RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 WFDC2Q14508 124 aa14.85□□□□□ -0.03
CAPNS1-207ENST00000589146 C14orf177Q52M58 125 aa14.85□□□□□ -0.03
CAPNS1-207ENST00000589146 LECT2O14960 151 aa14.84□□□□□ -0.03
CAPNS1-207ENST00000589146 TENM2Q9NT68 2774 aa14.84□□□□□ -0.03
CAPNS1-207ENST00000589146 PSMB2P49721 201 aa14.83□□□□□ -0.04
CAPNS1-207ENST00000589146 DNAH6Q9C0G6 4158 aa14.83□□□□□ -0.04
CAPNS1-207ENST00000589146 TRIAP1O43715 76 aa14.82□□□□□ -0.04
CAPNS1-207ENST00000589146 CNBPP62633 177 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
CAPNS1-207ENST00000589146 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa14.81□□□□□ -0.04
CAPNS1-207ENST00000589146 LRCOL1A6NCL2 159 aa14.81□□□□□ -0.04
CAPNS1-207ENST00000589146 Q6ZRP5 223 aa14.81□□□□□ -0.04
CAPNS1-207ENST00000589146 Q8NDZ9 215 aa14.81□□□□□ -0.04
CAPNS1-207ENST00000589146 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa14.79□□□□□ -0.04
CAPNS1-207ENST00000589146 SCGB1C2P0DMR2 95 aa14.79□□□□□ -0.04
CAPNS1-207ENST00000589146 RPL28P46779 137 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
CAPNS1-207ENST00000589146 ALMS1Q8TCU4 4167 aa14.79□□□□□ -0.04
CAPNS1-207ENST00000589146 COX6CP09669 75 aa14.78□□□□□ -0.04
CAPNS1-207ENST00000589146 LINC00476Q8WZB0 136 aa14.78□□□□□ -0.04
CAPNS1-207ENST00000589146 XAGE1AQ9HD64 81 aa14.78□□□□□ -0.04
CAPNS1-207ENST00000589146 DNAH10Q8IVF4 4471 aa14.77□□□□□ -0.04
CAPNS1-207ENST00000589146 M0R2N4 97 aa14.77□□□□□ -0.05
CAPNS1-207ENST00000589146 PRR3P79522 188 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
CAPNS1-207ENST00000589146 TCL1BO95988 128 aa14.76□□□□□ -0.05
CAPNS1-207ENST00000589146 VPREB1P12018 145 aa14.75□□□□□ -0.05
CAPNS1-207ENST00000589146 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa14.74□□□□□ -0.05
CAPNS1-207ENST00000589146 GAGE2EQ4V326 116 aa14.74□□□□□ -0.05
CAPNS1-207ENST00000589146 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CAPNS1-207ENST00000589146 OR13C6PQ8NH95 151 aa14.74□□□□□ -0.05
CAPNS1-207ENST00000589146 SMIM11BQ8TCY0 68 aa14.74□□□□□ -0.05
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM126AQ9H061 195 aa14.74□□□□□ -0.05
CAPNS1-207ENST00000589146 GAGE2DQ9UEU5 116 aa14.74□□□□□ -0.05
CAPNS1-207ENST00000589146 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa14.74□□□□□ -0.05
CAPNS1-207ENST00000589146 LY6G6CO95867 125 aa14.73□□□□□ -0.05
CAPNS1-207ENST00000589146 NCR3O14931 201 aa14.72□□□□□ -0.05
CAPNS1-207ENST00000589146 H3BMG7 143 aa14.71□□□□□ -0.05
CAPNS1-207ENST00000589146 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CAPNS1-207ENST00000589146 IGLV6-57P01721 117 aa14.7□□□□□ -0.06
CAPNS1-207ENST00000589146 ATXN8Q156A1 80 aa14.7□□□□□ -0.06
CAPNS1-207ENST00000589146 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa14.67□□□□□ -0.06
CAPNS1-207ENST00000589146 M0R378 163 aa14.67□□□□□ -0.06
CAPNS1-207ENST00000589146 S100A7L2Q5SY68 101 aa14.67□□□□□ -0.06
CAPNS1-207ENST00000589146 C1orf134Q5TEV5 83 aa14.67□□□□□ -0.06
CAPNS1-207ENST00000589146 PRO0461Q9UI25 63 aa14.67□□□□□ -0.06
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A087WTM6 91 aa14.66□□□□□ -0.06
CAPNS1-207ENST00000589146 LST1O00453 97 aa14.66□□□□□ -0.06
CAPNS1-207ENST00000589146 Q8N814 137 aa14.66□□□□□ -0.06
CAPNS1-207ENST00000589146 F8W1H4 67 aa14.65□□□□□ -0.06
CAPNS1-207ENST00000589146 H0YGX0 51 aa14.65□□□□□ -0.06
CAPNS1-207ENST00000589146 PKIGQ9Y2B9 76 aa14.65□□□□□ -0.06
CAPNS1-207ENST00000589146 GAGE2BQ13066 116 aa14.64□□□□□ -0.07
CAPNS1-207ENST00000589146 C9orf163Q8N9P6 203 aa14.64□□□□□ -0.07
CAPNS1-207ENST00000589146 CLEC2BQ92478 149 aa14.64□□□□□ -0.07
CAPNS1-207ENST00000589146 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1-207ENST00000589146 C16orf90A8MZG2 172 aa14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1-207ENST00000589146 DNAH2Q9P225 4427 aa14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1-207ENST00000589146 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa14.61□□□□□ -0.07
CAPNS1-207ENST00000589146 LINC01620Q4KN68 170 aa14.61□□□□□ -0.07
CAPNS1-207ENST00000589146 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa14.61□□□□□ -0.07
CAPNS1-207ENST00000589146 KMT2AQ03164 3969 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPNS1-207ENST00000589146 CBY1Q9Y3M2 126 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPNS1-207ENST00000589146 TRACP01848 142 aa14.59□□□□□ -0.07
CAPNS1-207ENST00000589146 LINC01600Q96MT4 127 aa14.59□□□□□ -0.07
CAPNS1-207ENST00000589146 NKAPP1Q8N9T2 125 aa14.58□□□□□ -0.08
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A096LNI7 61 aa14.57□□□□□ -0.08
CAPNS1-207ENST00000589146 M0QXV9 152 aa14.57□□□□□ -0.08
CAPNS1-207ENST00000589146 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa14.57□□□□□ -0.08
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM218AQ96MZ4 157 aa14.57□□□□□ -0.08
CAPNS1-207ENST00000589146 DNAH17Q9UFH2 4485 aa14.56□□□□□ -0.08
CAPNS1-207ENST00000589146 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa14.56□□□□□ -0.08
CAPNS1-207ENST00000589146 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM168BA1KXE4 195 aa14.55□□□□□ -0.08
CAPNS1-207ENST00000589146 C9JAW5 83 aa14.55□□□□□ -0.08
CAPNS1-207ENST00000589146 SDIM1Q6ZPB5 146 aa14.55□□□□□ -0.08
CAPNS1-207ENST00000589146 C7orf33Q8WU49 177 aa14.55□□□□□ -0.08
CAPNS1-207ENST00000589146 C6orf99Q4VX62 202 aa14.54□□□□□ -0.08
CAPNS1-207ENST00000589146 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa14.53□□□□□ -0.08
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A1B0GX51 115 aa14.53□□□□□ -0.08
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC25A20O43772 301 aa14.53□□□□□ -0.08
CAPNS1-207ENST00000589146 MTURNQ8N3F0 131 aa14.52□□□□□ -0.09
CAPNS1-207ENST00000589146 KCNQ1DNQ9H478 68 aa14.52□□□□□ -0.09
CAPNS1-207ENST00000589146 C22orf24Q9Y442 160 aa14.52□□□□□ -0.09
CAPNS1-207ENST00000589146 DIRC1Q969H9 104 aa14.51□□□□□ -0.09
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A087WYN8 130 aa14.5□□□□□ -0.09
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CAPNS1-207ENST00000589146 LINC00474Q9P2X8 69 aa14.5□□□□□ -0.09
CAPNS1-207ENST00000589146 H3BT86 120 aa14.49□□□□□ -0.09
CAPNS1-207ENST00000589146 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa14.48□□□□□ -0.09
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CAPNS1-207ENST00000589146 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CAPNS1-207ENST00000589146 ANKRD29Q8N6D5 301 aa14.48□□□□□ -0.09
CAPNS1-207ENST00000589146 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa14.47□□□□□ -0.09
CAPNS1-207ENST00000589146 RTL8CO15255 209 aa14.47□□□□□ -0.09
CAPNS1-207ENST00000589146 LINC00167Q96N53 147 aa14.47□□□□□ -0.09
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A1W2PNN7 141 aa14.46□□□□□ -0.09
CAPNS1-207ENST00000589146 LINC00575Q6W349 94 aa14.46□□□□□ -0.09
CAPNS1-207ENST00000589146 PRYO14603 147 aa14.45□□□□□ -0.1
CAPNS1-207ENST00000589146 TNP2Q05952 138 aa14.45□□□□□ -0.1
CAPNS1-207ENST00000589146 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
CAPNS1-207ENST00000589146 EPM2AB3EWF7 344 aa14.43□□□□□ -0.1
CAPNS1-207ENST00000589146 CHTF8P0CG12 524 aa14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms