RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 CCL18P55774 89 aa7.04□□□□□ -1.28
TRPS1-211ENST00000520276 IL17DQ8TAD2 202 aa7.04□□□□□ -1.28
TRPS1-211ENST00000520276 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa7.03□□□□□ -1.28
TRPS1-211ENST00000520276 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.03□□□□□ -1.28
TRPS1-211ENST00000520276 KRTAP10-11P60412 298 aa7.03□□□□□ -1.28
TRPS1-211ENST00000520276 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa7.02□□□□□ -1.28
TRPS1-211ENST00000520276 LINC00158P58513 81 aa7.02□□□□□ -1.29
TRPS1-211ENST00000520276 SPART-AS1P0CW21 52 aa7.02□□□□□ -1.29
TRPS1-211ENST00000520276 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa7.02□□□□□ -1.29
TRPS1-211ENST00000520276 M0R2N4 97 aa7.01□□□□□ -1.29
TRPS1-211ENST00000520276 DEFB4AO15263 64 aa7.01□□□□□ -1.29
TRPS1-211ENST00000520276 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.01□□□□□ -1.29
TRPS1-211ENST00000520276 K7EIL1 84 aa7.01□□□□□ -1.29
TRPS1-211ENST00000520276 UBL5Q9BZL1 73 aa7.01□□□□□ -1.29
TRPS1-211ENST00000520276 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa7.01□□□□□ -1.29
TRPS1-211ENST00000520276 AKAP9Q99996 3911 aa7□□□□□ -1.29
TRPS1-211ENST00000520276 PAX4O43316 350 aa7□□□□□ -1.29
TRPS1-211ENST00000520276 TM2D3Q9BRN9 247 aa7□□□□□ -1.29
TRPS1-211ENST00000520276 MIFP14174 115 aa7□□□□□ -1.29
TRPS1-211ENST00000520276 C16orf74Q96GX8 76 aa7□□□□□ -1.29
TRPS1-211ENST00000520276 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-211ENST00000520276 RETNQ9HD89 108 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-211ENST00000520276 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-211ENST00000520276 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-211ENST00000520276 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.98□□□□□ -1.29
TRPS1-211ENST00000520276 IGHV3-53P01767 116 aa6.98□□□□□ -1.29
TRPS1-211ENST00000520276 HAMPP81172 84 aa6.98□□□□□ -1.29
TRPS1-211ENST00000520276 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.98□□□□□ -1.29
TRPS1-211ENST00000520276 B9D2Q9BPU9 175 aa6.98□□□□□ -1.29
TRPS1-211ENST00000520276 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.98□□□□□ -1.29
TRPS1-211ENST00000520276 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
TRPS1-211ENST00000520276 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
TRPS1-211ENST00000520276 COX7B2Q8TF08 81 aa6.97□□□□□ -1.29
TRPS1-211ENST00000520276 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.97□□□□□ -1.29
TRPS1-211ENST00000520276 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.97□□□□□ -1.29
TRPS1-211ENST00000520276 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.97□□□□□ -1.29
TRPS1-211ENST00000520276 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.97□□□□□ -1.29
TRPS1-211ENST00000520276 Q8N814 137 aa6.96□□□□□ -1.29
TRPS1-211ENST00000520276 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.96□□□□□ -1.3
TRPS1-211ENST00000520276 SCXQ7RTU7 201 aa6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-211ENST00000520276 Q8N3U1 123 aa6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-211ENST00000520276 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-211ENST00000520276 A0A0J9YWU9 116 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-211ENST00000520276 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-211ENST00000520276 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-211ENST00000520276 LINC00167Q96N53 147 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-211ENST00000520276 A0A087WZ39 114 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-211ENST00000520276 Q6ZVQ6 151 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-211ENST00000520276 Q6ZQT0 140 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-211ENST00000520276 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-211ENST00000520276 LYRM9A8MSI8 78 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-211ENST00000520276 BCE1O60756 84 aa6.92□□□□□ -1.3
TRPS1-211ENST00000520276 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
TRPS1-211ENST00000520276 A8MTW9 85 aa6.91□□□□□ -1.3
TRPS1-211ENST00000520276 K7EQD1 137 aa6.91□□□□□ -1.3
TRPS1-211ENST00000520276 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.91□□□□□ -1.3
TRPS1-211ENST00000520276 C1orf158Q8N1D5 194 aa6.91□□□□□ -1.3
TRPS1-211ENST00000520276 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.9□□□□□ -1.3
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.9□□□□□ -1.3
TRPS1-211ENST00000520276 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.9□□□□□ -1.31
TRPS1-211ENST00000520276 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.9□□□□□ -1.31
TRPS1-211ENST00000520276 NDUFC1O43677 76 aa6.9□□□□□ -1.31
TRPS1-211ENST00000520276 PMAIP1Q13794 54 aa6.89□□□□□ -1.31
TRPS1-211ENST00000520276 NREPQ16612 68 aa6.89□□□□□ -1.31
TRPS1-211ENST00000520276 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-211ENST00000520276 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-211ENST00000520276 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-211ENST00000520276 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-211ENST00000520276 UBE2L6O14933 153 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-211ENST00000520276 ESRGQ1W209 222 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-211ENST00000520276 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-211ENST00000520276 C6orf99Q4VX62 202 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-211ENST00000520276 Q8N9L7 120 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-211ENST00000520276 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-211ENST00000520276 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-211ENST00000520276 NUPR2A6NF83 97 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-211ENST00000520276 TENM1Q9UKZ4 2725 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-211ENST00000520276 Q8NDZ9 215 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-211ENST00000520276 Q6ZTC4 211 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-211ENST00000520276 PRO0255Q9UI72 69 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-211ENST00000520276 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-211ENST00000520276 BPY2O14599 106 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-211ENST00000520276 CXCL6P80162 114 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-211ENST00000520276 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-211ENST00000520276 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-211ENST00000520276 A0A096LPF7 62 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-211ENST00000520276 PRR15Q8IV56 129 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-211ENST00000520276 X6R8D5 127 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-211ENST00000520276 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-211ENST00000520276 GYPEP15421 78 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-211ENST00000520276 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.84□□□□□ -1.32
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-211ENST00000520276 PRYO14603 147 aa6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-211ENST00000520276 MUC7Q8TAX7 377 aa6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-211ENST00000520276 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-211ENST00000520276 LINC00575Q6W349 94 aa6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-211ENST00000520276 C6orf223Q8N319 242 aa6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
TRPS1-211ENST00000520276 A8MU10 97 aa6.82□□□□□ -1.32
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