RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561256.5

USP3-AS1-210, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene USP3-AS1, Length 562 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-210ENST00000561256 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa10.24□□□□□ -0.77
USP3-AS1-210ENST00000561256 LINC00587B1AMM8 73 aa10.23□□□□□ -0.77
USP3-AS1-210ENST00000561256 LINC00158P58513 81 aa10.23□□□□□ -0.77
USP3-AS1-210ENST00000561256 RPL24P83731 157 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
USP3-AS1-210ENST00000561256 DPM2O94777 84 aa10.22□□□□□ -0.77
USP3-AS1-210ENST00000561256 HERVK_113P61574 105 aa10.22□□□□□ -0.77
USP3-AS1-210ENST00000561256 HERV-K104P63124 156 aa10.22□□□□□ -0.77
USP3-AS1-210ENST00000561256 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa10.22□□□□□ -0.77
USP3-AS1-210ENST00000561256 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa10.21□□□□□ -0.77
USP3-AS1-210ENST00000561256 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
USP3-AS1-210ENST00000561256 HIST1H2BKO60814 126 aa10.2□□□□□ -0.78
USP3-AS1-210ENST00000561256 HIST1H2BJP06899 126 aa10.2□□□□□ -0.78
USP3-AS1-210ENST00000561256 HIST1H2BOP23527 126 aa10.2□□□□□ -0.78
USP3-AS1-210ENST00000561256 HIST1H2BBP33778 126 aa10.2□□□□□ -0.78
USP3-AS1-210ENST00000561256 HIST1H2BDP58876 126 aa10.2□□□□□ -0.78
USP3-AS1-210ENST00000561256 HIST1H2BCP62807 126 aa10.2□□□□□ -0.78
USP3-AS1-210ENST00000561256 HIST2H2BEQ16778 126 aa10.2□□□□□ -0.78
USP3-AS1-210ENST00000561256 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
USP3-AS1-210ENST00000561256 HIST1H2BHQ93079 126 aa10.2□□□□□ -0.78
USP3-AS1-210ENST00000561256 LINC00167Q96N53 147 aa10.2□□□□□ -0.78
USP3-AS1-210ENST00000561256 HIST1H2BNQ99877 126 aa10.2□□□□□ -0.78
USP3-AS1-210ENST00000561256 HIST1H2BMQ99879 126 aa10.2□□□□□ -0.78
USP3-AS1-210ENST00000561256 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa10.19□□□□□ -0.78
USP3-AS1-210ENST00000561256 GAGE10A6NGK3 116 aa10.19□□□□□ -0.78
USP3-AS1-210ENST00000561256 RPL37AP8A6NKH3 93 aa10.19□□□□□ -0.78
USP3-AS1-210ENST00000561256 MEIG1Q5JSS6 88 aa10.19□□□□□ -0.78
USP3-AS1-210ENST00000561256 PLEKHB2Q96CS7 222 aa10.19□□□□□ -0.78
USP3-AS1-210ENST00000561256 A0A087X002 238 aa10.18□□□□□ -0.78
USP3-AS1-210ENST00000561256 IGKCP01834 107 aa10.18□□□□□ -0.78
USP3-AS1-210ENST00000561256 TYMSOSQ8TAI1 123 aa10.18□□□□□ -0.78
USP3-AS1-210ENST00000561256 NDUFA12Q9UI09 145 aa10.18□□□□□ -0.78
USP3-AS1-210ENST00000561256 LEPROTO15243 131 aa10.17□□□□□ -0.78
USP3-AS1-210ENST00000561256 RPL28P46779 137 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
USP3-AS1-210ENST00000561256 A0A0U1RRA0 63 aa10.16□□□□□ -0.78
USP3-AS1-210ENST00000561256 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa10.16□□□□□ -0.78
USP3-AS1-210ENST00000561256 BCE1O60756 84 aa10.16□□□□□ -0.78
USP3-AS1-210ENST00000561256 CRYGAP11844 174 aa10.16□□□□□ -0.78
USP3-AS1-210ENST00000561256 PMCHL2Q9BQD1 86 aa10.15□□□□□ -0.78
USP3-AS1-210ENST00000561256 FAT4Q6V0I7 4981 aa10.14□□□□□ -0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 SMIM13P0DJ93 91 aa10.14□□□□□ -0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 VPREB1P12018 145 aa10.14□□□□□ -0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa10.13□□□□□ -0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa10.13□□□□□ -0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 J3QQQ9 107 aa10.13□□□□□ -0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 IGKV2D-28P01615 120 aa10.13□□□□□ -0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 NMUP48645 174 aa10.13□□□□□ -0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 S100A1P23297 94 aa10.12□□□□□ -0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 UBE2AP49459 152 aa10.12□□□□□ -0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa10.11□□□□□ -0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 RETNLBQ9BQ08 111 aa10.11□□□□□ -0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 M0R378 163 aa10.1□□□□□ -0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 PET117Q6UWS5 81 aa10.1□□□□□ -0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 BOD1L2Q8IYS8 172 aa10.1□□□□□ -0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 CDIP1Q9H305 208 aa10.09□□□□□ -0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 ANAPC11Q9NYG5 84 aa10.09□□□□□ -0.79
