RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524436.5

RPS6KA1-209, Transcript of ribosomal protein S6 kinase A1, human

TSL 4

Gene RPS6KA1, Length 560 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS6KA1-209	ENST00000524436	S100A12	P80511	92 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS6KA1-209	ENST00000524436	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS6KA1-209	ENST00000524436	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS6KA1-209	ENST00000524436	TMEM126A	Q9H061	195 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS6KA1-209	ENST00000524436	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS6KA1-209	ENST00000524436	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KA1-209	ENST00000524436		H0Y8G0	127 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KA1-209	ENST00000524436	TSPAN13	O95857	204 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KA1-209	ENST00000524436	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KA1-209	ENST00000524436	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS6KA1-209	ENST00000524436		A0A087X002	238 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KA1-209	ENST00000524436	COLCA2	A8K830	154 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KA1-209	ENST00000524436		M0R378	163 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KA1-209	ENST00000524436	SCO1	O75880	301 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KA1-209	ENST00000524436	PRLH	P81277	87 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KA1-209	ENST00000524436	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS6KA1-209	ENST00000524436		A0A0U1RRA0	63 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS6KA1-209	ENST00000524436	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS6KA1-209	ENST00000524436	LEPROTL1	O95214	131 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS6KA1-209	ENST00000524436	FABP4	P15090	132 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS6KA1-209	ENST00000524436	CTAG1A	P78358	180 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS6KA1-209	ENST00000524436	TMEM238	C9JI98	176 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS6KA1-209	ENST00000524436	SERF1A	O75920	110 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS6KA1-209	ENST00000524436	SMIM13	P0DJ93	91 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS6KA1-209	ENST00000524436	HERVK_113	P61574	105 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS6KA1-209	ENST00000524436	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS6KA1-209	ENST00000524436	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS6KA1-209	ENST00000524436	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS6KA1-209	ENST00000524436	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS6KA1-209	ENST00000524436	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS6KA1-209	ENST00000524436	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPS6KA1-209	ENST00000524436	PRY	O14603	147 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS6KA1-209	ENST00000524436	PLN	P26678	52 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS6KA1-209	ENST00000524436	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS6KA1-209	ENST00000524436	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS6KA1-209	ENST00000524436	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS6KA1-209	ENST00000524436	LINC00310	P59036	64 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS6KA1-209	ENST00000524436	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS6KA1-209	ENST00000524436	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS6KA1-209	ENST00000524436	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS6KA1-209	ENST00000524436	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS6KA1-209	ENST00000524436	LRP2	P98164	4655 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS6KA1-209	ENST00000524436	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-209	ENST00000524436	LEPROT	O15243	131 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-209	ENST00000524436	DPM2	O94777	84 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-209	ENST00000524436	NMU	P48645	174 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-209	ENST00000524436	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-209	ENST00000524436		Q8NDZ9	215 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-209	ENST00000524436	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-209	ENST00000524436		A0A0U1RQV1	116 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-209	ENST00000524436		J3QQQ9	107 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-209	ENST00000524436	NCR3	O14931	201 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-209	ENST00000524436	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-209	ENST00000524436	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-209	ENST00000524436	IGKC	P01834	107 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-209	ENST00000524436	SPRR4	Q96PI1	79 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-209	ENST00000524436	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-209	ENST00000524436	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-209	ENST00000524436	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-209	ENST00000524436	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-209	ENST00000524436	SPRR1A	P35321	89 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-209	ENST00000524436	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-209	ENST00000524436	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-209	ENST00000524436	NDUFC2	O95298	119 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-209	ENST00000524436	DDT	P30046	118 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-209	ENST00000524436	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-209	ENST00000524436	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-209	ENST00000524436	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-209	ENST00000524436	CDIP1	Q9H305	208 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-209	ENST00000524436	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-209	ENST00000524436	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-209	ENST00000524436	HIST1H2BK	O60814	126 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-209	ENST00000524436	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-209	ENST00000524436	HIST1H2BO	P23527	126 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-209	ENST00000524436	HIST1H2BB	P33778	126 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-209	ENST00000524436	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-209	ENST00000524436	HIST1H2BD	P58876	126 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-209	ENST00000524436	HIST1H2BC	P62807	126 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-209	ENST00000524436	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-209	ENST00000524436	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-209	ENST00000524436	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-209	ENST00000524436	DAND5	Q8N907	189 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-209	ENST00000524436	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-209	ENST00000524436	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-209	ENST00000524436	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-209	ENST00000524436	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-209	ENST00000524436		B5MCH6	92 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-209	ENST00000524436	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-209	ENST00000524436	SPINK1	P00995	79 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-209	ENST00000524436	TPRXL	Q17RH7	258 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-209	ENST00000524436		E9PLD3	99 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPS6KA1-209	ENST00000524436	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPS6KA1-209	ENST00000524436	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPS6KA1-209	ENST00000524436	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RPS6KA1-209	ENST00000524436	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPS6KA1-209	ENST00000524436	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPS6KA1-209	ENST00000524436		A0A0J9YXY3	114 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPS6KA1-209	ENST00000524436	LINC00483	Q53H64	154 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPS6KA1-209	ENST00000524436		Q6ZRX8	168 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPS6KA1-209	ENST00000524436	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		4.82	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 153.5 ms