RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596865.5

FCHO1-217, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 579 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-217ENST00000596865 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa8.02□□□□□ -1.13
FCHO1-217ENST00000596865 J3QQQ9 107 aa8.02□□□□□ -1.13
FCHO1-217ENST00000596865 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP8.02□□□□□ -1.13
FCHO1-217ENST00000596865 MEIG1Q5JSS6 88 aa8.02□□□□□ -1.13
FCHO1-217ENST00000596865 LINC00167Q96N53 147 aa8.02□□□□□ -1.13
FCHO1-217ENST00000596865 VPREB1P12018 145 aa8.01□□□□□ -1.13
FCHO1-217ENST00000596865 PET117Q6UWS5 81 aa8.01□□□□□ -1.13
FCHO1-217ENST00000596865 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
FCHO1-217ENST00000596865 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa8□□□□□ -1.13
FCHO1-217ENST00000596865 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
FCHO1-217ENST00000596865 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
FCHO1-217ENST00000596865 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
FCHO1-217ENST00000596865 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.99□□□□□ -1.13
FCHO1-217ENST00000596865 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.99□□□□□ -1.13
FCHO1-217ENST00000596865 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.98□□□□□ -1.13
FCHO1-217ENST00000596865 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.98□□□□□ -1.13
FCHO1-217ENST00000596865 J3QL48 77 aa7.98□□□□□ -1.13
FCHO1-217ENST00000596865 IGKV2D-28P01615 120 aa7.98□□□□□ -1.13
FCHO1-217ENST00000596865 IGLV7-43P04211 117 aa7.98□□□□□ -1.13
FCHO1-217ENST00000596865 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
FCHO1-217ENST00000596865 HERVK_113P61574 105 aa7.98□□□□□ -1.13
FCHO1-217ENST00000596865 NPC2P61916 151 aa7.98□□□□□ -1.13
FCHO1-217ENST00000596865 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.98□□□□□ -1.13
FCHO1-217ENST00000596865 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.98□□□□□ -1.13
FCHO1-217ENST00000596865 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.97□□□□□ -1.13
FCHO1-217ENST00000596865 E9PLD3 99 aa7.97□□□□□ -1.13
FCHO1-217ENST00000596865 MT1HL1P0DM35 61 aa7.97□□□□□ -1.13
FCHO1-217ENST00000596865 COX17Q14061 63 aa7.97□□□□□ -1.13
FCHO1-217ENST00000596865 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.97□□□□□ -1.13
FCHO1-217ENST00000596865 HMCN2Q8NDA2 5059 aa7.97□□□□□ -1.13
FCHO1-217ENST00000596865 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.96□□□□□ -1.14
FCHO1-217ENST00000596865 A0A0J9YXY3 114 aa7.95□□□□□ -1.14
FCHO1-217ENST00000596865 TMEM238C9JI98 176 aa7.95□□□□□ -1.14
FCHO1-217ENST00000596865 NCR3O14931 201 aa7.95□□□□□ -1.14
FCHO1-217ENST00000596865 HERV-K104P63124 156 aa7.95□□□□□ -1.14
FCHO1-217ENST00000596865 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.95□□□□□ -1.14
FCHO1-217ENST00000596865 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.95□□□□□ -1.14
FCHO1-217ENST00000596865 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.95□□□□□ -1.14
FCHO1-217ENST00000596865 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
FCHO1-217ENST00000596865 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7.94□□□□□ -1.14
FCHO1-217ENST00000596865 S100A6P06703 90 aa7.93□□□□□ -1.14
FCHO1-217ENST00000596865 S100A2P29034 98 aa7.93□□□□□ -1.14
FCHO1-217ENST00000596865 SFTA2Q6UW10 78 aa7.93□□□□□ -1.14
FCHO1-217ENST00000596865 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.92□□□□□ -1.14
FCHO1-217ENST00000596865 C5orf52A6NGY3 159 aa7.92□□□□□ -1.14
FCHO1-217ENST00000596865 OXTP01178 125 aa7.92□□□□□ -1.14
FCHO1-217ENST00000596865 LITAFQ99732 161 aa7.92□□□□□ -1.14
FCHO1-217ENST00000596865 TNXBP22105 4242 aa7.91□□□□□ -1.14
FCHO1-217ENST00000596865 ZNF815PA8K554 130 aa7.91□□□□□ -1.14
