RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597259.1

HERC3-212, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 313 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-212ENST00000597259 MT-ND4LP03901 98 aa3.15□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 TEX43Q6ZNM6 134 aa3.15□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 Q8IZM0 81 aa3.15□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 LINC00469Q8N7U9 141 aa3.15□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 TOMM6Q96B49 74 aa3.15□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 TIMM17AQ99595 171 aa3.15□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 CYSLTR1Q9Y271 337 aa3.15□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 TMEM218A2RU14 115 aa3.14□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 K7EMI3 77 aa3.14□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 RAB5AP20339 215 aa3.14□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 ORMDL2Q53FV1 153 aa3.14□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 C10orf91Q5T1B1 145 aa3.14□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa3.14□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 Q8NDZ9 215 aa3.14□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 XAGE1AQ9HD64 81 aa3.14□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 C22orf24Q9Y442 160 aa3.14□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 Q6ZN92 141 aa3.13□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 Q8N377 158 aa3.13□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 DIRC1Q969H9 104 aa3.13□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 VCX2Q9H322 139 aa3.13□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 F8VRH5 84 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 ZNF861PO60384 105 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 SCO1O75880 301 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 ERASQ7Z444 233 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 LINC00167Q96N53 147 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 C2orf88Q9BSF0 95 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 GNB1LQ9BYB4 327 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 CST9LQ9H4G1 147 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 TOMM7Q9P0U1 55 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa3.11□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa3.11□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 HERVK_113P63121 156 aa3.11□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 PDZD11Q5EBL8 140 aa3.11□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 C6orf226Q5I0X4 101 aa3.11□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 UQCC3Q6UW78 93 aa3.11□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 YPEL4Q96NS1 127 aa3.11□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 SEC11CQ9BY50 192 aa3.11□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 TP73-AS1Q9UF72 201 aa3.11□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 NUPR1O60356 82 aa3.1□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 SPINK8P0C7L1 97 aa3.1□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 IGLC3P0DOY3 106 aa3.1□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 RAB14P61106 215 aa3.1□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 UBE2BP63146 152 aa3.1□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 C18orf32Q8TCD1 76 aa3.1□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 COX7B2Q8TF08 81 aa3.1□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 SCGB3A1Q96QR1 104 aa3.1□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 ANAPC11Q9NYG5 84 aa3.1□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 RPL37AP8A6NKH3 93 aa3.09□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 BCE1O60756 84 aa3.09□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 CKS1BP61024 79 aa3.09□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 PMVKQ15126 192 aa3.09□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa3.09□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 COMMD7Q86VX2 200 aa3.09□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
HERC3-212ENST00000597259 C11orf86A6NJI1 115 aa3.08□□□□□ -1.92
HERC3-212ENST00000597259 CXCL5P42830 114 aa3.08□□□□□ -1.92
HERC3-212ENST00000597259 RAB5BP61020 215 aa3.08□□□□□ -1.92
HERC3-212ENST00000597259 SEC11AP67812 179 aa3.08□□□□□ -1.92
HERC3-212ENST00000597259 PMCHL1Q16048 86 aa3.08□□□□□ -1.92
HERC3-212ENST00000597259 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
HERC3-212ENST00000597259 M0R378 163 aa3.07□□□□□ -1.92
HERC3-212ENST00000597259 FABP9Q0Z7S8 132 aa3.07□□□□□ -1.92
HERC3-212ENST00000597259 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa3.07□□□□□ -1.92
HERC3-212ENST00000597259 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC3-212ENST00000597259 TMEM238C9JI98 176 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC3-212ENST00000597259 TSPAN13O95857 204 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC3-212ENST00000597259 IGKV2D-28P01615 120 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC3-212ENST00000597259 LINC00614P0C842 121 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC3-212ENST00000597259 G0S2P27469 103 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC3-212ENST00000597259 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
HERC3-212ENST00000597259 KRTAP12-2P59991 146 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC3-212ENST00000597259 RHEBQ15382 184 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC3-212ENST00000597259 COX19Q49B96 90 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC3-212ENST00000597259 FA2HQ7L5A8 372 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC3-212ENST00000597259 TMEM126AQ9H061 195 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC3-212ENST00000597259 TMEM223A0PJW6 202 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC3-212ENST00000597259 LINC01549A6NIU2 74 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC3-212ENST00000597259 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
HERC3-212ENST00000597259 HBDP02042 147 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC3-212ENST00000597259 S100PP25815 95 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC3-212ENST00000597259 PFN2P35080 140 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC3-212ENST00000597259 RPL28P46779 137 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
HERC3-212ENST00000597259 PRLHP81277 87 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC3-212ENST00000597259 PRR4Q16378 134 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC3-212ENST00000597259 C3orf22Q8N5N4 141 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC3-212ENST00000597259 PLEKHB2Q96CS7 222 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC3-212ENST00000597259 ERG28Q9UKR5 140 aa3.05□□□□□ -1.92
HERC3-212ENST00000597259 CRYGAP11844 174 aa3.04□□□□□ -1.92
HERC3-212ENST00000597259 TSPEAR-AS2P59090 65 aa3.04□□□□□ -1.92
HERC3-212ENST00000597259 FAM229BQ4G0N7 80 aa3.04□□□□□ -1.92
HERC3-212ENST00000597259 TYMSOSQ8TAI1 123 aa3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.2 ms