99□□□□□ -0.97
FCHO1-227ENST00000598960 H3BMG7 143 aa8.99□□□□□ -0.97
FCHO1-227ENST00000598960 LST1O00453 97 aa8.99□□□□□ -0.97
FCHO1-227ENST00000598960 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP8.99□□□□□ -0.97
FCHO1-227ENST00000598960 CBY1Q9Y3M2 126 aa8.99□□□□□ -0.97
FCHO1-227ENST00000598960 C6orf99Q4VX62 202 aa8.98□□□□□ -0.97
FCHO1-227ENST00000598960 LINC00474Q9P2X8 69 aa8.98□□□□□ -0.97
FCHO1-227ENST00000598960 C22orf24Q9Y442 160 aa8.98□□□□□ -0.97
FCHO1-227ENST00000598960 A0A1W2PNN7 141 aa8.97□□□□□ -0.97
FCHO1-227ENST00000598960 H0YGX0 51 aa8.97□□□□□ -0.97
FCHO1-227ENST00000598960 M0QXV9 152 aa8.97□□□□□ -0.97
FCHO1-227ENST00000598960 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
FCHO1-227ENST00000598960 SPACA4Q8TDM5 124 aa8.97□□□□□ -0.97
FCHO1-227ENST00000598960 DIRC1Q969H9 104 aa8.97□□□□□ -0.97
FCHO1-227ENST00000598960 FAM218AQ96MZ4 157 aa8.97□□□□□ -0.97
FCHO1-227ENST00000598960 PANO1I0J062 215 aa8.96□□□□□ -0.98
FCHO1-227ENST00000598960 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
FCHO1-227ENST00000598960 LINC00167Q96N53 147 aa8.96□□□□□ -0.98
FCHO1-227ENST00000598960 PRYO14603 147 aa8.95□□□□□ -0.98
FCHO1-227ENST00000598960 KCNQ1DNQ9H478 68 aa8.95□□□□□ -0.98
FCHO1-227ENST00000598960 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
FCHO1-227ENST00000598960 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa8.94□□□□□ -0.98
FCHO1-227ENST00000598960 TRACP01848 142 aa8.94□□□□□ -0.98
FCHO1-227ENST00000598960 KRTAP10-2P60368 255 aa8.94□□□□□ -0.98
FCHO1-227ENST00000598960 PRO0461Q9UI25 63 aa8.94□□□□□ -0.98
FCHO1-227ENST00000598960 SACSQ9NZJ4 4579 aa8.94□□□□□ -0.98
FCHO1-227ENST00000598960 A0A087WYN8 130 aa8.93□□□□□ -0.98
FCHO1-227ENST00000598960 MTURNQ8N3F0 131 aa8.93□□□□□ -0.98
FCHO1-227ENST00000598960 FRAS1Q86XX4 4008 aa8.92□□□□□ -0.98
FCHO1-227ENST00000598960 HYDINQ4G0P3 5121 aa8.92□□□□□ -0.98
FCHO1-227ENST00000598960 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa8.92□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.9 ms