RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528484.5

CMTM1-211, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CMTM1, Length 726 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1-211ENST00000528484 CST9LQ9H4G1 147 aa6.57□□□□□ -1.36
CMTM1-211ENST00000528484 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.57□□□□□ -1.36
CMTM1-211ENST00000528484 SPINK1P00995 79 aa6.56□□□□□ -1.36
CMTM1-211ENST00000528484 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.56□□□□□ -1.36
CMTM1-211ENST00000528484 SFTA2Q6UW10 78 aa6.56□□□□□ -1.36
CMTM1-211ENST00000528484 FAM19A2Q8N3H0 131 aa6.56□□□□□ -1.36
CMTM1-211ENST00000528484 SPRR4Q96PI1 79 aa6.56□□□□□ -1.36
CMTM1-211ENST00000528484 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.56□□□□□ -1.36
CMTM1-211ENST00000528484 ERG28Q9UKR5 140 aa6.56□□□□□ -1.36
CMTM1-211ENST00000528484 ADCYAP1P18509 176 aa6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-211ENST00000528484 DAND5Q8N907 189 aa6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-211ENST00000528484 Q8NBF4 154 aa6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-211ENST00000528484 SMCO4Q9NRQ5 59 aa6.54□□□□□ -1.36
CMTM1-211ENST00000528484 NDUFA6P56556 154 aa6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-211ENST00000528484 KIAA1644Q3SXP7 199 aa6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-211ENST00000528484 FA2HQ7L5A8 372 aa6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-211ENST00000528484 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.51□□□□□ -1.37
CMTM1-211ENST00000528484 S100A12P80511 92 aa6.51□□□□□ -1.37
CMTM1-211ENST00000528484 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CMTM1-211ENST00000528484 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.5□□□□□ -1.37
CMTM1-211ENST00000528484 ATP6V1G1O75348 118 aa6.5□□□□□ -1.37
CMTM1-211ENST00000528484 IGLC3P0DOY3 106 aa6.5□□□□□ -1.37
CMTM1-211ENST00000528484 LINC00158P58513 81 aa6.5□□□□□ -1.37
CMTM1-211ENST00000528484 PRYO14603 147 aa6.49□□□□□ -1.37
CMTM1-211ENST00000528484 LCE2CQ5TA81 110 aa6.49□□□□□ -1.37
CMTM1-211ENST00000528484 SLC25A20O43772 301 aa6.48□□□□□ -1.37
CMTM1-211ENST00000528484 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CMTM1-211ENST00000528484 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CMTM1-211ENST00000528484 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa6.47□□□□□ -1.37
CMTM1-211ENST00000528484 LINC01546A6NGU7 62 aa6.47□□□□□ -1.37
CMTM1-211ENST00000528484 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.47□□□□□ -1.37
CMTM1-211ENST00000528484 S100PP25815 95 aa6.46□□□□□ -1.38
CMTM1-211ENST00000528484 MOBPQ13875 183 aa6.46□□□□□ -1.38
CMTM1-211ENST00000528484 Q8NDZ9 215 aa6.46□□□□□ -1.38
CMTM1-211ENST00000528484 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.46□□□□□ -1.38
CMTM1-211ENST00000528484 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.46□□□□□ -1.38
CMTM1-211ENST00000528484 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.45□□□□□ -1.38
CMTM1-211ENST00000528484 CFC1BP0CG36 223 aa6.45□□□□□ -1.38
CMTM1-211ENST00000528484 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.45□□□□□ -1.38
CMTM1-211ENST00000528484 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.45□□□□□ -1.38
CMTM1-211ENST00000528484 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.45□□□□□ -1.38
CMTM1-211ENST00000528484 A0A0U1RRA0 63 aa6.44□□□□□ -1.38
CMTM1-211ENST00000528484 COX19Q49B96 90 aa6.44□□□□□ -1.38
CMTM1-211ENST00000528484 LINC00483Q53H64 154 aa6.44□□□□□ -1.38
CMTM1-211ENST00000528484 XP32Q5T750 250 aa6.44□□□□□ -1.38
CMTM1-211ENST00000528484 Q8N377 158 aa6.44□□□□□ -1.38
CMTM1-211ENST00000528484 NCR3O14931 201 aa6.43□□□□□ -1.38
CMTM1-211ENST00000528484 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.43□□□□□ -1.38
