RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRM-211ENST00000580170 IGKV2-30P06310 120 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRM-211ENST00000580170 IGF2RP11717 2491 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRM-211ENST00000580170 FSHBP01225 129 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRM-211ENST00000580170 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRM-211ENST00000580170 H3BPC8 53 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRM-211ENST00000580170 PTPRBP23467 1997 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRM-211ENST00000580170 MOBPQ13875 183 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRM-211ENST00000580170 A0A1B0GW54 56 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRM-211ENST00000580170 MDFIQ99750 246 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRM-211ENST00000580170 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRM-211ENST00000580170 NCOR2Q9Y618 2525 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRM-211ENST00000580170 MYO18BQ8IUG5 2567 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRM-211ENST00000580170 A8MUN3 132 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRM-211ENST00000580170 SPINT4Q6UDR6 99 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRM-211ENST00000580170 Q6ZRX8 168 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRM-211ENST00000580170 H3BNG1 76 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRM-211ENST00000580170 LINC00476Q8WZB0 136 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRM-211ENST00000580170 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
PTPRM-211ENST00000580170 SPACA4Q8TDM5 124 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRM-211ENST00000580170 COL4A2P08572 1712 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRM-211ENST00000580170 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRM-211ENST00000580170 TRAV22A0A0B4J277 110 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRM-211ENST00000580170 Q8NBF4 154 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRM-211ENST00000580170 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRM-211ENST00000580170 LITAFQ99732 161 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRM-211ENST00000580170 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRM-211ENST00000580170 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRM-211ENST00000580170 LINC00336Q6ZUF6 198 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRM-211ENST00000580170 CD164Q04900 197 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRM-211ENST00000580170 ERC2-IT1O76042 136 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRM-211ENST00000580170 EPM2AB3EWF7 344 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRM-211ENST00000580170 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
PTPRM-211ENST00000580170 MYO9AB2RTY4 2548 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRM-211ENST00000580170 Q8NAQ8 132 aa14.43□□□□□ -0.1
PTPRM-211ENST00000580170 CHTF8P0CG12 524 aa14.43□□□□□ -0.1
PTPRM-211ENST00000580170 C16orf90A8MZG2 172 aa14.42□□□□□ -0.1
PTPRM-211ENST00000580170 COA5Q86WW8 74 aa14.42□□□□□ -0.1
PTPRM-211ENST00000580170 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP14.42□□□□□ -0.1
PTPRM-211ENST00000580170 KLK9Q2XQG4 91 aa14.4□□□□□ -0.1
PTPRM-211ENST00000580170 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP14.4□□□□□ -0.1
PTPRM-211ENST00000580170 LINC00588Q9Y4M8 146 aa14.4□□□□□ -0.1
PTPRM-211ENST00000580170 Q6ZRP5 223 aa14.4□□□□□ -0.1
PTPRM-211ENST00000580170 RTL8CO15255 209 aa14.39□□□□□ -0.11
PTPRM-211ENST00000580170 LINC00313P59037 77 aa14.39□□□□□ -0.11
PTPRM-211ENST00000580170 IGLV6-57P01721 117 aa14.38□□□□□ -0.11
PTPRM-211ENST00000580170 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa14.38□□□□□ -0.11
