RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548387.1

ACSS3-205, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 3, human

TSL 2

Gene ACSS3, Length 741 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACSS3-205	ENST00000548387	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ACSS3-205	ENST00000548387	LINC00862	A6NCI5	91 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACSS3-205	ENST00000548387	FCER1G	P30273	86 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACSS3-205	ENST00000548387	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACSS3-205	ENST00000548387	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACSS3-205	ENST00000548387	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACSS3-205	ENST00000548387	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ACSS3-205	ENST00000548387	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387	COX7A2L	O14548	114 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387	YPEL4	Q96NS1	127 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387	C20orf78	Q9BR46	151 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387	TNXB	P22105	4242 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387	APOM	O95445	188 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387	KRTAP10-8	P60410	259 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387	BATF	Q16520	125 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387		Q6ZUT4	128 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387	NAT8	Q9UHE5	227 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387		A0A1W2PNN7	141 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387		C9JQL5	133 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387	ADIRF	Q15847	76 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387	C5orf38	Q86SI9	138 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387	FAM236D	A0A1B0GTK5	79 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387		A0A1B0GVX0	72 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387		F8W036	122 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387	PPBP	P02775	128 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387	S100A8	P05109	93 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387	FAM236C	P0DP71	79 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387	CKS2	P33552	79 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387	SPAG11B	Q08648	103 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387	PEA15	Q15121	130 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387	C8orf17	Q9NRJ1	99 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387	UBE2A	P49459	152 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387	HBB	P68871	147 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACSS3-205	ENST00000548387		D6R8Y8	96 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACSS3-205	ENST00000548387	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACSS3-205	ENST00000548387	FA2H	Q7L5A8	372 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACSS3-205	ENST00000548387	IMMP2L	Q96T52	175 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACSS3-205	ENST00000548387	NDUFA1	O15239	70 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACSS3-205	ENST00000548387	NPY	P01303	97 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACSS3-205	ENST00000548387	MT-ND6	P03923	174 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACSS3-205	ENST00000548387	LINC00313	P59037	77 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACSS3-205	ENST00000548387	HERVK_113	P63121	156 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACSS3-205	ENST00000548387	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ACSS3-205	ENST00000548387	ORMDL3	Q8N138	153 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACSS3-205	ENST00000548387	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ACSS3-205	ENST00000548387	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ACSS3-205	ENST00000548387	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACSS3-205	ENST00000548387	C1orf137	Q5JT78	98 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ACSS3-205	ENST00000548387	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ACSS3-205	ENST00000548387	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ACSS3-205	ENST00000548387	PRELID3A	Q96N28	172 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ACSS3-205	ENST00000548387	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ACSS3-205	ENST00000548387	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ACSS3-205	ENST00000548387	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ACSS3-205	ENST00000548387	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ACSS3-205	ENST00000548387	FAM168B	A1KXE4	195 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ACSS3-205	ENST00000548387	TSTD3	H0UI37	97 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ACSS3-205	ENST00000548387	IGLV7-43	P04211	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ACSS3-205	ENST00000548387	SCGB1A1	P11684	91 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ACSS3-205	ENST00000548387	DIRC1	Q969H9	104 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ACSS3-205	ENST00000548387	TMEM141	Q96I45	108 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ACSS3-205	ENST00000548387	BPY2	O14599	106 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ACSS3-205	ENST00000548387	UBE2D1	P51668	147 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ACSS3-205	ENST00000548387	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ACSS3-205	ENST00000548387	LRP2	P98164	4655 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ACSS3-205	ENST00000548387		K7EMI3	77 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ACSS3-205	ENST00000548387	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ACSS3-205	ENST00000548387	AMELX	Q99217	191 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ACSS3-205	ENST00000548387	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ACSS3-205	ENST00000548387	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ACSS3-205	ENST00000548387		Q8N8P6	123 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ACSS3-205	ENST00000548387	IGIP	A6NJ69	53 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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