RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582232.1

GGA3-211, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene GGA3, Length 598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-211ENST00000582232 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-211ENST00000582232 HIGD1BQ9P298 99 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-211ENST00000582232 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-211ENST00000582232 XAGE1AQ9HD64 81 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-211ENST00000582232 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
GGA3-211ENST00000582232 DAND5Q8N907 189 aa7.29□□□□□ -1.24
GGA3-211ENST00000582232 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.29□□□□□ -1.24
GGA3-211ENST00000582232 UQCR10Q9UDW1 63 aa7.29□□□□□ -1.24
GGA3-211ENST00000582232 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7.29□□□□□ -1.24
GGA3-211ENST00000582232 A0A087WYN8 130 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-211ENST00000582232 IFITM1P13164 125 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-211ENST00000582232 C2orf91Q6ZV80 131 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-211ENST00000582232 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-211ENST00000582232 COPS9Q8WXC6 57 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-211ENST00000582232 APOBP04114 4563 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
GGA3-211ENST00000582232 PCLOQ9Y6V0 5065 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-211ENST00000582232 KIAA1109Q2LD37 5005 aa7.27□□□□□ -1.24
GGA3-211ENST00000582232 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-211ENST00000582232 A0A1W2PNN7 141 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-211ENST00000582232 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-211ENST00000582232 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-211ENST00000582232 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-211ENST00000582232 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
GGA3-211ENST00000582232 SCXQ7RTU7 201 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-211ENST00000582232 DPH3Q96FX2 82 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-211ENST00000582232 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-211ENST00000582232 FAM168BA1KXE4 195 aa7.25□□□□□ -1.25
GGA3-211ENST00000582232 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
GGA3-211ENST00000582232 CDK2AP2O75956 126 aa7.25□□□□□ -1.25
GGA3-211ENST00000582232 NDUFC2O95298 119 aa7.25□□□□□ -1.25
GGA3-211ENST00000582232 VPREB1P12018 145 aa7.25□□□□□ -1.25
GGA3-211ENST00000582232 XGP55808 180 aa7.25□□□□□ -1.25
GGA3-211ENST00000582232 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
GGA3-211ENST00000582232 TAL2Q16559 108 aa7.25□□□□□ -1.25
GGA3-211ENST00000582232 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.25□□□□□ -1.25
GGA3-211ENST00000582232 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-211ENST00000582232 Q8NDZ9 215 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-211ENST00000582232 PRO1933Q9H354 126 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-211ENST00000582232 RYR1P21817 5038 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-211ENST00000582232 TSTD3H0UI37 97 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-211ENST00000582232 NPC2P61916 151 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-211ENST00000582232 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
GGA3-211ENST00000582232 HIST1H4GQ99525 98 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-211ENST00000582232 C22orf24Q9Y442 160 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-211ENST00000582232 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-211ENST00000582232 M0QXV9 152 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-211ENST00000582232 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
GGA3-211ENST00000582232 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
GGA3-211ENST00000582232 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
GGA3-211ENST00000582232 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-211ENST00000582232 M0R378 163 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-211ENST00000582232 HSD52Q0P140 79 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-211ENST00000582232 HSPG2P98160 4391 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-211ENST00000582232 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-211ENST00000582232 IGKV2D-28P01615 120 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-211ENST00000582232 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
GGA3-211ENST00000582232 HAMPP81172 84 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-211ENST00000582232 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
GGA3-211ENST00000582232 CEND1Q8N111 149 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-211ENST00000582232 C7orf33Q8WU49 177 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-211ENST00000582232 LINC00167Q96N53 147 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-211ENST00000582232 A4D1N5 150 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-211ENST00000582232 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.17□□□□□ -1.26
GGA3-211ENST00000582232 NCR3O14931 201 aa7.17□□□□□ -1.26
GGA3-211ENST00000582232 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa7.17□□□□□ -1.26
GGA3-211ENST00000582232 IGLV6-57P01721 117 aa7.16□□□□□ -1.26
GGA3-211ENST00000582232 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.16□□□□□ -1.26
GGA3-211ENST00000582232 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.15□□□□□ -1.26
GGA3-211ENST00000582232 GAGE10A6NGK3 116 aa7.15□□□□□ -1.26
GGA3-211ENST00000582232 A6NJY4 79 aa7.15□□□□□ -1.26
GGA3-211ENST00000582232 DDTP30046 118 aa7.15□□□□□ -1.26
GGA3-211ENST00000582232 FXYD2P54710 66 aa7.15□□□□□ -1.26
GGA3-211ENST00000582232 TMEM126AQ9H061 195 aa7.15□□□□□ -1.26
GGA3-211ENST00000582232 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-211ENST00000582232 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-211ENST00000582232 UBE2BP63146 152 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-211ENST00000582232 CTAG1AP78358 180 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-211ENST00000582232 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-211ENST00000582232 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-211ENST00000582232 A0A0B4J2C4 111 aa7.13□□□□□ -1.27
GGA3-211ENST00000582232 RPL37AP8A6NKH3 93 aa7.13□□□□□ -1.27
GGA3-211ENST00000582232 CFC1BP0CG36 223 aa7.13□□□□□ -1.27
GGA3-211ENST00000582232 CFC1P0CG37 223 aa7.13□□□□□ -1.27
GGA3-211ENST00000582232 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.13□□□□□ -1.27
GGA3-211ENST00000582232 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.13□□□□□ -1.27
GGA3-211ENST00000582232 CBY1Q9Y3M2 126 aa7.13□□□□□ -1.27
GGA3-211ENST00000582232 ABCA13Q86UQ4 5058 aa7.13□□□□□ -1.27
GGA3-211ENST00000582232 FAT1Q14517 4588 aa7.13□□□□□ -1.27
GGA3-211ENST00000582232 A0A1B0GWB2 263 aa7.12□□□□□ -1.27
GGA3-211ENST00000582232 PRYO14603 147 aa7.12□□□□□ -1.27
GGA3-211ENST00000582232 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
GGA3-211ENST00000582232 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa7.12□□□□□ -1.27
GGA3-211ENST00000582232 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.12□□□□□ -1.27
GGA3-211ENST00000582232 M0R143 59 aa7.11□□□□□ -1.27
GGA3-211ENST00000582232 SPRR1AP35321 89 aa7.11□□□□□ -1.27
GGA3-211ENST00000582232 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.11□□□□□ -1.27
GGA3-211ENST00000582232 A6NDN8 102 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-211ENST00000582232 REG3GQ6UW15 175 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-211ENST00000582232 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-211ENST00000582232 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
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