RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592826.1

APBA3-208, Transcript of amyloid beta precursor protein binding family A member 3, human

TSL 2

Gene APBA3, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APBA3-208	ENST00000592826	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		13.84	□□□□□ -0.19
APBA3-208	ENST00000592826	NMU	P48645	174 aa		13.83	□□□□□ -0.2
APBA3-208	ENST00000592826	LINC00158	P58513	81 aa		13.83	□□□□□ -0.2
APBA3-208	ENST00000592826	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
APBA3-208	ENST00000592826	LINC01545	Q5VT33	79 aa		13.82	□□□□□ -0.2
APBA3-208	ENST00000592826	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		13.82	□□□□□ -0.2
APBA3-208	ENST00000592826		J3QQQ9	107 aa		13.81	□□□□□ -0.2
APBA3-208	ENST00000592826	IGLV7-43	P04211	117 aa		13.81	□□□□□ -0.2
APBA3-208	ENST00000592826	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		13.81	□□□□□ -0.2
APBA3-208	ENST00000592826	REG3G	Q6UW15	175 aa		13.81	□□□□□ -0.2
APBA3-208	ENST00000592826	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		13.79	□□□□□ -0.2
APBA3-208	ENST00000592826	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
APBA3-208	ENST00000592826	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		13.79	□□□□□ -0.2
APBA3-208	ENST00000592826	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		13.79	□□□□□ -0.2
APBA3-208	ENST00000592826		E9PLD3	99 aa		13.78	□□□□□ -0.2
APBA3-208	ENST00000592826	C3orf79	P0CE67	100 aa		13.78	□□□□□ -0.2
APBA3-208	ENST00000592826	AKR1D1	P51857	326 aa		13.77	□□□□□ -0.21
APBA3-208	ENST00000592826	LINC00167	Q96N53	147 aa		13.77	□□□□□ -0.21
APBA3-208	ENST00000592826	SMIM13	P0DJ93	91 aa		13.76	□□□□□ -0.21
APBA3-208	ENST00000592826	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		13.76	□□□□□ -0.21
APBA3-208	ENST00000592826	C20orf202	A1L168	122 aa		13.75	□□□□□ -0.21
APBA3-208	ENST00000592826	VPREB1	P12018	145 aa		13.75	□□□□□ -0.21
APBA3-208	ENST00000592826	KRTDAP	P60985	99 aa		13.75	□□□□□ -0.21
APBA3-208	ENST00000592826	DIRC1	Q969H9	104 aa		13.75	□□□□□ -0.21
APBA3-208	ENST00000592826	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBA3-208	ENST00000592826		A0A0U1RRA0	63 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBA3-208	ENST00000592826	LINC01600	Q96MT4	127 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBA3-208	ENST00000592826	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBA3-208	ENST00000592826	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		13.71	□□□□□ -0.21
APBA3-208	ENST00000592826	S100A6	P06703	90 aa		13.71	□□□□□ -0.21
APBA3-208	ENST00000592826	GAGE10	A6NGK3	116 aa		13.7	□□□□□ -0.22
APBA3-208	ENST00000592826	S100A2	P29034	98 aa		13.7	□□□□□ -0.22
APBA3-208	ENST00000592826	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		13.7	□□□□□ -0.22
APBA3-208	ENST00000592826	ZNF861P	O60384	105 aa		13.69	□□□□□ -0.22
APBA3-208	ENST00000592826	BCE1	O60756	84 aa		13.69	□□□□□ -0.22
APBA3-208	ENST00000592826	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		13.68	□□□□□ -0.22
APBA3-208	ENST00000592826	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		13.68	□□□□□ -0.22
APBA3-208	ENST00000592826		H0Y9J4	135 aa		13.68	□□□□□ -0.22
APBA3-208	ENST00000592826	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		13.68	□□□□□ -0.22
APBA3-208	ENST00000592826	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		13.67	□□□□□ -0.22
APBA3-208	ENST00000592826	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		13.67	□□□□□ -0.22
APBA3-208	ENST00000592826	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		13.66	□□□□□ -0.22
APBA3-208	ENST00000592826		M0R378	163 aa		13.66	□□□□□ -0.22
APBA3-208	ENST00000592826	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
APBA3-208	ENST00000592826	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		13.64	□□□□□ -0.23
APBA3-208	ENST00000592826		A0A0J9YXY3	114 aa		13.64	□□□□□ -0.23
APBA3-208	ENST00000592826	IGKV2D-28	P01615	120 aa		13.64	□□□□□ -0.23
APBA3-208	ENST00000592826	MT1HL1	P0DM35	61 aa		13.64	□□□□□ -0.23
APBA3-208	ENST00000592826		Q8NDZ9	215 aa		13.64	□□□□□ -0.23
APBA3-208	ENST00000592826	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		13.63	□□□□□ -0.23
