RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584558.5

ITGB4-212, Transcript of integrin subunit beta 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ITGB4, Length 2,895 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4-212ENST00000584558 KLKP1Q107X0 134 aa8.86□□□□□ -0.99
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ITGB4-212ENST00000584558 C19orf73Q9NVV2 129 aa8.86□□□□□ -0.99
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ITGB4-212ENST00000584558 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa8.85□□□□□ -0.99
ITGB4-212ENST00000584558 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa8.85□□□□□ -0.99
ITGB4-212ENST00000584558 INSP01308 110 aa8.85□□□□□ -0.99
ITGB4-212ENST00000584558 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa8.84□□□□□ -0.99
ITGB4-212ENST00000584558 Q8N814 137 aa8.84□□□□□ -0.99
ITGB4-212ENST00000584558 STHQ8IWL8 128 aa8.84□□□□□ -0.99
ITGB4-212ENST00000584558 C1orf158Q8N1D5 194 aa8.84□□□□□ -0.99
ITGB4-212ENST00000584558 C1orf195Q5TG92 126 aa8.83□□□□□ -1
ITGB4-212ENST00000584558 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa8.83□□□□□ -1
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ITGB4-212ENST00000584558 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
ITGB4-212ENST00000584558 PRR3P79522 188 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
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ITGB4-212ENST00000584558 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
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ITGB4-212ENST00000584558 LINC00167Q96N53 147 aa8.8□□□□□ -1
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ITGB4-212ENST00000584558 TM2D3Q9BRN9 247 aa8.79□□□□□ -1
ITGB4-212ENST00000584558 C6orf226Q5I0X4 101 aa8.79□□□□□ -1
ITGB4-212ENST00000584558 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa8.78□□□□□ -1
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ITGB4-212ENST00000584558 Q8N3U1 123 aa8.78□□□□□ -1
ITGB4-212ENST00000584558 SPATA3Q8NHX4 192 aa8.78□□□□□ -1
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ITGB4-212ENST00000584558 Q6ZQT0 140 aa8.77□□□□□ -1.01
ITGB4-212ENST00000584558 SCXQ7RTU7 201 aa8.77□□□□□ -1.01
ITGB4-212ENST00000584558 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa8.77□□□□□ -1.01
ITGB4-212ENST00000584558 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa8.77□□□□□ -1.01
ITGB4-212ENST00000584558 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa8.77□□□□□ -1.01
ITGB4-212ENST00000584558 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa8.77□□□□□ -1.01
ITGB4-212ENST00000584558 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa8.76□□□□□ -1.01
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ITGB4-212ENST00000584558 MIFP14174 115 aa8.76□□□□□ -1.01
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ITGB4-212ENST00000584558 C6orf99Q4VX62 202 aa8.75□□□□□ -1.01
ITGB4-212ENST00000584558 NDUFC1O43677 76 aa8.75□□□□□ -1.01
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ITGB4-212ENST00000584558 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa8.72□□□□□ -1.01
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ITGB4-212ENST00000584558 NREPQ16612 68 aa8.71□□□□□ -1.01
ITGB4-212ENST00000584558 C9orf66Q5T8R8 295 aa8.71□□□□□ -1.02
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ITGB4-212ENST00000584558 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa8.7□□□□□ -1.02
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ITGB4-212ENST00000584558 TRGV2A0A075B6R0 118 aa8.69□□□□□ -1.02
ITGB4-212ENST00000584558 CLPSL2Q6UWE3 100 aa8.69□□□□□ -1.02
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ITGB4-212ENST00000584558 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa8.67□□□□□ -1.02
ITGB4-212ENST00000584558 C6orf223Q8N319 242 aa8.67□□□□□ -1.02
ITGB4-212ENST00000584558 BPY2O14599 106 aa8.67□□□□□ -1.02
ITGB4-212ENST00000584558 Q6ZQY7 126 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGB4-212ENST00000584558 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGB4-212ENST00000584558 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa8.66□□□□□ -1.02
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ITGB4-212ENST00000584558 Q8N9L7 120 aa8.65□□□□□ -1.03
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ITGB4-212ENST00000584558 Q8NDZ9 215 aa8.64□□□□□ -1.03
ITGB4-212ENST00000584558 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP8.64□□□□□ -1.03
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ITGB4-212ENST00000584558 X6R8D5 127 aa8.64□□□□□ -1.03
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ITGB4-212ENST00000584558 LINC00612Q8N6U2 182 aa8.63□□□□□ -1.03
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ITGB4-212ENST00000584558 LRCOL1A6NCL2 159 aa8.61□□□□□ -1.03
ITGB4-212ENST00000584558 PDE6GP18545 87 aa8.61□□□□□ -1.03
ITGB4-212ENST00000584558 LINC00269Q8N2A0 174 aa8.6□□□□□ -1.03
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ITGB4-212ENST00000584558 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa8.57□□□□□ -1.04
ITGB4-212ENST00000584558 Q6ZTC4 211 aa8.57□□□□□ -1.04
ITGB4-212ENST00000584558 ERC2-IT1O76042 136 aa8.57□□□□□ -1.04
ITGB4-212ENST00000584558 COX17Q14061 63 aa8.57□□□□□ -1.04
ITGB4-212ENST00000584558 CD164L2Q6UWJ8 174 aa8.56□□□□□ -1.04
ITGB4-212ENST00000584558 APOC4P55056 127 aa8.56□□□□□ -1.04
ITGB4-212ENST00000584558 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa8.56□□□□□ -1.04
ITGB4-212ENST00000584558 KIAA0087Q14695 138 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGB4-212ENST00000584558 TENM3Q9P273 2699 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGB4-212ENST00000584558 A0A096LPF7 62 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGB4-212ENST00000584558 DEFB135Q30KP9 77 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGB4-212ENST00000584558 OCR1Q9BZK8 76 aa8.55□□□□□ -1.04
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