FCHO1-217ENST00000596865 NMUP48645 174 aa7.91□□□□□ -1.14
FCHO1-217ENST00000596865 PCP2Q8IVA1 136 aa7.91□□□□□ -1.14
FCHO1-217ENST00000596865 PRLHP81277 87 aa7.9□□□□□ -1.14
FCHO1-217ENST00000596865 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
FCHO1-217ENST00000596865 C20orf202A1L168 122 aa7.89□□□□□ -1.15
FCHO1-217ENST00000596865 H0Y9J4 135 aa7.89□□□□□ -1.15
FCHO1-217ENST00000596865 M0R378 163 aa7.89□□□□□ -1.15
FCHO1-217ENST00000596865 BCE1O60756 84 aa7.89□□□□□ -1.15
FCHO1-217ENST00000596865 LINC01600Q96MT4 127 aa7.89□□□□□ -1.15
FCHO1-217ENST00000596865 ZNF861PO60384 105 aa7.88□□□□□ -1.15
FCHO1-217ENST00000596865 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa7.88□□□□□ -1.15
FCHO1-217ENST00000596865 PRR26Q8N8Z3 221 aa7.88□□□□□ -1.15
FCHO1-217ENST00000596865 TMEM126AQ9H061 195 aa7.88□□□□□ -1.15
FCHO1-217ENST00000596865 ANAPC11Q9NYG5 84 aa7.88□□□□□ -1.15
FCHO1-217ENST00000596865 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.87□□□□□ -1.15
FCHO1-217ENST00000596865 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa7.87□□□□□ -1.15
FCHO1-217ENST00000596865 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
FCHO1-217ENST00000596865 KRTAP10-8P60410 259 aa7.86□□□□□ -1.15
FCHO1-217ENST00000596865 REG3GQ6UW15 175 aa7.86□□□□□ -1.15
FCHO1-217ENST00000596865 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa7.86□□□□□ -1.15
FCHO1-217ENST00000596865 DIRC1Q969H9 104 aa7.86□□□□□ -1.15
FCHO1-217ENST00000596865 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.85□□□□□ -1.15
FCHO1-217ENST00000596865 LINC00587B1AMM8 73 aa7.85□□□□□ -1.15
FCHO1-217ENST00000596865 SCGB1D1O95968 90 aa7.85□□□□□ -1.15
FCHO1-217ENST00000596865 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.85□□□□□ -1.15
FCHO1-217ENST00000596865 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.85□□□□□ -1.15
FCHO1-217ENST00000596865 UBE2AP49459 152 aa7.84□□□□□ -1.15
FCHO1-217ENST00000596865 TIMM17BO60830 172 aa7.81□□□□□ -1.16
FCHO1-217ENST00000596865 RPL28P46779 137 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
FCHO1-217ENST00000596865 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.81□□□□□ -1.16
FCHO1-217ENST00000596865 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.81□□□□□ -1.16
FCHO1-217ENST00000596865 A0A087X002 238 aa7.8□□□□□ -1.16
FCHO1-217ENST00000596865 DDTP30046 118 aa7.8□□□□□ -1.16
FCHO1-217ENST00000596865 HIGD2AQ9BW72 106 aa7.8□□□□□ -1.16
FCHO1-217ENST00000596865 UBR4Q5T4S7 5183 aa7.79□□□□□ -1.16
FCHO1-217ENST00000596865 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
FCHO1-217ENST00000596865 PRYO14603 147 aa7.79□□□□□ -1.16
FCHO1-217ENST00000596865 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.79□□□□□ -1.16
FCHO1-217ENST00000596865 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
FCHO1-217ENST00000596865 NDUFC2O95298 119 aa7.78□□□□□ -1.16
FCHO1-217ENST00000596865 SPRR1AP35321 89 aa7.78□□□□□ -1.16
FCHO1-217ENST00000596865 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.78□□□□□ -1.16
FCHO1-217ENST00000596865 ERC2-IT1O76042 136 aa7.77□□□□□ -1.17
FCHO1-217ENST00000596865 IGLV6-57P01721 117 aa7.77□□□□□ -1.17
FCHO1-217ENST00000596865 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.77□□□□□ -1.17
FCHO1-217ENST00000596865 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.77□□□□□ -1.17
FCHO1-217ENST00000596865 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.77□□□□□ -1.17
FCHO1-217ENST00000596865 SPANXCQ9NY87 97 aa7.77□□□□□ -1.17
FCHO1-217ENST00000596865 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa7.76□□□□□ -1.17
FCHO1-217ENST00000596865 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa7.76□□□□□ -1.17
FCHO1-217ENST00000596865 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.76□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 108.9 ms