RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580838.1

PTPRM-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 676 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-212ENST00000580838 ESM1Q9NQ30 184 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRM-212ENST00000580838 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
PTPRM-212ENST00000580838 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRM-212ENST00000580838 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
PTPRM-212ENST00000580838 A0A0J9YWU9 116 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRM-212ENST00000580838 ANGP03950 147 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
PTPRM-212ENST00000580838 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRM-212ENST00000580838 HILS1P60008 231 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRM-212ENST00000580838 DAD1P61803 113 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRM-212ENST00000580838 REG3AQ06141 175 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRM-212ENST00000580838 SPAG11BQ08648 103 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRM-212ENST00000580838 KIAA0087Q14695 138 aa3.94□□□□□ -1.78
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PTPRM-212ENST00000580838 ZNF843Q8N446 348 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRM-212ENST00000580838 DSCR8Q96T75 97 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRM-212ENST00000580838 CHD6Q8TD26 2715 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRM-212ENST00000580838 COL12A1Q99715 3063 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRM-212ENST00000580838 PIEZO1Q92508 2521 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRM-212ENST00000580838 ZANQ9Y493 2812 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRM-212ENST00000580838 CSMD1Q96PZ7 3565 aa3.93□□□□□ -1.78
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PTPRM-212ENST00000580838 F8WDY8 70 aa3.93□□□□□ -1.78
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PTPRM-212ENST00000580838 C6orf99Q4VX62 202 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRM-212ENST00000580838 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
PTPRM-212ENST00000580838 LINC00269Q8N2A0 174 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRM-212ENST00000580838 DIRC1Q969H9 104 aa3.93□□□□□ -1.78
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PTPRM-212ENST00000580838 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa3.92□□□□□ -1.78
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PTPRM-212ENST00000580838 C5orf47Q569G3 176 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRM-212ENST00000580838 Q6ZQT0 140 aa3.92□□□□□ -1.78
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PTPRM-212ENST00000580838 TEX15Q9BXT5 2789 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRM-212ENST00000580838 FAM208BQ5VWN6 2430 aa3.91□□□□□ -1.78
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PTPRM-212ENST00000580838 C3orf56Q8N813 242 aa3.91□□□□□ -1.78
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PTPRM-212ENST00000580838 FAM236CP0DP71 79 aa3.88□□□□□ -1.79
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PTPRM-212ENST00000580838 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
PTPRM-212ENST00000580838 C20orf197Q8N268 126 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRM-212ENST00000580838 Q8NAQ8 132 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRM-212ENST00000580838 CAMK2N2Q96S95 79 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRM-212ENST00000580838 KLK12Q9UKR0 248 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRM-212ENST00000580838 VPS13CQ709C8 3753 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRM-212ENST00000580838 WNK1Q9H4A3 2382 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRM-212ENST00000580838 C6orf48Q9UBA6 75 aa3.85□□□□□ -1.79
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