RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560962.5

USP3-AS1-208, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 1,807 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-208ENST00000560962 C3orf84H3BNL1 204 aa11.67□□□□□ -0.54
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USP3-AS1-208ENST00000560962 SLPIP03973 132 aa11.67□□□□□ -0.54
USP3-AS1-208ENST00000560962 OR13C6PQ8NH95 151 aa11.67□□□□□ -0.54
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USP3-AS1-208ENST00000560962 WFDC2Q14508 124 aa11.66□□□□□ -0.54
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USP3-AS1-208ENST00000560962 C14orf177Q52M58 125 aa11.57□□□□□ -0.56
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USP3-AS1-208ENST00000560962 KMT2AQ03164 3969 aa11.54□□□□□ -0.56
USP3-AS1-208ENST00000560962 ALMS1Q8TCU4 4167 aa11.54□□□□□ -0.56
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USP3-AS1-208ENST00000560962 LINC01620Q4KN68 170 aa11.53□□□□□ -0.56
USP3-AS1-208ENST00000560962 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
USP3-AS1-208ENST00000560962 GAGE2BQ13066 116 aa11.53□□□□□ -0.56
USP3-AS1-208ENST00000560962 DNAH6Q9C0G6 4158 aa11.53□□□□□ -0.56
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USP3-AS1-208ENST00000560962 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa11.42□□□□□ -0.58
USP3-AS1-208ENST00000560962 OCIAD2Q56VL3 154 aa11.42□□□□□ -0.58
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USP3-AS1-208ENST00000560962 C7orf33Q8WU49 177 aa11.41□□□□□ -0.58
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USP3-AS1-208ENST00000560962 DIRC1Q969H9 104 aa11.39□□□□□ -0.59
USP3-AS1-208ENST00000560962 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa11.38□□□□□ -0.59
USP3-AS1-208ENST00000560962 H3BT86 120 aa11.38□□□□□ -0.59
USP3-AS1-208ENST00000560962 M0QXV9 152 aa11.38□□□□□ -0.59
USP3-AS1-208ENST00000560962 DNAL4O96015 105 aa11.38□□□□□ -0.59
USP3-AS1-208ENST00000560962 PKIGQ9Y2B9 76 aa11.38□□□□□ -0.59
USP3-AS1-208ENST00000560962 C22orf24Q9Y442 160 aa11.38□□□□□ -0.59
USP3-AS1-208ENST00000560962 TEN1Q86WV5 123 aa11.37□□□□□ -0.59
USP3-AS1-208ENST00000560962 RPL37AP8A6NKH3 93 aa11.37□□□□□ -0.59
USP3-AS1-208ENST00000560962 BAALC-AS2P0C853 105 aa11.37□□□□□ -0.59
USP3-AS1-208ENST00000560962 CHTF8P0CG12 524 aa11.36□□□□□ -0.59
USP3-AS1-208ENST00000560962 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP11.36□□□□□ -0.59
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USP3-AS1-208ENST00000560962 SDIM1Q6ZPB5 146 aa11.35□□□□□ -0.59
USP3-AS1-208ENST00000560962 LINC00167Q96N53 147 aa11.35□□□□□ -0.59
USP3-AS1-208ENST00000560962 DNAH17Q9UFH2 4485 aa11.35□□□□□ -0.59
USP3-AS1-208ENST00000560962 RTL8CO15255 209 aa11.35□□□□□ -0.59
USP3-AS1-208ENST00000560962 LINC00575Q6W349 94 aa11.35□□□□□ -0.59
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USP3-AS1-208ENST00000560962 TNP2Q05952 138 aa11.34□□□□□ -0.59
USP3-AS1-208ENST00000560962 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
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