RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 CST9LQ9H4G1 147 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-227ENST00000551441 SPAG11AQ6PDA7 123 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-227ENST00000551441 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
CS-227ENST00000551441 SPRR4Q96PI1 79 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-227ENST00000551441 G0S2P27469 103 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-227ENST00000551441 CTAG1AP78358 180 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-227ENST00000551441 RPL24P83731 157 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
CS-227ENST00000551441 ERG28Q9UKR5 140 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-227ENST00000551441 MT-ND4LP03901 98 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-227ENST00000551441 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
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CS-227ENST00000551441 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
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CS-227ENST00000551441 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
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CS-227ENST00000551441 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-227ENST00000551441 SPINK1P00995 79 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-227ENST00000551441 LINC01546A6NGU7 62 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-227ENST00000551441 NCR3O14931 201 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-227ENST00000551441 MOBPQ13875 183 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-227ENST00000551441 COX17Q14061 63 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-227ENST00000551441 LCE1DQ5T752 114 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-227ENST00000551441 GAGE2AQ6NT46 116 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-227ENST00000551441 FA2HQ7L5A8 372 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-227ENST00000551441 SMCO4Q9NRQ5 59 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-227ENST00000551441 Q8N377 158 aa8.92□□□□□ -0.98
CS-227ENST00000551441 NDUFA12Q9UI09 145 aa8.92□□□□□ -0.98
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CS-227ENST00000551441 TMEM170BQ5T4T1 132 aa8.91□□□□□ -0.98
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CS-227ENST00000551441 PRYO14603 147 aa8.9□□□□□ -0.98
CS-227ENST00000551441 MT1HP80294 61 aa8.9□□□□□ -0.98
CS-227ENST00000551441 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa8.9□□□□□ -0.98
CS-227ENST00000551441 A0A096LNJ9 63 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-227ENST00000551441 ERC2-IT1O76042 136 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-227ENST00000551441 PMCHL1Q16048 86 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-227ENST00000551441 BOD1L2Q8IYS8 172 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-227ENST00000551441 SMIM13P0DJ93 91 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-227ENST00000551441 FABP9Q0Z7S8 132 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-227ENST00000551441 LINC00483Q53H64 154 aa8.87□□□□□ -0.99
CS-227ENST00000551441 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
CS-227ENST00000551441 SPRR1AP35321 89 aa8.86□□□□□ -0.99
CS-227ENST00000551441 BAGE3Q86Y29 109 aa8.86□□□□□ -0.99
CS-227ENST00000551441 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-227ENST00000551441 SLC25A20O43772 301 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-227ENST00000551441 ATP6V1G1O75348 118 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-227ENST00000551441 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-227ENST00000551441 KCNQ1DNQ9H478 68 aa8.85□□□□□ -0.99
CS-227ENST00000551441 PCOTHQ58A44 107 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-227ENST00000551441 FAM19A2Q8N3H0 131 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-227ENST00000551441 MEIG1Q5JSS6 88 aa8.83□□□□□ -1
CS-227ENST00000551441 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa8.83□□□□□ -1
CS-227ENST00000551441 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa8.83□□□□□ -1
CS-227ENST00000551441 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa8.82□□□□□ -1
CS-227ENST00000551441 B5MCH6 92 aa8.82□□□□□ -1
CS-227ENST00000551441 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa8.81□□□□□ -1
CS-227ENST00000551441 C9orf153Q5TBE3 101 aa8.81□□□□□ -1
CS-227ENST00000551441 SFTA2Q6UW10 78 aa8.81□□□□□ -1
CS-227ENST00000551441 C9orf92A6NGG3 77 aa8.8□□□□□ -1
CS-227ENST00000551441 HBDP02042 147 aa8.8□□□□□ -1
CS-227ENST00000551441 S100PP25815 95 aa8.8□□□□□ -1
CS-227ENST00000551441 RPS29P62273 56 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
CS-227ENST00000551441 Q9BRP9 147 aa8.8□□□□□ -1
CS-227ENST00000551441 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
CS-227ENST00000551441 TMEM223A0PJW6 202 aa8.79□□□□□ -1
CS-227ENST00000551441 LINC00614P0C842 121 aa8.79□□□□□ -1
CS-227ENST00000551441 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
CS-227ENST00000551441 CFC1BP0CG36 223 aa8.78□□□□□ -1
CS-227ENST00000551441 HRCT1Q6UXD1 115 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-227ENST00000551441 C18orf32Q8TCD1 76 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-227ENST00000551441 DDTP30046 118 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-227ENST00000551441 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-227ENST00000551441 SEC11CQ9BY50 192 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-227ENST00000551441 TMEM218A2RU14 115 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-227ENST00000551441 A6NJY4 79 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-227ENST00000551441 S100A12P80511 92 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-227ENST00000551441 M0R2T5 61 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-227ENST00000551441 COX19Q49B96 90 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-227ENST00000551441 Q6ZRX8 168 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-227ENST00000551441 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-227ENST00000551441 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
CS-227ENST00000551441 HERV-K104P63124 156 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-227ENST00000551441 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-227ENST00000551441 RPS10P5Q9NQ39 176 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-227ENST00000551441 TSPEAR-AS2P59090 65 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-227ENST00000551441 CLLU1Q5K131 121 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-227ENST00000551441 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-227ENST00000551441 S100A7L2Q5SY68 101 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-227ENST00000551441 IFI27L1Q96BM0 104 aa8.67□□□□□ -1.02
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