CMTM1-211ENST00000528484 SVIPQ8NHG7 77 aa6.43□□□□□ -1.38
CMTM1-211ENST00000528484 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.43□□□□□ -1.38
CMTM1-211ENST00000528484 LINC00587B1AMM8 73 aa6.42□□□□□ -1.38
CMTM1-211ENST00000528484 HBDP02042 147 aa6.42□□□□□ -1.38
CMTM1-211ENST00000528484 SPRR1AP35321 89 aa6.42□□□□□ -1.38
CMTM1-211ENST00000528484 FABP9Q0Z7S8 132 aa6.42□□□□□ -1.38
CMTM1-211ENST00000528484 BAGE3Q86Y29 109 aa6.42□□□□□ -1.38
CMTM1-211ENST00000528484 C11orf86A6NJI1 115 aa6.41□□□□□ -1.38
CMTM1-211ENST00000528484 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.41□□□□□ -1.38
CMTM1-211ENST00000528484 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.41□□□□□ -1.38
CMTM1-211ENST00000528484 SMIM13P0DJ93 91 aa6.4□□□□□ -1.38
CMTM1-211ENST00000528484 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.4□□□□□ -1.38
CMTM1-211ENST00000528484 SEC11CQ9BY50 192 aa6.39□□□□□ -1.39
CMTM1-211ENST00000528484 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.38□□□□□ -1.39
CMTM1-211ENST00000528484 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CMTM1-211ENST00000528484 LINC00614P0C842 121 aa6.38□□□□□ -1.39
CMTM1-211ENST00000528484 HERV-K104P63124 156 aa6.38□□□□□ -1.39
CMTM1-211ENST00000528484 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.38□□□□□ -1.39
CMTM1-211ENST00000528484 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CMTM1-211ENST00000528484 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.37□□□□□ -1.39
CMTM1-211ENST00000528484 B5MCH6 92 aa6.37□□□□□ -1.39
CMTM1-211ENST00000528484 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
CMTM1-211ENST00000528484 LIMD2Q9BT23 127 aa6.37□□□□□ -1.39
CMTM1-211ENST00000528484 A0A096LNJ9 63 aa6.36□□□□□ -1.39
CMTM1-211ENST00000528484 DDTP30046 118 aa6.36□□□□□ -1.39
CMTM1-211ENST00000528484 TMEM223A0PJW6 202 aa6.35□□□□□ -1.39
CMTM1-211ENST00000528484 M0R2T5 61 aa6.35□□□□□ -1.39
CMTM1-211ENST00000528484 MT1HP80294 61 aa6.35□□□□□ -1.39
CMTM1-211ENST00000528484 PMCHL1Q16048 86 aa6.35□□□□□ -1.39
CMTM1-211ENST00000528484 Q6ZRX8 168 aa6.35□□□□□ -1.39
CMTM1-211ENST00000528484 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.35□□□□□ -1.39
CMTM1-211ENST00000528484 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.34□□□□□ -1.39
CMTM1-211ENST00000528484 ERC2-IT1O76042 136 aa6.34□□□□□ -1.39
CMTM1-211ENST00000528484 PCOTHQ58A44 107 aa6.34□□□□□ -1.39
CMTM1-211ENST00000528484 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.34□□□□□ -1.39
CMTM1-211ENST00000528484 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.33□□□□□ -1.4
CMTM1-211ENST00000528484 UQCC3Q6UW78 93 aa6.33□□□□□ -1.4
CMTM1-211ENST00000528484 C18orf32Q8TCD1 76 aa6.33□□□□□ -1.4
CMTM1-211ENST00000528484 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa6.33□□□□□ -1.4
CMTM1-211ENST00000528484 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.32□□□□□ -1.4
CMTM1-211ENST00000528484 TMEM218A2RU14 115 aa6.32□□□□□ -1.4
CMTM1-211ENST00000528484 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CMTM1-211ENST00000528484 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.32□□□□□ -1.4
CMTM1-211ENST00000528484 COMMD7Q86VX2 200 aa6.32□□□□□ -1.4
CMTM1-211ENST00000528484 Q9BRP9 147 aa6.32□□□□□ -1.4
CMTM1-211ENST00000528484 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CMTM1-211ENST00000528484 C9orf92A6NGG3 77 aa6.31□□□□□ -1.4
CMTM1-211ENST00000528484 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.31□□□□□ -1.4
CMTM1-211ENST00000528484 C5orf52A6NGY3 159 aa6.3□□□□□ -1.4
CMTM1-211ENST00000528484 IFITM2Q01629 132 aa6.3□□□□□ -1.4
CMTM1-211ENST00000528484 CLLU1Q5K131 121 aa6.3□□□□□ -1.4
CMTM1-211ENST00000528484 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.3□□□□□ -1.4
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