PTPRM-211ENST00000580170 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa14.37□□□□□ -0.11
PTPRM-211ENST00000580170 KLKP1Q107X0 134 aa14.36□□□□□ -0.11
PTPRM-211ENST00000580170 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa14.36□□□□□ -0.11
PTPRM-211ENST00000580170 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa14.34□□□□□ -0.11
PTPRM-211ENST00000580170 FAM168BA1KXE4 195 aa14.34□□□□□ -0.11
PTPRM-211ENST00000580170 MUC4Q99102 2169 aa14.33□□□□□ -0.12
PTPRM-211ENST00000580170 EP400Q96L91 3159 aa14.33□□□□□ -0.12
PTPRM-211ENST00000580170 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa14.33□□□□□ -0.12
PTPRM-211ENST00000580170 LINC01600Q96MT4 127 aa14.33□□□□□ -0.12
PTPRM-211ENST00000580170 K7EQZ3 153 aa14.31□□□□□ -0.12
PTPRM-211ENST00000580170 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa14.31□□□□□ -0.12
PTPRM-211ENST00000580170 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa14.31□□□□□ -0.12
PTPRM-211ENST00000580170 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa14.31□□□□□ -0.12
PTPRM-211ENST00000580170 UQCR11O14957 56 aa14.3□□□□□ -0.12
PTPRM-211ENST00000580170 TYMSOSQ8TAI1 123 aa14.28□□□□□ -0.12
PTPRM-211ENST00000580170 H7BZZ5 65 aa14.27□□□□□ -0.12
PTPRM-211ENST00000580170 A8MWP4 228 aa14.27□□□□□ -0.13
PTPRM-211ENST00000580170 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
PTPRM-211ENST00000580170 PCSK5Q92824 1860 aa14.26□□□□□ -0.13
PTPRM-211ENST00000580170 LCA10Q71F78 164 aa14.26□□□□□ -0.13
PTPRM-211ENST00000580170 DNAH10OSP0CZ25 163 aa14.25□□□□□ -0.13
PTPRM-211ENST00000580170 PIEZO1Q92508 2521 aa14.25□□□□□ -0.13
PTPRM-211ENST00000580170 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa14.23□□□□□ -0.13
PTPRM-211ENST00000580170 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
PTPRM-211ENST00000580170 Q96NJ1 140 aa14.23□□□□□ -0.13
PTPRM-211ENST00000580170 ABCA12Q86UK0 2595 aa14.22□□□□□ -0.13
PTPRM-211ENST00000580170 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa14.22□□□□□ -0.13
PTPRM-211ENST00000580170 MIR22HGQ0VDD5 57 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRM-211ENST00000580170 KCNQ1DNQ9H478 68 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRM-211ENST00000580170 LRRK2Q5S007 2527 aa14.19□□□□□ -0.14
PTPRM-211ENST00000580170 FN1P02751 2386 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
PTPRM-211ENST00000580170 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
PTPRM-211ENST00000580170 JMJD1CQ15652 2540 aa14.17□□□□□ -0.14
PTPRM-211ENST00000580170 LINC00528Q8N1L1 170 aa14.17□□□□□ -0.14
PTPRM-211ENST00000580170 IGFL1Q6UW32 110 aa14.14□□□□□ -0.15
PTPRM-211ENST00000580170 FAM229AH3BQW9 127 aa14.13□□□□□ -0.15
PTPRM-211ENST00000580170 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
PTPRM-211ENST00000580170 C15orf56Q8N910 161 aa14.09□□□□□ -0.15
PTPRM-211ENST00000580170 TLN2Q9Y4G6 2542 aa14.09□□□□□ -0.15
PTPRM-211ENST00000580170 CRIPTQ9P021 101 aa14.08□□□□□ -0.15
PTPRM-211ENST00000580170 PRR15Q8IV56 129 aa14.07□□□□□ -0.16
PTPRM-211ENST00000580170 PRR34Q9NV39 138 aa14.07□□□□□ -0.16
PTPRM-211ENST00000580170 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
PTPRM-211ENST00000580170 Q8N377 158 aa14.05□□□□□ -0.16
PTPRM-211ENST00000580170 WIPF1O43516 503 aa14.04□□□□□ -0.16
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF462Q96JM2 2506 aa14.04□□□□□ -0.16
PTPRM-211ENST00000580170 C8orf17Q9NRJ1 99 aa14.04□□□□□ -0.16
PTPRM-211ENST00000580170 DSCR10P59022 87 aa14.03□□□□□ -0.16
PTPRM-211ENST00000580170 KRTAP10-11P60412 298 aa14.03□□□□□ -0.16
PTPRM-211ENST00000580170 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP14.02□□□□□ -0.17
PTPRM-211ENST00000580170 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa14□□□□□ -0.17
PTPRM-211ENST00000580170 A0A0G2JQZ4 141 aa14□□□□□ -0.17
PTPRM-211ENST00000580170 A0A1W2PNN7 141 aa14□□□□□ -0.17
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