RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa4.83□□□□□ -1.64
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM238C9JI98 176 aa4.82□□□□□ -1.64
EFTUD2-216ENST00000590105 G0S2P27469 103 aa4.82□□□□□ -1.64
EFTUD2-216ENST00000590105 DDTP30046 118 aa4.82□□□□□ -1.64
EFTUD2-216ENST00000590105 XCL1P47992 114 aa4.82□□□□□ -1.64
EFTUD2-216ENST00000590105 CNBPP62633 177 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
EFTUD2-216ENST00000590105 Q8N8P6 123 aa4.82□□□□□ -1.64
EFTUD2-216ENST00000590105 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD2-216ENST00000590105 K7EMI3 77 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD2-216ENST00000590105 SCO1O75880 301 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD2-216ENST00000590105 SCGB1C2P0DMR2 95 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD2-216ENST00000590105 RPL39P62891 51 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
EFTUD2-216ENST00000590105 ANAPC13Q9BS18 74 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD2-216ENST00000590105 GNB1LQ9BYB4 327 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD2-216ENST00000590105 RPS10P5Q9NQ39 176 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD2-216ENST00000590105 SPANXA1Q9NS26 97 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD2-216ENST00000590105 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-216ENST00000590105 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-216ENST00000590105 INAFM2P0DMQ5 153 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-216ENST00000590105 HAMPP81172 84 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-216ENST00000590105 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-216ENST00000590105 C8orf17Q9NRJ1 99 aa4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-216ENST00000590105 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
EFTUD2-216ENST00000590105 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
EFTUD2-216ENST00000590105 COX7A2LO14548 114 aa4.79□□□□□ -1.64
EFTUD2-216ENST00000590105 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
EFTUD2-216ENST00000590105 RHEBQ15382 184 aa4.79□□□□□ -1.64
EFTUD2-216ENST00000590105 BATFQ16520 125 aa4.79□□□□□ -1.64
EFTUD2-216ENST00000590105 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
EFTUD2-216ENST00000590105 Q5VSD8 79 aa4.79□□□□□ -1.64
EFTUD2-216ENST00000590105 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa4.79□□□□□ -1.64
EFTUD2-216ENST00000590105 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
EFTUD2-216ENST00000590105 FAT1Q14517 4588 aa4.79□□□□□ -1.64
EFTUD2-216ENST00000590105 APOMO95445 188 aa4.78□□□□□ -1.64
EFTUD2-216ENST00000590105 APOC3P02656 99 aa4.78□□□□□ -1.64
EFTUD2-216ENST00000590105 FABP9Q0Z7S8 132 aa4.78□□□□□ -1.64
EFTUD2-216ENST00000590105 NDUFA5Q16718 116 aa4.78□□□□□ -1.64
EFTUD2-216ENST00000590105 SCXQ7RTU7 201 aa4.78□□□□□ -1.64
EFTUD2-216ENST00000590105 C5orf38Q86SI9 138 aa4.78□□□□□ -1.64
EFTUD2-216ENST00000590105 CYSLTR1Q9Y271 337 aa4.78□□□□□ -1.64
EFTUD2-216ENST00000590105 LINC01549A6NIU2 74 aa4.77□□□□□ -1.65
EFTUD2-216ENST00000590105 MT-ND6P03923 174 aa4.77□□□□□ -1.65
EFTUD2-216ENST00000590105 TLX1NBP0CAT3 122 aa4.77□□□□□ -1.65
EFTUD2-216ENST00000590105 COX6A2Q02221 97 aa4.77□□□□□ -1.65
EFTUD2-216ENST00000590105 SYCNQ0VAF6 134 aa4.77□□□□□ -1.65
EFTUD2-216ENST00000590105 Q6ZUT4 128 aa4.77□□□□□ -1.65
EFTUD2-216ENST00000590105 SVBPQ8N300 66 aa4.77□□□□□ -1.65
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM141Q96I45 108 aa4.77□□□□□ -1.65
