RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515588.1

SERF1B-208, Transcript of small EDRK-rich factor 1B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SERF1B, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1B-208ENST00000515588 HIST1H2BCP62807 126 aa9.49□□□□□ -0.89
SERF1B-208ENST00000515588 HIST2H2BEQ16778 126 aa9.49□□□□□ -0.89
SERF1B-208ENST00000515588 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SERF1B-208ENST00000515588 NKAPP1Q8N9T2 125 aa9.49□□□□□ -0.89
SERF1B-208ENST00000515588 HIST1H2BHQ93079 126 aa9.49□□□□□ -0.89
SERF1B-208ENST00000515588 HIST1H2BNQ99877 126 aa9.49□□□□□ -0.89
SERF1B-208ENST00000515588 HIST1H2BMQ99879 126 aa9.49□□□□□ -0.89
SERF1B-208ENST00000515588 PMCHL2Q9BQD1 86 aa9.48□□□□□ -0.89
SERF1B-208ENST00000515588 A0A0U1RRA0 63 aa9.47□□□□□ -0.89
SERF1B-208ENST00000515588 BCE1O60756 84 aa9.47□□□□□ -0.89
SERF1B-208ENST00000515588 LINC00158P58513 81 aa9.47□□□□□ -0.89
SERF1B-208ENST00000515588 PRR26Q8N8Z3 221 aa9.47□□□□□ -0.89
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SERF1B-208ENST00000515588 DPM2O94777 84 aa9.45□□□□□ -0.9
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SERF1B-208ENST00000515588 NDUFA12Q9UI09 145 aa9.45□□□□□ -0.9
SERF1B-208ENST00000515588 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa9.44□□□□□ -0.9
SERF1B-208ENST00000515588 LEPROTO15243 131 aa9.44□□□□□ -0.9
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SERF1B-208ENST00000515588 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa9.43□□□□□ -0.9
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SERF1B-208ENST00000515588 HERV-K104P63124 156 aa9.43□□□□□ -0.9
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SERF1B-208ENST00000515588 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa9.43□□□□□ -0.9
SERF1B-208ENST00000515588 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa9.43□□□□□ -0.9
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SERF1B-208ENST00000515588 MEIG1Q5JSS6 88 aa9.42□□□□□ -0.9
SERF1B-208ENST00000515588 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa9.41□□□□□ -0.9
SERF1B-208ENST00000515588 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa9.41□□□□□ -0.9
SERF1B-208ENST00000515588 PLEKHB2Q96CS7 222 aa9.41□□□□□ -0.9
SERF1B-208ENST00000515588 TMEM238C9JI98 176 aa9.4□□□□□ -0.9
SERF1B-208ENST00000515588 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa9.4□□□□□ -0.9
SERF1B-208ENST00000515588 J3QQQ9 107 aa9.4□□□□□ -0.9
SERF1B-208ENST00000515588 HERVK_113P61574 105 aa9.39□□□□□ -0.91
SERF1B-208ENST00000515588 LRP2P98164 4655 aa9.39□□□□□ -0.91
SERF1B-208ENST00000515588 M0R378 163 aa9.38□□□□□ -0.91
SERF1B-208ENST00000515588 ATP6V1G1O75348 118 aa9.38□□□□□ -0.91
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SERF1B-208ENST00000515588 BOD1L2Q8IYS8 172 aa9.38□□□□□ -0.91
SERF1B-208ENST00000515588 TMEM126AQ9H061 195 aa9.38□□□□□ -0.91
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SERF1B-208ENST00000515588 E9PLD3 99 aa9.35□□□□□ -0.91
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SERF1B-208ENST00000515588 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa9.34□□□□□ -0.91
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SERF1B-208ENST00000515588 A0A087X002 238 aa9.33□□□□□ -0.92
