RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598362.1

GRAMD1A-208, Transcript of GRAM domain containing 1A, human

TSL 2

Gene GRAMD1A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRAMD1A-208	ENST00000598362	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GRAMD1A-208	ENST00000598362	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GRAMD1A-208	ENST00000598362		J3QQQ9	107 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GRAMD1A-208	ENST00000598362		M0QXV9	152 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GRAMD1A-208	ENST00000598362	PFN2	P35080	140 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GRAMD1A-208	ENST00000598362	NMU	P48645	174 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GRAMD1A-208	ENST00000598362	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
GRAMD1A-208	ENST00000598362	HERV-K104	P63124	156 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GRAMD1A-208	ENST00000598362	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GRAMD1A-208	ENST00000598362	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GRAMD1A-208	ENST00000598362	C7orf33	Q8WU49	177 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GRAMD1A-208	ENST00000598362	AKR1D1	P51857	326 aa		4.7	□□□□□ -1.66
GRAMD1A-208	ENST00000598362	COX17	Q14061	63 aa		4.7	□□□□□ -1.66
GRAMD1A-208	ENST00000598362	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ATOH7	Q8N100	152 aa		4.7	□□□□□ -1.66
GRAMD1A-208	ENST00000598362	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GRAMD1A-208	ENST00000598362		A0A0U1RRA0	63 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GRAMD1A-208	ENST00000598362	SMIM13	P0DJ93	91 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GRAMD1A-208	ENST00000598362	LINC00158	P58513	81 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GRAMD1A-208	ENST00000598362	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GRAMD1A-208	ENST00000598362	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GRAMD1A-208	ENST00000598362	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
GRAMD1A-208	ENST00000598362	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GRAMD1A-208	ENST00000598362		A0A0J9YXY3	114 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ZNF815P	A8K554	130 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GRAMD1A-208	ENST00000598362	LINC00587	B1AMM8	73 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GRAMD1A-208	ENST00000598362	UBE2B	P63146	152 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GRAMD1A-208	ENST00000598362	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GRAMD1A-208	ENST00000598362	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GRAMD1A-208	ENST00000598362	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GRAMD1A-208	ENST00000598362	C22orf24	Q9Y442	160 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GRAMD1A-208	ENST00000598362	SCGB1D1	O95968	90 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GRAMD1A-208	ENST00000598362	VPREB1	P12018	145 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GRAMD1A-208	ENST00000598362	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
GRAMD1A-208	ENST00000598362	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
GRAMD1A-208	ENST00000598362	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GRAMD1A-208	ENST00000598362	DAND5	Q8N907	189 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GRAMD1A-208	ENST00000598362	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GRAMD1A-208	ENST00000598362		Q8NDZ9	215 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GRAMD1A-208	ENST00000598362	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
GRAMD1A-208	ENST00000598362	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GRAMD1A-208	ENST00000598362	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
GRAMD1A-208	ENST00000598362	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
GRAMD1A-208	ENST00000598362	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GRAMD1A-208	ENST00000598362	GAGE10	A6NGK3	116 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GRAMD1A-208	ENST00000598362	TIMM17B	O60830	172 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GRAMD1A-208	ENST00000598362	C1orf137	Q5JT78	98 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GRAMD1A-208	ENST00000598362	PCP2	Q8IVA1	136 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GRAMD1A-208	ENST00000598362	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GRAMD1A-208	ENST00000598362	LITAF	Q99732	161 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GRAMD1A-208	ENST00000598362	NCR3	O14931	201 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GRAMD1A-208	ENST00000598362	NPC2	P61916	151 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GRAMD1A-208	ENST00000598362	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GRAMD1A-208	ENST00000598362	LINC00167	Q96N53	147 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GRAMD1A-208	ENST00000598362	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GRAMD1A-208	ENST00000598362	RNF213	Q63HN8	5207 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GRAMD1A-208	ENST00000598362	TNXB	P22105	4242 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GRAMD1A-208	ENST00000598362	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GRAMD1A-208	ENST00000598362	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GRAMD1A-208	ENST00000598362	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GRAMD1A-208	ENST00000598362	TMEM238	C9JI98	176 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GRAMD1A-208	ENST00000598362	IGKV2D-28	P01615	120 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GRAMD1A-208	ENST00000598362	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GRAMD1A-208	ENST00000598362	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GRAMD1A-208	ENST00000598362	IGLV7-43	P04211	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GRAMD1A-208	ENST00000598362	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GRAMD1A-208	ENST00000598362	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GRAMD1A-208	ENST00000598362	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GRAMD1A-208	ENST00000598362	SPANXC	Q9NY87	97 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GRAMD1A-208	ENST00000598362	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GRAMD1A-208	ENST00000598362		M0R378	163 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GRAMD1A-208	ENST00000598362	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GRAMD1A-208	ENST00000598362	NDUFC2	O95298	119 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GRAMD1A-208	ENST00000598362	SPATA45	Q537H7	98 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GRAMD1A-208	ENST00000598362	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GRAMD1A-208	ENST00000598362	VAMP8	Q9BV40	100 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GRAMD1A-208	ENST00000598362	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GRAMD1A-208	ENST00000598362	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GRAMD1A-208	ENST00000598362	BCE1	O60756	84 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GRAMD1A-208	ENST00000598362	MT1HL1	P0DM35	61 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GRAMD1A-208	ENST00000598362	COX8A	P10176	69 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GRAMD1A-208	ENST00000598362	PYY3	Q5JQD4	70 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GRAMD1A-208	ENST00000598362	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GRAMD1A-208	ENST00000598362	PRY	O14603	147 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GRAMD1A-208	ENST00000598362	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68
GRAMD1A-208	ENST00000598362	REG3G	Q6UW15	175 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GRAMD1A-208	ENST00000598362	COPS9	Q8WXC6	57 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GRAMD1A-208	ENST00000598362	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GRAMD1A-208	ENST00000598362	TMEM126A	Q9H061	195 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ZNF861P	O60384	105 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GRAMD1A-208	ENST00000598362	IFITM1	P13164	125 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GRAMD1A-208	ENST00000598362	DDT	P30046	118 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GRAMD1A-208	ENST00000598362	UBE2A	P49459	152 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GRAMD1A-208	ENST00000598362		Q6ZVH6	145 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GRAMD1A-208	ENST00000598362	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GRAMD1A-208	ENST00000598362	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GRAMD1A-208	ENST00000598362	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		4.57	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.9 ms