USP3-AS1-210ENST00000561256 TSPEAR-AS2P59090 65 aa10.08□□□□□ -0.8
USP3-AS1-210ENST00000561256 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
USP3-AS1-210ENST00000561256 MIEN1Q9BRT3 115 aa10.07□□□□□ -0.8
USP3-AS1-210ENST00000561256 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa10.06□□□□□ -0.8
USP3-AS1-210ENST00000561256 E9PLD3 99 aa10.06□□□□□ -0.8
USP3-AS1-210ENST00000561256 S100A12P80511 92 aa10.06□□□□□ -0.8
USP3-AS1-210ENST00000561256 LINC01545Q5VT33 79 aa10.06□□□□□ -0.8
USP3-AS1-210ENST00000561256 TMEM126AQ9H061 195 aa10.06□□□□□ -0.8
USP3-AS1-210ENST00000561256 C20orf202A1L168 122 aa10.05□□□□□ -0.8
USP3-AS1-210ENST00000561256 KRTDAPP60985 99 aa10.05□□□□□ -0.8
USP3-AS1-210ENST00000561256 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa10.05□□□□□ -0.8
USP3-AS1-210ENST00000561256 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa10.05□□□□□ -0.8
USP3-AS1-210ENST00000561256 LINC00304Q8N9R0 145 aa10.05□□□□□ -0.8
USP3-AS1-210ENST00000561256 TMEM238C9JI98 176 aa10.04□□□□□ -0.8
USP3-AS1-210ENST00000561256 TPRXLQ17RH7 258 aa10.04□□□□□ -0.8
USP3-AS1-210ENST00000561256 Q8NDZ9 215 aa10.04□□□□□ -0.8
USP3-AS1-210ENST00000561256 C3orf79P0CE67 100 aa10.03□□□□□ -0.8
USP3-AS1-210ENST00000561256 AKR1D1P51857 326 aa10.03□□□□□ -0.8
USP3-AS1-210ENST00000561256 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa10.02□□□□□ -0.81
USP3-AS1-210ENST00000561256 NCR3O14931 201 aa10.02□□□□□ -0.81
USP3-AS1-210ENST00000561256 FAM229BQ4G0N7 80 aa10.02□□□□□ -0.81
USP3-AS1-210ENST00000561256 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa10.01□□□□□ -0.81
USP3-AS1-210ENST00000561256 DAND5Q8N907 189 aa10.01□□□□□ -0.81
USP3-AS1-210ENST00000561256 MUC17Q685J3 4493 aa10□□□□□ -0.81
USP3-AS1-210ENST00000561256 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa10□□□□□ -0.81
USP3-AS1-210ENST00000561256 PRYO14603 147 aa10□□□□□ -0.81
USP3-AS1-210ENST00000561256 PRLHP81277 87 aa10□□□□□ -0.81
USP3-AS1-210ENST00000561256 ARL17AQ8IVW1 177 aa10□□□□□ -0.81
USP3-AS1-210ENST00000561256 A0A0J9YXY3 114 aa9.99□□□□□ -0.81
USP3-AS1-210ENST00000561256 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa9.98□□□□□ -0.81
USP3-AS1-210ENST00000561256 NDUFC2O95298 119 aa9.97□□□□□ -0.81
USP3-AS1-210ENST00000561256 S100A2P29034 98 aa9.97□□□□□ -0.81
USP3-AS1-210ENST00000561256 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
USP3-AS1-210ENST00000561256 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa9.96□□□□□ -0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa9.96□□□□□ -0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF815PA8K554 130 aa9.96□□□□□ -0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 S100A6P06703 90 aa9.96□□□□□ -0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 S100A7L2Q5SY68 101 aa9.96□□□□□ -0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 HIGD2AQ9BW72 106 aa9.96□□□□□ -0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 KCNQ1DNQ9H478 68 aa9.96□□□□□ -0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 TIMM17BO60830 172 aa9.95□□□□□ -0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 DDTP30046 118 aa9.95□□□□□ -0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 CTAG1AP78358 180 aa9.95□□□□□ -0.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 LINC00337Q8N6G1 96 aa9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms