RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513069.1

SH3BP2-225, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 866 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-225ENST00000513069 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
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SH3BP2-225ENST00000513069 LINC00167Q96N53 147 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-225ENST00000513069 LEPROTO15243 131 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-225ENST00000513069 VPREB1P12018 145 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-225ENST00000513069 NDUFA12Q9UI09 145 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-225ENST00000513069 LINC00158P58513 81 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP2-225ENST00000513069 A0A0U1RRA0 63 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP2-225ENST00000513069 GAGE10A6NGK3 116 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP2-225ENST00000513069 RPL37AP8A6NKH3 93 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP2-225ENST00000513069 SMIM13P0DJ93 91 aa9.22□□□□□ -0.93
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SH3BP2-225ENST00000513069 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa9.18□□□□□ -0.94
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SH3BP2-225ENST00000513069 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP2-225ENST00000513069 ARL17AQ8IVW1 177 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP2-225ENST00000513069 BOD1L2Q8IYS8 172 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP2-225ENST00000513069 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP2-225ENST00000513069 A0A0J9YXY3 114 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP2-225ENST00000513069 TMEM238C9JI98 176 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP2-225ENST00000513069 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP2-225ENST00000513069 M0R378 163 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP2-225ENST00000513069 HIST3H2BBQ8N257 126 aa9.11□□□□□ -0.95
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SH3BP2-225ENST00000513069 ANKRD39Q53RE8 183 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP2-225ENST00000513069 ATOH7Q8N100 152 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP2-225ENST00000513069 C20orf202A1L168 122 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP2-225ENST00000513069 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa9.05□□□□□ -0.96
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SH3BP2-225ENST00000513069 ZNF815PA8K554 130 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP2-225ENST00000513069 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP2-225ENST00000513069 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
SH3BP2-225ENST00000513069 TIMM17BO60830 172 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP2-225ENST00000513069 SPRR1AP35321 89 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP2-225ENST00000513069 NPC2P61916 151 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP2-225ENST00000513069 NDUFC2O95298 119 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP2-225ENST00000513069 S100A2P29034 98 aa9.02□□□□□ -0.97
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SH3BP2-225ENST00000513069 ANAPC11Q9NYG5 84 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP2-225ENST00000513069 A0A087X002 238 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP2-225ENST00000513069 C5orf52A6NGY3 159 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP2-225ENST00000513069 PRYO14603 147 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP2-225ENST00000513069 S100A6P06703 90 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP2-225ENST00000513069 LINC00308Q8TCZ7 52 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP2-225ENST00000513069 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
SH3BP2-225ENST00000513069 PCP2Q8IVA1 136 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP2-225ENST00000513069 MIEN1Q9BRT3 115 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP2-225ENST00000513069 IGLV6-57P01721 117 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP2-225ENST00000513069 DDTP30046 118 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP2-225ENST00000513069 LINC00337Q8N6G1 96 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP2-225ENST00000513069 AKR1D1P51857 326 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP2-225ENST00000513069 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
SH3BP2-225ENST00000513069 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP2-225ENST00000513069 HIGD2AQ9BW72 106 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP2-225ENST00000513069 B5MCH6 92 aa8.95□□□□□ -0.98
SH3BP2-225ENST00000513069 SPANXDQ9BXN6 97 aa8.95□□□□□ -0.98
SH3BP2-225ENST00000513069 SPANXCQ9NY87 97 aa8.95□□□□□ -0.98
SH3BP2-225ENST00000513069 CRYGAP11844 174 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP2-225ENST00000513069 S100A7L2Q5SY68 101 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP2-225ENST00000513069 SCGB1D4Q6XE38 83 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP2-225ENST00000513069 SMCR5Q8TEV8 140 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP2-225ENST00000513069 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa8.93□□□□□ -0.98
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