RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 Q8NBF4 154 aa4.84□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 LINC00587B1AMM8 73 aa4.83□□□□□ -1.64
HERC3-210ENST00000512194 J3QQQ9 107 aa4.83□□□□□ -1.64
HERC3-210ENST00000512194 C6orf226Q5I0X4 101 aa4.83□□□□□ -1.64
HERC3-210ENST00000512194 SLC25A34Q6PIV7 304 aa4.83□□□□□ -1.64
HERC3-210ENST00000512194 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa4.82□□□□□ -1.64
HERC3-210ENST00000512194 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa4.82□□□□□ -1.64
HERC3-210ENST00000512194 F8WDY8 70 aa4.82□□□□□ -1.64
HERC3-210ENST00000512194 COX8AP10176 69 aa4.82□□□□□ -1.64
HERC3-210ENST00000512194 CXCL5P42830 114 aa4.82□□□□□ -1.64
HERC3-210ENST00000512194 CKS1BP61024 79 aa4.82□□□□□ -1.64
HERC3-210ENST00000512194 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
HERC3-210ENST00000512194 C14orf177Q52M58 125 aa4.82□□□□□ -1.64
HERC3-210ENST00000512194 COX7B2Q8TF08 81 aa4.82□□□□□ -1.64
HERC3-210ENST00000512194 ORAOV1Q8WV07 137 aa4.82□□□□□ -1.64
HERC3-210ENST00000512194 TOMM7Q9P0U1 55 aa4.82□□□□□ -1.64
HERC3-210ENST00000512194 UQCR10Q9UDW1 63 aa4.82□□□□□ -1.64
HERC3-210ENST00000512194 A0A1B0GVY2 172 aa4.81□□□□□ -1.64
HERC3-210ENST00000512194 ZNF815PA8K554 130 aa4.81□□□□□ -1.64
HERC3-210ENST00000512194 EPM2AB3EWF7 344 aa4.81□□□□□ -1.64
HERC3-210ENST00000512194 DLEU1O43261 78 aa4.81□□□□□ -1.64
HERC3-210ENST00000512194 MAJINQ3KP22 176 aa4.81□□□□□ -1.64
HERC3-210ENST00000512194 SCGB1D4Q6XE38 83 aa4.81□□□□□ -1.64
HERC3-210ENST00000512194 C14orf144Q96I85 54 aa4.81□□□□□ -1.64
HERC3-210ENST00000512194 NDUFA12Q9UI09 145 aa4.81□□□□□ -1.64
HERC3-210ENST00000512194 A0A0U1RRA0 63 aa4.8□□□□□ -1.64
HERC3-210ENST00000512194 M0R2N4 97 aa4.8□□□□□ -1.64
HERC3-210ENST00000512194 SPAG11BQ08648 103 aa4.8□□□□□ -1.64
HERC3-210ENST00000512194 Q8IZM0 81 aa4.8□□□□□ -1.64
HERC3-210ENST00000512194 COPS9Q8WXC6 57 aa4.8□□□□□ -1.64
HERC3-210ENST00000512194 MIEN1Q9BRT3 115 aa4.8□□□□□ -1.64
HERC3-210ENST00000512194 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.8□□□□□ -1.64
HERC3-210ENST00000512194 UBR4Q5T4S7 5183 aa4.8□□□□□ -1.64
HERC3-210ENST00000512194 NDUFA1O15239 70 aa4.79□□□□□ -1.64
HERC3-210ENST00000512194 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
HERC3-210ENST00000512194 C1orf134Q5TEV5 83 aa4.79□□□□□ -1.64
HERC3-210ENST00000512194 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.79□□□□□ -1.64
HERC3-210ENST00000512194 BOD1L2Q8IYS8 172 aa4.79□□□□□ -1.64
HERC3-210ENST00000512194 C6orf223Q8N319 242 aa4.79□□□□□ -1.64
HERC3-210ENST00000512194 OCR1Q9BZK8 76 aa4.79□□□□□ -1.64
HERC3-210ENST00000512194 PRO1933Q9H354 126 aa4.79□□□□□ -1.64
HERC3-210ENST00000512194 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa4.78□□□□□ -1.64
HERC3-210ENST00000512194 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
HERC3-210ENST00000512194 MEIG1Q5JSS6 88 aa4.78□□□□□ -1.64
HERC3-210ENST00000512194 PCP2Q8IVA1 136 aa4.78□□□□□ -1.64
HERC3-210ENST00000512194 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
HERC3-210ENST00000512194 TMEM238C9JI98 176 aa4.77□□□□□ -1.65
HERC3-210ENST00000512194 TIMM17BO60830 172 aa4.77□□□□□ -1.65
HERC3-210ENST00000512194 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa4.77□□□□□ -1.65
HERC3-210ENST00000512194 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa4.77□□□□□ -1.65
HERC3-210ENST00000512194 CAMK2N2Q96S95 79 aa4.77□□□□□ -1.65
HERC3-210ENST00000512194 HIGD1BQ9P298 99 aa4.77□□□□□ -1.65
