RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512716.1

RASGEF1B-210, Transcript of RasGEF domain family member 1B, humanhuman

TSL 3

Gene RASGEF1B, Length 516 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1B-210ENST00000512716 HIST1H2BMQ99879 126 aa14.55□□□□□ -0.08
RASGEF1B-210ENST00000512716 ZNF861PO60384 105 aa14.53□□□□□ -0.08
RASGEF1B-210ENST00000512716 RPL24P83731 157 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
RASGEF1B-210ENST00000512716 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa14.53□□□□□ -0.08
RASGEF1B-210ENST00000512716 A0A0U1RRA0 63 aa14.52□□□□□ -0.09
RASGEF1B-210ENST00000512716 DPM2O94777 84 aa14.52□□□□□ -0.09
RASGEF1B-210ENST00000512716 VPREB1P12018 145 aa14.52□□□□□ -0.09
RASGEF1B-210ENST00000512716 PMCHL2Q9BQD1 86 aa14.52□□□□□ -0.09
RASGEF1B-210ENST00000512716 BCE1O60756 84 aa14.51□□□□□ -0.09
RASGEF1B-210ENST00000512716 MEIG1Q5JSS6 88 aa14.51□□□□□ -0.09
RASGEF1B-210ENST00000512716 NDUFA12Q9UI09 145 aa14.51□□□□□ -0.09
RASGEF1B-210ENST00000512716 HERV-K104P63124 156 aa14.5□□□□□ -0.09
RASGEF1B-210ENST00000512716 ATP6V1G1O75348 118 aa14.49□□□□□ -0.09
RASGEF1B-210ENST00000512716 IGKCP01834 107 aa14.49□□□□□ -0.09
RASGEF1B-210ENST00000512716 SMIM13P0DJ93 91 aa14.49□□□□□ -0.09
RASGEF1B-210ENST00000512716 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa14.48□□□□□ -0.09
RASGEF1B-210ENST00000512716 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa14.48□□□□□ -0.09
RASGEF1B-210ENST00000512716 LEPROTO15243 131 aa14.48□□□□□ -0.09
RASGEF1B-210ENST00000512716 IGKV2D-28P01615 120 aa14.48□□□□□ -0.09
RASGEF1B-210ENST00000512716 HERVK_113P61574 105 aa14.48□□□□□ -0.09
RASGEF1B-210ENST00000512716 PLEKHB2Q96CS7 222 aa14.48□□□□□ -0.09
RASGEF1B-210ENST00000512716 RPL28P46779 137 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
RASGEF1B-210ENST00000512716 LINC00587B1AMM8 73 aa14.46□□□□□ -0.09
RASGEF1B-210ENST00000512716 TSPEAR-AS2P59090 65 aa14.46□□□□□ -0.09
RASGEF1B-210ENST00000512716 PRR26Q8N8Z3 221 aa14.46□□□□□ -0.09
RASGEF1B-210ENST00000512716 Q8NDZ9 215 aa14.45□□□□□ -0.1
RASGEF1B-210ENST00000512716 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa14.44□□□□□ -0.1
RASGEF1B-210ENST00000512716 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa14.43□□□□□ -0.1
RASGEF1B-210ENST00000512716 J3QQQ9 107 aa14.43□□□□□ -0.1
RASGEF1B-210ENST00000512716 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa14.43□□□□□ -0.1
RASGEF1B-210ENST00000512716 UBE2AP49459 152 aa14.42□□□□□ -0.1
RASGEF1B-210ENST00000512716 HMCN2Q8NDA2 5059 aa14.41□□□□□ -0.1
RASGEF1B-210ENST00000512716 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa14.41□□□□□ -0.1
RASGEF1B-210ENST00000512716 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP14.41□□□□□ -0.1
RASGEF1B-210ENST00000512716 BOD1L2Q8IYS8 172 aa14.39□□□□□ -0.11
RASGEF1B-210ENST00000512716 NMUP48645 174 aa14.38□□□□□ -0.11
RASGEF1B-210ENST00000512716 TMEM126AQ9H061 195 aa14.38□□□□□ -0.11
RASGEF1B-210ENST00000512716 TMEM238C9JI98 176 aa14.37□□□□□ -0.11
RASGEF1B-210ENST00000512716 M0R378 163 aa14.36□□□□□ -0.11
RASGEF1B-210ENST00000512716 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa14.36□□□□□ -0.11
RASGEF1B-210ENST00000512716 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
RASGEF1B-210ENST00000512716 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
RASGEF1B-210ENST00000512716 PET117Q6UWS5 81 aa14.35□□□□□ -0.11
RASGEF1B-210ENST00000512716 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa14.35□□□□□ -0.11
RASGEF1B-210ENST00000512716 E9PLD3 99 aa14.34□□□□□ -0.11
RASGEF1B-210ENST00000512716 PRLHP81277 87 aa14.34□□□□□ -0.11
RASGEF1B-210ENST00000512716 LINC01545Q5VT33 79 aa14.34□□□□□ -0.11
RASGEF1B-210ENST00000512716 NCR3O14931 201 aa14.33□□□□□ -0.12
