RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542667.5

TM7SF3-211, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 3

Gene TM7SF3, Length 613 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-211ENST00000542667 VPREB1P12018 145 aa8.61□□□□□ -1.03
TM7SF3-211ENST00000542667 TSPEAR-AS2P59090 65 aa8.61□□□□□ -1.03
TM7SF3-211ENST00000542667 BCE1O60756 84 aa8.6□□□□□ -1.03
TM7SF3-211ENST00000542667 COX17Q14061 63 aa8.6□□□□□ -1.03
TM7SF3-211ENST00000542667 TMEM238C9JI98 176 aa8.59□□□□□ -1.03
TM7SF3-211ENST00000542667 HIST1H2BKO60814 126 aa8.59□□□□□ -1.03
TM7SF3-211ENST00000542667 HIST1H2BJP06899 126 aa8.59□□□□□ -1.03
TM7SF3-211ENST00000542667 HIST1H2BOP23527 126 aa8.59□□□□□ -1.03
TM7SF3-211ENST00000542667 HIST1H2BBP33778 126 aa8.59□□□□□ -1.03
TM7SF3-211ENST00000542667 HIST1H2BDP58876 126 aa8.59□□□□□ -1.03
TM7SF3-211ENST00000542667 HIST1H2BCP62807 126 aa8.59□□□□□ -1.03
TM7SF3-211ENST00000542667 HIST2H2BEQ16778 126 aa8.59□□□□□ -1.03
TM7SF3-211ENST00000542667 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
TM7SF3-211ENST00000542667 HIST1H2BHQ93079 126 aa8.59□□□□□ -1.03
TM7SF3-211ENST00000542667 HIST1H2BNQ99877 126 aa8.59□□□□□ -1.03
TM7SF3-211ENST00000542667 HIST1H2BMQ99879 126 aa8.59□□□□□ -1.03
TM7SF3-211ENST00000542667 HSPB8Q9UJY1 196 aa8.59□□□□□ -1.03
TM7SF3-211ENST00000542667 MEIG1Q5JSS6 88 aa8.58□□□□□ -1.04
TM7SF3-211ENST00000542667 NDUFA12Q9UI09 145 aa8.57□□□□□ -1.04
TM7SF3-211ENST00000542667 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa8.56□□□□□ -1.04
TM7SF3-211ENST00000542667 DPM2O94777 84 aa8.56□□□□□ -1.04
TM7SF3-211ENST00000542667 SFTA2Q6UW10 78 aa8.56□□□□□ -1.04
TM7SF3-211ENST00000542667 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa8.56□□□□□ -1.04
TM7SF3-211ENST00000542667 ANAPC11Q9NYG5 84 aa8.56□□□□□ -1.04
TM7SF3-211ENST00000542667 LRP2P98164 4655 aa8.56□□□□□ -1.04
TM7SF3-211ENST00000542667 LEPROTO15243 131 aa8.55□□□□□ -1.04
TM7SF3-211ENST00000542667 IGKCP01834 107 aa8.55□□□□□ -1.04
TM7SF3-211ENST00000542667 PLNP26678 52 aa8.55□□□□□ -1.04
TM7SF3-211ENST00000542667 RPL28P46779 137 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
TM7SF3-211ENST00000542667 UBE2AP49459 152 aa8.55□□□□□ -1.04
TM7SF3-211ENST00000542667 PRLHP81277 87 aa8.55□□□□□ -1.04
TM7SF3-211ENST00000542667 RPL24P83731 157 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
TM7SF3-211ENST00000542667 DAND5Q8N907 189 aa8.55□□□□□ -1.04
TM7SF3-211ENST00000542667 ATP6V1G1O75348 118 aa8.54□□□□□ -1.04
TM7SF3-211ENST00000542667 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa8.54□□□□□ -1.04
TM7SF3-211ENST00000542667 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa8.54□□□□□ -1.04
TM7SF3-211ENST00000542667 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa8.53□□□□□ -1.04
TM7SF3-211ENST00000542667 NCR3O14931 201 aa8.53□□□□□ -1.04
TM7SF3-211ENST00000542667 BOD1L2Q8IYS8 172 aa8.53□□□□□ -1.04
TM7SF3-211ENST00000542667 TMEM126AQ9H061 195 aa8.53□□□□□ -1.04
TM7SF3-211ENST00000542667 A0A087X002 238 aa8.52□□□□□ -1.05
TM7SF3-211ENST00000542667 J3QQQ9 107 aa8.52□□□□□ -1.05
TM7SF3-211ENST00000542667 M0R378 163 aa8.52□□□□□ -1.05
TM7SF3-211ENST00000542667 HERV-K104P63124 156 aa8.52□□□□□ -1.05
TM7SF3-211ENST00000542667 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa8.52□□□□□ -1.05
TM7SF3-211ENST00000542667 PLEKHB2Q96CS7 222 aa8.52□□□□□ -1.05
TM7SF3-211ENST00000542667 LPAP08519 4548 aa8.51□□□□□ -1.05
TM7SF3-211ENST00000542667 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa8.5□□□□□ -1.05
TM7SF3-211ENST00000542667 HERVK_113P61574 105 aa8.5□□□□□ -1.05
TM7SF3-211ENST00000542667 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
TM7SF3-211ENST00000542667 NPC2P61916 151 aa8.48□□□□□ -1.05
TM7SF3-211ENST00000542667 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
TM7SF3-211ENST00000542667 C3orf79P0CE67 100 aa8.46□□□□□ -1.06
TM7SF3-211ENST00000542667 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa8.46□□□□□ -1.06
TM7SF3-211ENST00000542667 RNF213Q63HN8 5207 aa8.45□□□□□ -1.06
TM7SF3-211ENST00000542667 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa8.45□□□□□ -1.06
TM7SF3-211ENST00000542667 LINC00587B1AMM8 73 aa8.45□□□□□ -1.06
TM7SF3-211ENST00000542667 E9PLD3 99 aa8.45□□□□□ -1.06
TM7SF3-211ENST00000542667 TSPAN13O95857 204 aa8.45□□□□□ -1.06
TM7SF3-211ENST00000542667 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
TM7SF3-211ENST00000542667 KRTDAPP60985 99 aa8.45□□□□□ -1.06
TM7SF3-211ENST00000542667 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa8.45□□□□□ -1.06
TM7SF3-211ENST00000542667 LINC01545Q5VT33 79 aa8.45□□□□□ -1.06
TM7SF3-211ENST00000542667 HIGD2AQ9BW72 106 aa8.45□□□□□ -1.06
TM7SF3-211ENST00000542667 A0A0J9YXY3 114 aa8.44□□□□□ -1.06
TM7SF3-211ENST00000542667 CRYGAP11844 174 aa8.44□□□□□ -1.06
TM7SF3-211ENST00000542667 NMUP48645 174 aa8.44□□□□□ -1.06
TM7SF3-211ENST00000542667 TTTY13Q9BZ97 58 aa8.44□□□□□ -1.06
TM7SF3-211ENST00000542667 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa8.43□□□□□ -1.06
TM7SF3-211ENST00000542667 PET117Q6UWS5 81 aa8.43□□□□□ -1.06
TM7SF3-211ENST00000542667 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa8.43□□□□□ -1.06
TM7SF3-211ENST00000542667 TYMSOSQ8TAI1 123 aa8.43□□□□□ -1.06
TM7SF3-211ENST00000542667 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
TM7SF3-211ENST00000542667 PRYO14603 147 aa8.41□□□□□ -1.06
TM7SF3-211ENST00000542667 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa8.4□□□□□ -1.06
TM7SF3-211ENST00000542667 ARL17AQ8IVW1 177 aa8.4□□□□□ -1.06
TM7SF3-211ENST00000542667 ATOH7Q8N100 152 aa8.4□□□□□ -1.06
TM7SF3-211ENST00000542667 MIEN1Q9BRT3 115 aa8.4□□□□□ -1.06
TM7SF3-211ENST00000542667 KCNQ1DNQ9H478 68 aa8.4□□□□□ -1.06
TM7SF3-211ENST00000542667 DDTP30046 118 aa8.39□□□□□ -1.07
TM7SF3-211ENST00000542667 C3orf22Q8N5N4 141 aa8.39□□□□□ -1.07
TM7SF3-211ENST00000542667 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa8.38□□□□□ -1.07
TM7SF3-211ENST00000542667 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
TM7SF3-211ENST00000542667 SPRR1AP35321 89 aa8.38□□□□□ -1.07
TM7SF3-211ENST00000542667 PRR4Q16378 134 aa8.38□□□□□ -1.07
TM7SF3-211ENST00000542667 LITAFQ99732 161 aa8.38□□□□□ -1.07
TM7SF3-211ENST00000542667 ZNF815PA8K554 130 aa8.37□□□□□ -1.07
TM7SF3-211ENST00000542667 FAM229BQ4G0N7 80 aa8.37□□□□□ -1.07
TM7SF3-211ENST00000542667 LINC00337Q8N6G1 96 aa8.37□□□□□ -1.07
TM7SF3-211ENST00000542667 SMCR5Q8TEV8 140 aa8.37□□□□□ -1.07
TM7SF3-211ENST00000542667 PPDPFQ9H3Y8 114 aa8.37□□□□□ -1.07
TM7SF3-211ENST00000542667 ANKRD39Q53RE8 183 aa8.36□□□□□ -1.07
TM7SF3-211ENST00000542667 SPRR4Q96PI1 79 aa8.36□□□□□ -1.07
TM7SF3-211ENST00000542667 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
TM7SF3-211ENST00000542667 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa8.35□□□□□ -1.07
TM7SF3-211ENST00000542667 B5MCH6 92 aa8.35□□□□□ -1.07
TM7SF3-211ENST00000542667 ERC2-IT1O76042 136 aa8.35□□□□□ -1.07
TM7SF3-211ENST00000542667 S100A7L2Q5SY68 101 aa8.35□□□□□ -1.07
TM7SF3-211ENST00000542667 LINC00308Q8TCZ7 52 aa8.35□□□□□ -1.07
TM7SF3-211ENST00000542667 NDUFC2O95298 119 aa8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.7 ms