HERC3-210ENST00000512194 PKIGQ9Y2B9 76 aa4.77□□□□□ -1.65
HERC3-210ENST00000512194 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
HERC3-210ENST00000512194 LINC00158P58513 81 aa4.76□□□□□ -1.65
HERC3-210ENST00000512194 TSPEAR-AS2P59090 65 aa4.76□□□□□ -1.65
HERC3-210ENST00000512194 COX17Q14061 63 aa4.76□□□□□ -1.65
HERC3-210ENST00000512194 HIGD2BQ4VC39 106 aa4.76□□□□□ -1.65
HERC3-210ENST00000512194 Q6ZR54 194 aa4.76□□□□□ -1.65
HERC3-210ENST00000512194 Q6ZVH6 145 aa4.76□□□□□ -1.65
HERC3-210ENST00000512194 HIST1H4GQ99525 98 aa4.76□□□□□ -1.65
HERC3-210ENST00000512194 DNAH5Q8TE73 4624 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC3-210ENST00000512194 A0A0J9YXY3 114 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC3-210ENST00000512194 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC3-210ENST00000512194 PCP4L1A6NKN8 68 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC3-210ENST00000512194 DDTP30046 118 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC3-210ENST00000512194 SYCNQ0VAF6 134 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC3-210ENST00000512194 KIAA0087Q14695 138 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC3-210ENST00000512194 TAL2Q16559 108 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC3-210ENST00000512194 C15orf56Q8N910 161 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC3-210ENST00000512194 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
HERC3-210ENST00000512194 MYCBP2O75592 4640 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC3-210ENST00000512194 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa4.74□□□□□ -1.65
HERC3-210ENST00000512194 M0R143 59 aa4.74□□□□□ -1.65
HERC3-210ENST00000512194 IFITM1P13164 125 aa4.74□□□□□ -1.65
HERC3-210ENST00000512194 HSD52Q0P140 79 aa4.74□□□□□ -1.65
HERC3-210ENST00000512194 CARD19Q96LW7 228 aa4.74□□□□□ -1.65
HERC3-210ENST00000512194 TTTY13Q9BZ97 58 aa4.74□□□□□ -1.65
HERC3-210ENST00000512194 ERG28Q9UKR5 140 aa4.74□□□□□ -1.65
HERC3-210ENST00000512194 FAT1Q14517 4588 aa4.73□□□□□ -1.65
HERC3-210ENST00000512194 LECT2O14960 151 aa4.73□□□□□ -1.65
HERC3-210ENST00000512194 CTAG1AP78358 180 aa4.73□□□□□ -1.65
HERC3-210ENST00000512194 C2orf82Q6UX34 121 aa4.73□□□□□ -1.65
HERC3-210ENST00000512194 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa4.73□□□□□ -1.65
HERC3-210ENST00000512194 Q8N377 158 aa4.73□□□□□ -1.65
HERC3-210ENST00000512194 SPANXDQ9BXN6 97 aa4.73□□□□□ -1.65
HERC3-210ENST00000512194 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
HERC3-210ENST00000512194 SPANXCQ9NY87 97 aa4.73□□□□□ -1.65
HERC3-210ENST00000512194 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
HERC3-210ENST00000512194 SMIM13P0DJ93 91 aa4.72□□□□□ -1.65
HERC3-210ENST00000512194 PFN2P35080 140 aa4.72□□□□□ -1.65
HERC3-210ENST00000512194 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
HERC3-210ENST00000512194 LINC00526Q96FQ7 95 aa4.72□□□□□ -1.65
HERC3-210ENST00000512194 A0A087WTM6 91 aa4.71□□□□□ -1.66
HERC3-210ENST00000512194 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa4.71□□□□□ -1.66
HERC3-210ENST00000512194 RTL8CO15255 209 aa4.71□□□□□ -1.66
HERC3-210ENST00000512194 CNBPP62633 177 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
HERC3-210ENST00000512194 Q6ZRU5 148 aa4.71□□□□□ -1.66
HERC3-210ENST00000512194 C2orf91Q6ZV80 131 aa4.71□□□□□ -1.66
HERC3-210ENST00000512194 TP73-AS1Q9UF72 201 aa4.71□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms