RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
CS-220ENST00000550700 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6□□□□□ -1.45
CS-220ENST00000550700 HIST1H4GQ99525 98 aa6□□□□□ -1.45
CS-220ENST00000550700 LITAFQ99732 161 aa6□□□□□ -1.45
CS-220ENST00000550700 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6□□□□□ -1.45
CS-220ENST00000550700 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6□□□□□ -1.45
CS-220ENST00000550700 A0A1B0GVY2 172 aa5.99□□□□□ -1.45
CS-220ENST00000550700 NDUFC2O95298 119 aa5.99□□□□□ -1.45
CS-220ENST00000550700 GAGE2BQ13066 116 aa5.99□□□□□ -1.45
CS-220ENST00000550700 GAGE2EQ4V326 116 aa5.99□□□□□ -1.45
CS-220ENST00000550700 Q6ZRP5 223 aa5.99□□□□□ -1.45
CS-220ENST00000550700 GAGE2DQ9UEU5 116 aa5.99□□□□□ -1.45
CS-220ENST00000550700 A0A0U1RRA0 63 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-220ENST00000550700 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-220ENST00000550700 KRTAP10-2P60368 255 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-220ENST00000550700 HSD52Q0P140 79 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-220ENST00000550700 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-220ENST00000550700 LINC00308Q8TCZ7 52 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-220ENST00000550700 DPH3Q96FX2 82 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-220ENST00000550700 PRO1933Q9H354 126 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-220ENST00000550700 CBY1Q9Y3M2 126 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-220ENST00000550700 SACSQ9NZJ4 4579 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-220ENST00000550700 M0R143 59 aa5.97□□□□□ -1.45
CS-220ENST00000550700 C2orf91Q6ZV80 131 aa5.97□□□□□ -1.45
CS-220ENST00000550700 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
CS-220ENST00000550700 A0A096LNI7 61 aa5.96□□□□□ -1.46
CS-220ENST00000550700 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa5.96□□□□□ -1.46
CS-220ENST00000550700 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa5.96□□□□□ -1.46
CS-220ENST00000550700 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
CS-220ENST00000550700 DDTP30046 118 aa5.96□□□□□ -1.46
CS-220ENST00000550700 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
CS-220ENST00000550700 SPACA4Q8TDM5 124 aa5.96□□□□□ -1.46
CS-220ENST00000550700 RYR2Q92736 4967 aa5.96□□□□□ -1.46
CS-220ENST00000550700 HYDINQ4G0P3 5121 aa5.96□□□□□ -1.46
CS-220ENST00000550700 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa5.95□□□□□ -1.46
CS-220ENST00000550700 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CS-220ENST00000550700 MUSTN1Q8IVN3 82 aa5.95□□□□□ -1.46
CS-220ENST00000550700 CEND1Q8N111 149 aa5.95□□□□□ -1.46
CS-220ENST00000550700 DAND5Q8N907 189 aa5.95□□□□□ -1.46
CS-220ENST00000550700 NKAPP1Q8N9T2 125 aa5.95□□□□□ -1.46
CS-220ENST00000550700 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.95□□□□□ -1.46
CS-220ENST00000550700 XAGE1AQ9HD64 81 aa5.95□□□□□ -1.46
CS-220ENST00000550700 DNAH2Q9P225 4427 aa5.95□□□□□ -1.46
CS-220ENST00000550700 DNAH17Q9UFH2 4485 aa5.94□□□□□ -1.46
CS-220ENST00000550700 Q6ZSA8 131 aa5.94□□□□□ -1.46
CS-220ENST00000550700 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa5.93□□□□□ -1.46
CS-220ENST00000550700 EPM2AB3EWF7 344 aa5.93□□□□□ -1.46
CS-220ENST00000550700 M0R378 163 aa5.93□□□□□ -1.46
CS-220ENST00000550700 LINC01620Q4KN68 170 aa5.93□□□□□ -1.46
