RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 H3BQ85 93 aa5.59□□□□□ -1.51
GGA3-218ENST00000584243 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa5.59□□□□□ -1.51
GGA3-218ENST00000584243 Q6Q795 121 aa5.59□□□□□ -1.51
GGA3-218ENST00000584243 H7C2G1 150 aa5.58□□□□□ -1.52
GGA3-218ENST00000584243 RPL28P46779 137 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
GGA3-218ENST00000584243 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
GGA3-218ENST00000584243 Q5VSD8 79 aa5.58□□□□□ -1.52
GGA3-218ENST00000584243 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa5.57□□□□□ -1.52
GGA3-218ENST00000584243 H3BNG1 76 aa5.57□□□□□ -1.52
GGA3-218ENST00000584243 DNAL4O96015 105 aa5.57□□□□□ -1.52
GGA3-218ENST00000584243 ATP5G1P05496 136 aa5.57□□□□□ -1.52
GGA3-218ENST00000584243 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa5.57□□□□□ -1.52
GGA3-218ENST00000584243 AGRNO00468 2067 aa5.56□□□□□ -1.52
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
GGA3-218ENST00000584243 PAX4O43316 350 aa5.56□□□□□ -1.52
GGA3-218ENST00000584243 NDUFC2O95298 119 aa5.56□□□□□ -1.52
GGA3-218ENST00000584243 SPART-AS1P0CW21 52 aa5.56□□□□□ -1.52
GGA3-218ENST00000584243 GYPEP15421 78 aa5.56□□□□□ -1.52
GGA3-218ENST00000584243 COX6A2Q02221 97 aa5.56□□□□□ -1.52
GGA3-218ENST00000584243 CD164L2Q6UWJ8 174 aa5.56□□□□□ -1.52
GGA3-218ENST00000584243 IMUPQ9GZP8 106 aa5.56□□□□□ -1.52
GGA3-218ENST00000584243 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa5.55□□□□□ -1.52
GGA3-218ENST00000584243 PRM2P04554 102 aa5.55□□□□□ -1.52
GGA3-218ENST00000584243 DEFB130BP0DP73 79 aa5.55□□□□□ -1.52
GGA3-218ENST00000584243 DEFB130AP0DP74 79 aa5.55□□□□□ -1.52
GGA3-218ENST00000584243 GAGE6Q13070 117 aa5.55□□□□□ -1.52
GGA3-218ENST00000584243 C6orf226Q5I0X4 101 aa5.55□□□□□ -1.52
GGA3-218ENST00000584243 CFAP161Q6P656 301 aa5.55□□□□□ -1.52
GGA3-218ENST00000584243 DAND5Q8N907 189 aa5.55□□□□□ -1.52
GGA3-218ENST00000584243 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa5.55□□□□□ -1.52
GGA3-218ENST00000584243 Q9UF83 564 aa5.55□□□□□ -1.52
GGA3-218ENST00000584243 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
GGA3-218ENST00000584243 X6R8D5 127 aa5.55□□□□□ -1.52
GGA3-218ENST00000584243 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa5.54□□□□□ -1.52
GGA3-218ENST00000584243 F8WDY8 70 aa5.54□□□□□ -1.52
GGA3-218ENST00000584243 LCE2BO14633 110 aa5.54□□□□□ -1.52
GGA3-218ENST00000584243 CKS1BP61024 79 aa5.54□□□□□ -1.52
GGA3-218ENST00000584243 DAD1P61803 113 aa5.54□□□□□ -1.52
GGA3-218ENST00000584243 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
GGA3-218ENST00000584243 CDIP1Q9H305 208 aa5.54□□□□□ -1.52
GGA3-218ENST00000584243 TNXBP22105 4242 aa5.53□□□□□ -1.52
GGA3-218ENST00000584243 LINC00158P58513 81 aa5.53□□□□□ -1.52
GGA3-218ENST00000584243 GAGE2BQ13066 116 aa5.53□□□□□ -1.52
GGA3-218ENST00000584243 GAGE2EQ4V326 116 aa5.53□□□□□ -1.52
GGA3-218ENST00000584243 LELP1Q5T871 98 aa5.53□□□□□ -1.52
GGA3-218ENST00000584243 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa5.53□□□□□ -1.52
GGA3-218ENST00000584243 GAGE2DQ9UEU5 116 aa5.53□□□□□ -1.52
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.52□□□□□ -1.53
GGA3-218ENST00000584243 MALP21145 153 aa5.52□□□□□ -1.53
GGA3-218ENST00000584243 TMEM126AQ9H061 195 aa5.52□□□□□ -1.53
GGA3-218ENST00000584243 TOMM7Q9P0U1 55 aa5.52□□□□□ -1.53
GGA3-218ENST00000584243 NACAE9PAV3 2078 aa5.51□□□□□ -1.53
GGA3-218ENST00000584243 S100A7L2Q5SY68 101 aa5.51□□□□□ -1.53
GGA3-218ENST00000584243 WFDC10AQ9H1F0 79 aa5.51□□□□□ -1.53
GGA3-218ENST00000584243 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa5.5□□□□□ -1.53
GGA3-218ENST00000584243 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
GGA3-218ENST00000584243 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa5.5□□□□□ -1.53
GGA3-218ENST00000584243 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa5.5□□□□□ -1.53
GGA3-218ENST00000584243 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa5.49□□□□□ -1.53
GGA3-218ENST00000584243 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa5.49□□□□□ -1.53
GGA3-218ENST00000584243 M0R2N4 97 aa5.49□□□□□ -1.53
GGA3-218ENST00000584243 XGP55808 180 aa5.49□□□□□ -1.53
GGA3-218ENST00000584243 NPC2P61916 151 aa5.49□□□□□ -1.53
GGA3-218ENST00000584243 REG3AQ06141 175 aa5.49□□□□□ -1.53
GGA3-218ENST00000584243 TTC32Q5I0X7 151 aa5.49□□□□□ -1.53
GGA3-218ENST00000584243 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa5.49□□□□□ -1.53
GGA3-218ENST00000584243 LINC00643Q86TS7 51 aa5.49□□□□□ -1.53
GGA3-218ENST00000584243 C15orf53Q8NAA6 179 aa5.49□□□□□ -1.53
GGA3-218ENST00000584243 Q8NAQ8 132 aa5.49□□□□□ -1.53
GGA3-218ENST00000584243 CLEC2BQ92478 149 aa5.49□□□□□ -1.53
GGA3-218ENST00000584243 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
GGA3-218ENST00000584243 A0A0J9YWU9 116 aa5.48□□□□□ -1.53
GGA3-218ENST00000584243 BAALC-AS2P0C853 105 aa5.48□□□□□ -1.53
GGA3-218ENST00000584243 XCL1P47992 114 aa5.48□□□□□ -1.53
GGA3-218ENST00000584243 CCL18P55774 89 aa5.48□□□□□ -1.53
GGA3-218ENST00000584243 DEFB135Q30KP9 77 aa5.48□□□□□ -1.53
GGA3-218ENST00000584243 PRR34Q9NV39 138 aa5.48□□□□□ -1.53
GGA3-218ENST00000584243 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa5.47□□□□□ -1.53
GGA3-218ENST00000584243 ANGP03950 147 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
GGA3-218ENST00000584243 PDE6GP18545 87 aa5.47□□□□□ -1.53
GGA3-218ENST00000584243 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
GGA3-218ENST00000584243 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa5.47□□□□□ -1.53
GGA3-218ENST00000584243 C5orf38Q86SI9 138 aa5.47□□□□□ -1.53
GGA3-218ENST00000584243 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
GGA3-218ENST00000584243 ANAPC13Q9BS18 74 aa5.47□□□□□ -1.53
GGA3-218ENST00000584243 ORMDL1Q9P0S3 153 aa5.47□□□□□ -1.53
GGA3-218ENST00000584243 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa5.46□□□□□ -1.54
GGA3-218ENST00000584243 MT-ATP8P03928 68 aa5.46□□□□□ -1.54
GGA3-218ENST00000584243 LINC00269Q8N2A0 174 aa5.46□□□□□ -1.54
GGA3-218ENST00000584243 LINC00337Q8N6G1 96 aa5.46□□□□□ -1.54
GGA3-218ENST00000584243 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa5.45□□□□□ -1.54
GGA3-218ENST00000584243 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa5.45□□□□□ -1.54
GGA3-218ENST00000584243 A0A0U1RRA0 63 aa5.45□□□□□ -1.54
GGA3-218ENST00000584243 IGKV2D-28P01615 120 aa5.45□□□□□ -1.54
GGA3-218ENST00000584243 PFN2P35080 140 aa5.45□□□□□ -1.54
GGA3-218ENST00000584243 SDIM1Q6ZPB5 146 aa5.45□□□□□ -1.54
GGA3-218ENST00000584243 OR13C6PQ8NH95 151 aa5.45□□□□□ -1.54
GGA3-218ENST00000584243 SMIM11BQ8TCY0 68 aa5.45□□□□□ -1.54
GGA3-218ENST00000584243 LINC00167Q96N53 147 aa5.45□□□□□ -1.54
GGA3-218ENST00000584243 APLNQ9ULZ1 77 aa5.45□□□□□ -1.54
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