RASGEF1B-210ENST00000512716 DAND5Q8N907 189 aa14.33□□□□□ -0.12
RASGEF1B-210ENST00000512716 C3orf79P0CE67 100 aa14.31□□□□□ -0.12
RASGEF1B-210ENST00000512716 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa14.3□□□□□ -0.12
RASGEF1B-210ENST00000512716 S100A1P23297 94 aa14.29□□□□□ -0.12
RASGEF1B-210ENST00000512716 KRTDAPP60985 99 aa14.28□□□□□ -0.12
RASGEF1B-210ENST00000512716 MIEN1Q9BRT3 115 aa14.28□□□□□ -0.12
RASGEF1B-210ENST00000512716 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa14.27□□□□□ -0.13
RASGEF1B-210ENST00000512716 ARL17AQ8IVW1 177 aa14.27□□□□□ -0.13
RASGEF1B-210ENST00000512716 A0A0J9YXY3 114 aa14.26□□□□□ -0.13
RASGEF1B-210ENST00000512716 PRYO14603 147 aa14.26□□□□□ -0.13
RASGEF1B-210ENST00000512716 A0A087X002 238 aa14.24□□□□□ -0.13
RASGEF1B-210ENST00000512716 CRYGAP11844 174 aa14.24□□□□□ -0.13
RASGEF1B-210ENST00000512716 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa14.23□□□□□ -0.13
RASGEF1B-210ENST00000512716 ANAPC11Q9NYG5 84 aa14.23□□□□□ -0.13
RASGEF1B-210ENST00000512716 HIGD2AQ9BW72 106 aa14.22□□□□□ -0.13
RASGEF1B-210ENST00000512716 KCNQ1DNQ9H478 68 aa14.22□□□□□ -0.13
RASGEF1B-210ENST00000512716 C20orf202A1L168 122 aa14.21□□□□□ -0.13
RASGEF1B-210ENST00000512716 NPC2P61916 151 aa14.21□□□□□ -0.13
RASGEF1B-210ENST00000512716 S100A12P80511 92 aa14.21□□□□□ -0.13
RASGEF1B-210ENST00000512716 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa14.2□□□□□ -0.14
RASGEF1B-210ENST00000512716 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa14.2□□□□□ -0.14
RASGEF1B-210ENST00000512716 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
RASGEF1B-210ENST00000512716 TYMSOSQ8TAI1 123 aa14.19□□□□□ -0.14
RASGEF1B-210ENST00000512716 ZNF815PA8K554 130 aa14.18□□□□□ -0.14
RASGEF1B-210ENST00000512716 NDUFC2O95298 119 aa14.18□□□□□ -0.14
RASGEF1B-210ENST00000512716 DDTP30046 118 aa14.18□□□□□ -0.14
RASGEF1B-210ENST00000512716 SPRR1AP35321 89 aa14.18□□□□□ -0.14
RASGEF1B-210ENST00000512716 FAM229BQ4G0N7 80 aa14.18□□□□□ -0.14
RASGEF1B-210ENST00000512716 LINC00337Q8N6G1 96 aa14.18□□□□□ -0.14
RASGEF1B-210ENST00000512716 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa14.17□□□□□ -0.14
RASGEF1B-210ENST00000512716 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa14.17□□□□□ -0.14
RASGEF1B-210ENST00000512716 S100A7L2Q5SY68 101 aa14.15□□□□□ -0.14
RASGEF1B-210ENST00000512716 TTTY13Q9BZ97 58 aa14.15□□□□□ -0.14
RASGEF1B-210ENST00000512716 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
RASGEF1B-210ENST00000512716 TIMM17BO60830 172 aa14.14□□□□□ -0.15
RASGEF1B-210ENST00000512716 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
RASGEF1B-210ENST00000512716 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa14.13□□□□□ -0.15
RASGEF1B-210ENST00000512716 LITAFQ99732 161 aa14.13□□□□□ -0.15
RASGEF1B-210ENST00000512716 ATOH7Q8N100 152 aa14.12□□□□□ -0.15
RASGEF1B-210ENST00000512716 S100A2P29034 98 aa14.11□□□□□ -0.15
RASGEF1B-210ENST00000512716 AKR1D1P51857 326 aa14.1□□□□□ -0.15
RASGEF1B-210ENST00000512716 HIST3H2BBQ8N257 126 aa14.1□□□□□ -0.15
RASGEF1B-210ENST00000512716 LINC00308Q8TCZ7 52 aa14.1□□□□□ -0.15
RASGEF1B-210ENST00000512716 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
RASGEF1B-210ENST00000512716 IGLV6-57P01721 117 aa14.09□□□□□ -0.15
RASGEF1B-210ENST00000512716 ANKRD39Q53RE8 183 aa14.09□□□□□ -0.15
RASGEF1B-210ENST00000512716 SPRR4Q96PI1 79 aa14.09□□□□□ -0.15
RASGEF1B-210ENST00000512716 TSPAN13O95857 204 aa14.08□□□□□ -0.16
RASGEF1B-210ENST00000512716 SMCR5Q8TEV8 140 aa14.08□□□□□ -0.16
RASGEF1B-210ENST00000512716 B5MCH6 92 aa14.07□□□□□ -0.16
RASGEF1B-210ENST00000512716 LRP2P98164 4655 aa14.07□□□□□ -0.16
RASGEF1B-210ENST00000512716 SCGB1D4Q6XE38 83 aa14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.3 ms