EFTUD2-216ENST00000590105 PKIGQ9Y2B9 76 aa4.77□□□□□ -1.65
EFTUD2-216ENST00000590105 IGIPA6NJ69 53 aa4.76□□□□□ -1.65
EFTUD2-216ENST00000590105 MP68P56378 58 aa4.76□□□□□ -1.65
EFTUD2-216ENST00000590105 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
EFTUD2-216ENST00000590105 LINC00526Q96FQ7 95 aa4.76□□□□□ -1.65
EFTUD2-216ENST00000590105 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa4.76□□□□□ -1.65
EFTUD2-216ENST00000590105 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa4.75□□□□□ -1.65
EFTUD2-216ENST00000590105 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa4.75□□□□□ -1.65
EFTUD2-216ENST00000590105 LINC01546A6NGU7 62 aa4.75□□□□□ -1.65
EFTUD2-216ENST00000590105 PANO1I0J062 215 aa4.75□□□□□ -1.65
EFTUD2-216ENST00000590105 FA2HQ7L5A8 372 aa4.75□□□□□ -1.65
EFTUD2-216ENST00000590105 TOMM6Q96B49 74 aa4.75□□□□□ -1.65
EFTUD2-216ENST00000590105 AMELXQ99217 191 aa4.75□□□□□ -1.65
EFTUD2-216ENST00000590105 C2orf88Q9BSF0 95 aa4.75□□□□□ -1.65
EFTUD2-216ENST00000590105 LINC00474Q9P2X8 69 aa4.75□□□□□ -1.65
EFTUD2-216ENST00000590105 SEC11AP67812 179 aa4.74□□□□□ -1.65
EFTUD2-216ENST00000590105 Q6ZRU5 148 aa4.74□□□□□ -1.65
EFTUD2-216ENST00000590105 OR10D4PQ8NGN7 298 aa4.74□□□□□ -1.65
EFTUD2-216ENST00000590105 CARD19Q96LW7 228 aa4.74□□□□□ -1.65
EFTUD2-216ENST00000590105 SCGB3A1Q96QR1 104 aa4.74□□□□□ -1.65
EFTUD2-216ENST00000590105 PLAC8Q9NZF1 115 aa4.74□□□□□ -1.65
EFTUD2-216ENST00000590105 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa4.73□□□□□ -1.65
EFTUD2-216ENST00000590105 UBE2D1P51668 147 aa4.73□□□□□ -1.65
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa4.73□□□□□ -1.65
EFTUD2-216ENST00000590105 SPACA4Q8TDM5 124 aa4.73□□□□□ -1.65
EFTUD2-216ENST00000590105 SMCO4Q9NRQ5 59 aa4.73□□□□□ -1.65
EFTUD2-216ENST00000590105 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa4.73□□□□□ -1.65
EFTUD2-216ENST00000590105 ABCA13Q86UQ4 5058 aa4.73□□□□□ -1.65
EFTUD2-216ENST00000590105 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa4.72□□□□□ -1.65
EFTUD2-216ENST00000590105 SPAG11BQ08648 103 aa4.72□□□□□ -1.65
EFTUD2-216ENST00000590105 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
EFTUD2-216ENST00000590105 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
EFTUD2-216ENST00000590105 A0A096LNI7 61 aa4.71□□□□□ -1.66
EFTUD2-216ENST00000590105 NDUFA1O15239 70 aa4.71□□□□□ -1.66
EFTUD2-216ENST00000590105 MT3P25713 68 aa4.71□□□□□ -1.66
EFTUD2-216ENST00000590105 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
EFTUD2-216ENST00000590105 HERVK_113P63121 156 aa4.71□□□□□ -1.66
EFTUD2-216ENST00000590105 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa4.71□□□□□ -1.66
EFTUD2-216ENST00000590105 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa4.71□□□□□ -1.66
EFTUD2-216ENST00000590105 PCLOQ9Y6V0 5065 aa4.71□□□□□ -1.66
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM223A0PJW6 202 aa4.7□□□□□ -1.66
EFTUD2-216ENST00000590105 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
EFTUD2-216ENST00000590105 C18orf32Q8TCD1 76 aa4.7□□□□□ -1.66
EFTUD2-216ENST00000590105 CST9LQ9H4G1 147 aa4.7□□□□□ -1.66
EFTUD2-216ENST00000590105 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa4.69□□□□□ -1.66
EFTUD2-216ENST00000590105 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa4.68□□□□□ -1.66
EFTUD2-216ENST00000590105 A0A1W2PNN7 141 aa4.68□□□□□ -1.66
EFTUD2-216ENST00000590105 CKS1BP61024 79 aa4.68□□□□□ -1.66
EFTUD2-216ENST00000590105 LCE1EQ5T753 118 aa4.68□□□□□ -1.66
EFTUD2-216ENST00000590105 TOMM7Q9P0U1 55 aa4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.4 ms