SERF1B-208ENST00000515588 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa9.33□□□□□ -0.92
SERF1B-208ENST00000515588 C3orf79P0CE67 100 aa9.33□□□□□ -0.92
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SERF1B-208ENST00000515588 PET117Q6UWS5 81 aa9.33□□□□□ -0.92
SERF1B-208ENST00000515588 ARL17AQ8IVW1 177 aa9.33□□□□□ -0.92
SERF1B-208ENST00000515588 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa9.31□□□□□ -0.92
SERF1B-208ENST00000515588 A0A0J9YXY3 114 aa9.31□□□□□ -0.92
SERF1B-208ENST00000515588 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa9.3□□□□□ -0.92
SERF1B-208ENST00000515588 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa9.29□□□□□ -0.92
SERF1B-208ENST00000515588 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
SERF1B-208ENST00000515588 KRTDAPP60985 99 aa9.29□□□□□ -0.92
SERF1B-208ENST00000515588 KCNQ1DNQ9H478 68 aa9.29□□□□□ -0.92
SERF1B-208ENST00000515588 PRYO14603 147 aa9.28□□□□□ -0.92
SERF1B-208ENST00000515588 CRYGAP11844 174 aa9.28□□□□□ -0.92
SERF1B-208ENST00000515588 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa9.28□□□□□ -0.92
SERF1B-208ENST00000515588 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
SERF1B-208ENST00000515588 S100A1P23297 94 aa9.27□□□□□ -0.93
SERF1B-208ENST00000515588 SPRR1AP35321 89 aa9.27□□□□□ -0.93
SERF1B-208ENST00000515588 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa9.27□□□□□ -0.93
SERF1B-208ENST00000515588 LITAFQ99732 161 aa9.26□□□□□ -0.93
SERF1B-208ENST00000515588 HIGD2AQ9BW72 106 aa9.26□□□□□ -0.93
SERF1B-208ENST00000515588 TTTY13Q9BZ97 58 aa9.26□□□□□ -0.93
SERF1B-208ENST00000515588 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa9.25□□□□□ -0.93
SERF1B-208ENST00000515588 NPC2P61916 151 aa9.25□□□□□ -0.93
SERF1B-208ENST00000515588 LINC00337Q8N6G1 96 aa9.25□□□□□ -0.93
SERF1B-208ENST00000515588 TYMSOSQ8TAI1 123 aa9.25□□□□□ -0.93
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SERF1B-208ENST00000515588 FAM229BQ4G0N7 80 aa9.24□□□□□ -0.93
SERF1B-208ENST00000515588 MIEN1Q9BRT3 115 aa9.24□□□□□ -0.93
SERF1B-208ENST00000515588 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
SERF1B-208ENST00000515588 NDUFC2O95298 119 aa9.23□□□□□ -0.93
SERF1B-208ENST00000515588 DDTP30046 118 aa9.23□□□□□ -0.93
SERF1B-208ENST00000515588 ZNF815PA8K554 130 aa9.22□□□□□ -0.93
SERF1B-208ENST00000515588 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa9.21□□□□□ -0.94
SERF1B-208ENST00000515588 TIMM17BO60830 172 aa9.21□□□□□ -0.94
SERF1B-208ENST00000515588 IGLV6-57P01721 117 aa9.21□□□□□ -0.94
SERF1B-208ENST00000515588 ANKRD39Q53RE8 183 aa9.21□□□□□ -0.94
SERF1B-208ENST00000515588 ATOH7Q8N100 152 aa9.21□□□□□ -0.94
SERF1B-208ENST00000515588 SPRR4Q96PI1 79 aa9.21□□□□□ -0.94
SERF1B-208ENST00000515588 C20orf202A1L168 122 aa9.2□□□□□ -0.94
SERF1B-208ENST00000515588 B5MCH6 92 aa9.2□□□□□ -0.94
SERF1B-208ENST00000515588 TSPAN13O95857 204 aa9.2□□□□□ -0.94
SERF1B-208ENST00000515588 LINC00308Q8TCZ7 52 aa9.2□□□□□ -0.94
SERF1B-208ENST00000515588 SMCR5Q8TEV8 140 aa9.2□□□□□ -0.94
SERF1B-208ENST00000515588 HIST3H2BBQ8N257 126 aa9.19□□□□□ -0.94
SERF1B-208ENST00000515588 S100A7L2Q5SY68 101 aa9.18□□□□□ -0.94
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