RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557356.5

PSEN1-222, Transcript of presenilin 1, human

TSL 4

Gene PSEN1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSEN1-222	ENST00000557356		M0QXV9	152 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSEN1-222	ENST00000557356	PLN	P26678	52 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSEN1-222	ENST00000557356	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSEN1-222	ENST00000557356	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSEN1-222	ENST00000557356	TMEM223	A0PJW6	202 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSEN1-222	ENST00000557356	HERVK_113	P61574	105 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSEN1-222	ENST00000557356	HERV-K104	P63124	156 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSEN1-222	ENST00000557356	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PSEN1-222	ENST00000557356	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
PSEN1-222	ENST00000557356	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PSEN1-222	ENST00000557356	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PSEN1-222	ENST00000557356	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSEN1-222	ENST00000557356	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSEN1-222	ENST00000557356	C22orf24	Q9Y442	160 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSEN1-222	ENST00000557356	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSEN1-222	ENST00000557356	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PSEN1-222	ENST00000557356	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSEN1-222	ENST00000557356	FAM168B	A1KXE4	195 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSEN1-222	ENST00000557356	DLEU1	O43261	78 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSEN1-222	ENST00000557356	DPM2	O94777	84 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSEN1-222	ENST00000557356	PFN2	P35080	140 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSEN1-222	ENST00000557356	C1orf137	Q5JT78	98 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSEN1-222	ENST00000557356	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSEN1-222	ENST00000557356	LINC01545	Q5VT33	79 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSEN1-222	ENST00000557356	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSEN1-222	ENST00000557356	DIRC1	Q969H9	104 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSEN1-222	ENST00000557356	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSEN1-222	ENST00000557356	ERG28	Q9UKR5	140 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSEN1-222	ENST00000557356	RYR1	P21817	5038 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSEN1-222	ENST00000557356	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSEN1-222	ENST00000557356		H0Y8G0	127 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSEN1-222	ENST00000557356	IGLV7-43	P04211	117 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSEN1-222	ENST00000557356	LINC00158	P58513	81 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSEN1-222	ENST00000557356	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PSEN1-222	ENST00000557356	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSEN1-222	ENST00000557356	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSEN1-222	ENST00000557356	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSEN1-222	ENST00000557356	IGKC	P01834	107 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSEN1-222	ENST00000557356	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSEN1-222	ENST00000557356	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PSEN1-222	ENST00000557356	LINC01600	Q96MT4	127 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSEN1-222	ENST00000557356	LEPROT	O15243	131 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSEN1-222	ENST00000557356	NMU	P48645	174 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSEN1-222	ENST00000557356	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSEN1-222	ENST00000557356	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSEN1-222	ENST00000557356	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSEN1-222	ENST00000557356	COX8A	P10176	69 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PSEN1-222	ENST00000557356	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PSEN1-222	ENST00000557356	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PSEN1-222	ENST00000557356	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PSEN1-222	ENST00000557356	HSPG2	P98160	4391 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PSEN1-222	ENST00000557356	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PSEN1-222	ENST00000557356		J3QQQ9	107 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PSEN1-222	ENST00000557356	ZNF861P	O60384	105 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PSEN1-222	ENST00000557356	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PSEN1-222	ENST00000557356	BATF	Q16520	125 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PSEN1-222	ENST00000557356	ATOH7	Q8N100	152 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PSEN1-222	ENST00000557356	LINC00167	Q96N53	147 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PSEN1-222	ENST00000557356		H0Y9J4	135 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PSEN1-222	ENST00000557356	BCE1	O60756	84 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PSEN1-222	ENST00000557356	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PSEN1-222	ENST00000557356	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PSEN1-222	ENST00000557356		E9PLD3	99 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PSEN1-222	ENST00000557356		M0R378	163 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PSEN1-222	ENST00000557356	SMIM13	P0DJ93	91 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PSEN1-222	ENST00000557356	VPREB1	P12018	145 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PSEN1-222	ENST00000557356	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PSEN1-222	ENST00000557356	UBE2V1	Q13404	147 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PSEN1-222	ENST00000557356	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PSEN1-222	ENST00000557356	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PSEN1-222	ENST00000557356	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PSEN1-222	ENST00000557356	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PSEN1-222	ENST00000557356	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PSEN1-222	ENST00000557356	GAGE10	A6NGK3	116 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PSEN1-222	ENST00000557356	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PSEN1-222	ENST00000557356	UBE2A	P49459	152 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PSEN1-222	ENST00000557356	KRTAP10-8	P60410	259 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PSEN1-222	ENST00000557356	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PSEN1-222	ENST00000557356	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PSEN1-222	ENST00000557356	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PSEN1-222	ENST00000557356		A0A0U1RRA0	63 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PSEN1-222	ENST00000557356		A6NDN8	102 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PSEN1-222	ENST00000557356	MT1HL1	P0DM35	61 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PSEN1-222	ENST00000557356	HSD52	Q0P140	79 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PSEN1-222	ENST00000557356	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PSEN1-222	ENST00000557356	HIGD1B	Q9P298	99 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PSEN1-222	ENST00000557356	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PSEN1-222	ENST00000557356	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PSEN1-222	ENST00000557356	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PSEN1-222	ENST00000557356	IGKV2D-28	P01615	120 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PSEN1-222	ENST00000557356	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PSEN1-222	ENST00000557356	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PSEN1-222	ENST00000557356	TAX1BP3	O14907	124 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PSEN1-222	ENST00000557356	TIMM17B	O60830	172 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PSEN1-222	ENST00000557356	NDUFC2	O95298	119 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PSEN1-222	ENST00000557356	TAL2	Q16559	108 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PSEN1-222	ENST00000557356	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PSEN1-222	ENST00000557356	COPS9	Q8WXC6	57 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PSEN1-222	ENST00000557356	TMEM126A	Q9H061	195 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PSEN1-222	ENST00000557356		A0A0J9YXY3	114 aa		4.74	□□□□□ -1.65

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