RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	LEPROTL1	O95214	131 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM223	A0PJW6	202 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	GAGE10	A6NGK3	116 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	BCE1	O60756	84 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	PFN2	P35080	140 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	ERG28	Q9UKR5	140 aa		7.59	□□□□□ -1.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	VPREB1	P12018	145 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	COX17	Q14061	63 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		7.56	□□□□□ -1.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		7.55	□□□□□ -1.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		7.55	□□□□□ -1.2
SH3BP2-222	ENST00000512014		H0Y8G0	127 aa		7.54	□□□□□ -1.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A087X002	238 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGKV2D-28	P01615	120 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRTDAP	P60985	99 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	SFTA2	Q6UW10	78 aa		7.53	□□□□□ -1.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM238	C9JI98	176 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	C3orf79	P0CE67	100 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A0U1RRA0	63 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SH3BP2-222	ENST00000512014		M0R378	163 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	SMIM13	P0DJ93	91 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	LINC00158	P58513	81 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	PET117	Q6UWS5	81 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM126A	Q9H061	195 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	C20orf202	A1L168	122 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	UBE2A	P49459	152 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRLH	P81277	87 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	RNF213	Q63HN8	5207 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SH3BP2-222	ENST00000512014	DPM2	O94777	84 aa		7.46	□□□□□ -1.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	SCGB1D1	O95968	90 aa		7.46	□□□□□ -1.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	PLN	P26678	52 aa		7.46	□□□□□ -1.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	AKR1D1	P51857	326 aa		7.46	□□□□□ -1.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	HERV-K104	P63124	156 aa		7.46	□□□□□ -1.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	LEPROT	O15243	131 aa		7.45	□□□□□ -1.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGKC	P01834	107 aa		7.45	□□□□□ -1.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		7.45	□□□□□ -1.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	LINC01545	Q5VT33	79 aa		7.45	□□□□□ -1.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		7.45	□□□□□ -1.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		7.44	□□□□□ -1.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	CRYGA	P11844	174 aa		7.44	□□□□□ -1.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		7.44	□□□□□ -1.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		7.43	□□□□□ -1.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		7.43	□□□□□ -1.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		7.43	□□□□□ -1.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		7.43	□□□□□ -1.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		7.43	□□□□□ -1.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	LOC105371267	A0A1B0GV96	52 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
SH3BP2-222	ENST00000512014		J3QQQ9	107 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	NCR3	O14931	201 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPRR1A	P35321	89 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	DAND5	Q8N907	189 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATOH7	Q8N100	152 aa		7.41	□□□□□ -1.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		7.41	□□□□□ -1.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	LINC00587	B1AMM8	73 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRY	O14603	147 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	TSPAN13	O95857	204 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	HERVK_113	P61574	105 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SH3BP2-222	ENST00000512014		E9PLD3	99 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	NMU	P48645	174 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRR4	Q16378	134 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPRR4	Q96PI1	79 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	PYY3	Q5JQD4	70 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A0J9YXY3	114 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	VAMP8	Q9BV40	100 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	LITAF	Q99732	161 aa		7.34	□□□□□ -1.23

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