CS-220ENST00000550700 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.93□□□□□ -1.46
CS-220ENST00000550700 PLAC8Q9NZF1 115 aa5.93□□□□□ -1.46
CS-220ENST00000550700 A6NDN8 102 aa5.92□□□□□ -1.46
CS-220ENST00000550700 VPREB1P12018 145 aa5.92□□□□□ -1.46
CS-220ENST00000550700 KRTAP10-1P60331 282 aa5.92□□□□□ -1.46
CS-220ENST00000550700 CTAG1AP78358 180 aa5.92□□□□□ -1.46
CS-220ENST00000550700 TMEM126AQ9H061 195 aa5.92□□□□□ -1.46
CS-220ENST00000550700 DNAH10Q8IVF4 4471 aa5.92□□□□□ -1.46
CS-220ENST00000550700 A0A087WYN8 130 aa5.91□□□□□ -1.46
CS-220ENST00000550700 A4D1N5 150 aa5.91□□□□□ -1.46
CS-220ENST00000550700 NPC2P61916 151 aa5.91□□□□□ -1.46
CS-220ENST00000550700 S100A7L2Q5SY68 101 aa5.91□□□□□ -1.46
CS-220ENST00000550700 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa5.91□□□□□ -1.46
CS-220ENST00000550700 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
CS-220ENST00000550700 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
CS-220ENST00000550700 A0A0B4J2C4 111 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-220ENST00000550700 M0QXV9 152 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-220ENST00000550700 CHTF8P0CG12 524 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-220ENST00000550700 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
CS-220ENST00000550700 C7orf33Q8WU49 177 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-220ENST00000550700 RAB37Q96AX2 223 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-220ENST00000550700 C22orf24Q9Y442 160 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-220ENST00000550700 FRAS1Q86XX4 4008 aa5.9□□□□□ -1.47
CS-220ENST00000550700 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP5.89□□□□□ -1.47
CS-220ENST00000550700 A0A1W2PNN7 141 aa5.88□□□□□ -1.47
CS-220ENST00000550700 CDK2AP2O75956 126 aa5.88□□□□□ -1.47
CS-220ENST00000550700 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa5.88□□□□□ -1.47
CS-220ENST00000550700 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa5.88□□□□□ -1.47
CS-220ENST00000550700 OR13C6PQ8NH95 151 aa5.88□□□□□ -1.47
CS-220ENST00000550700 PRO1854Q9UHT4 67 aa5.88□□□□□ -1.47
CS-220ENST00000550700 A0A1B0GWB2 263 aa5.87□□□□□ -1.47
CS-220ENST00000550700 FAM168BA1KXE4 195 aa5.87□□□□□ -1.47
CS-220ENST00000550700 NCR3O14931 201 aa5.87□□□□□ -1.47
CS-220ENST00000550700 IGLV6-57P01721 117 aa5.87□□□□□ -1.47
CS-220ENST00000550700 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
CS-220ENST00000550700 UBE2BP63146 152 aa5.87□□□□□ -1.47
CS-220ENST00000550700 SCXQ7RTU7 201 aa5.87□□□□□ -1.47
CS-220ENST00000550700 SVIPQ8NHG7 77 aa5.87□□□□□ -1.47
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CS-220ENST00000550700 LINC00167Q96N53 147 aa5.87□□□□□ -1.47
CS-220ENST00000550700 PKD1P98161 4303 aa5.87□□□□□ -1.47
CS-220ENST00000550700 FAT2Q9NYQ8 4349 aa5.86□□□□□ -1.47
CS-220ENST00000550700 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa5.86□□□□□ -1.47
CS-220ENST00000550700 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa5.86□□□□□ -1.47
CS-220ENST00000550700 PANO1I0J062 215 aa5.86□□□□□ -1.47
CS-220ENST00000550700 PRYO14603 147 aa5.86□□□□□ -1.47
CS-220ENST00000550700 IGKV2D-28P01615 120 aa5.86□□□□□ -1.47
CS-220ENST00000550700 CFC1BP0CG36 223 aa5.86□□□□□ -1.47
CS-220ENST00000550700 CFC1P0CG37 223 aa5.86□□□□□ -1.47
CS-220ENST00000550700 FXYD2P54710 66 aa5.86□□□□□ -1.47
CS-220ENST00000550700 KCNQ1DNQ9H478 68 aa5.86□□□□□ -1.47
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