APBA3-208	ENST00000592826	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		13.63	□□□□□ -0.23
APBA3-208	ENST00000592826	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
APBA3-208	ENST00000592826	TIMM17B	O60830	172 aa		13.6	□□□□□ -0.23
APBA3-208	ENST00000592826	ZNF815P	A8K554	130 aa		13.59	□□□□□ -0.23
APBA3-208	ENST00000592826	DAND5	Q8N907	189 aa		13.59	□□□□□ -0.23
APBA3-208	ENST00000592826	UBE2A	P49459	152 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APBA3-208	ENST00000592826	TMEM126A	Q9H061	195 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APBA3-208	ENST00000592826	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APBA3-208	ENST00000592826	NDUFC2	O95298	119 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APBA3-208	ENST00000592826	KRTAP10-8	P60410	259 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APBA3-208	ENST00000592826	S100A12	P80511	92 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APBA3-208	ENST00000592826	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		13.55	□□□□□ -0.24
APBA3-208	ENST00000592826	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		13.55	□□□□□ -0.24
APBA3-208	ENST00000592826	TMEM238	C9JI98	176 aa		13.54	□□□□□ -0.24
APBA3-208	ENST00000592826	NCR3	O14931	201 aa		13.54	□□□□□ -0.24
APBA3-208	ENST00000592826	ATOH7	Q8N100	152 aa		13.54	□□□□□ -0.24
APBA3-208	ENST00000592826	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
APBA3-208	ENST00000592826	C5orf52	A6NGY3	159 aa		13.53	□□□□□ -0.24
APBA3-208	ENST00000592826	PRY	O14603	147 aa		13.53	□□□□□ -0.24
APBA3-208	ENST00000592826	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		13.53	□□□□□ -0.24
APBA3-208	ENST00000592826	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		13.53	□□□□□ -0.24
APBA3-208	ENST00000592826	LITAF	Q99732	161 aa		13.52	□□□□□ -0.25
APBA3-208	ENST00000592826	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		13.51	□□□□□ -0.25
APBA3-208	ENST00000592826	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		13.51	□□□□□ -0.25
APBA3-208	ENST00000592826	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		13.5	□□□□□ -0.25
APBA3-208	ENST00000592826	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		13.5	□□□□□ -0.25
APBA3-208	ENST00000592826	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
APBA3-208	ENST00000592826	COPS9	Q8WXC6	57 aa		13.49	□□□□□ -0.25
APBA3-208	ENST00000592826	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		13.49	□□□□□ -0.25
APBA3-208	ENST00000592826	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		13.48	□□□□□ -0.25
APBA3-208	ENST00000592826	DDT	P30046	118 aa		13.48	□□□□□ -0.25
APBA3-208	ENST00000592826	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		13.48	□□□□□ -0.25
APBA3-208	ENST00000592826	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		13.48	□□□□□ -0.25
APBA3-208	ENST00000592826	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		13.48	□□□□□ -0.25
APBA3-208	ENST00000592826	SPRR1A	P35321	89 aa		13.47	□□□□□ -0.25
APBA3-208	ENST00000592826	SPANXC	Q9NY87	97 aa		13.47	□□□□□ -0.25
APBA3-208	ENST00000592826	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		13.47	□□□□□ -0.25
APBA3-208	ENST00000592826	NPC2	P61916	151 aa		13.46	□□□□□ -0.25
APBA3-208	ENST00000592826	PRLH	P81277	87 aa		13.46	□□□□□ -0.25
APBA3-208	ENST00000592826	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		13.46	□□□□□ -0.25
APBA3-208	ENST00000592826		Q6ZVH6	145 aa		13.46	□□□□□ -0.25
APBA3-208	ENST00000592826	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		13.45	□□□□□ -0.26
APBA3-208	ENST00000592826	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		13.45	□□□□□ -0.26
APBA3-208	ENST00000592826	TNXB	P22105	4242 aa		13.44	□□□□□ -0.26
APBA3-208	ENST00000592826	IGLV6-57	P01721	117 aa		13.44	□□□□□ -0.26
APBA3-208	ENST00000592826	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		13.44	□□□□□ -0.26
APBA3-208	ENST00000592826	SCGB1D1	O95968	90 aa		13.43	□□□□□ -0.26
APBA3-208	ENST00000592826	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		13.42	□□□□□ -0.26
APBA3-208	ENST00000592826	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
APBA3-208	ENST00000592826	IFITM1	P13164	125 aa		13.42	□□□□□ -0.26

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