RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511276.1

FAM53C-208, Transcript of family with sequence similarity 53 member C, human

TSL 4

Gene FAM53C, Length 571 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM53C-208	ENST00000511276	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		7.62	□□□□□ -1.19
FAM53C-208	ENST00000511276	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		7.62	□□□□□ -1.19
FAM53C-208	ENST00000511276	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		7.62	□□□□□ -1.19
FAM53C-208	ENST00000511276	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	7.62	□□□□□ -1.19
FAM53C-208	ENST00000511276	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		7.61	□□□□□ -1.19
FAM53C-208	ENST00000511276		F8WDY8	70 aa		7.61	□□□□□ -1.19
FAM53C-208	ENST00000511276	NDUFA1	O15239	70 aa		7.61	□□□□□ -1.19
FAM53C-208	ENST00000511276	IGLC3	P0DOY3	106 aa		7.61	□□□□□ -1.19
FAM53C-208	ENST00000511276	PLN	P26678	52 aa		7.61	□□□□□ -1.19
FAM53C-208	ENST00000511276	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		7.61	□□□□□ -1.19
FAM53C-208	ENST00000511276	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		7.61	□□□□□ -1.19
FAM53C-208	ENST00000511276	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		7.6	□□□□□ -1.19
FAM53C-208	ENST00000511276	DPM2	O94777	84 aa		7.6	□□□□□ -1.19
FAM53C-208	ENST00000511276	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		7.6	□□□□□ -1.19
FAM53C-208	ENST00000511276	SCGB1D1	O95968	90 aa		7.59	□□□□□ -1.19
FAM53C-208	ENST00000511276	HERVK_113	P63121	156 aa		7.59	□□□□□ -1.19
FAM53C-208	ENST00000511276	PYY3	Q5JQD4	70 aa		7.59	□□□□□ -1.19
FAM53C-208	ENST00000511276	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		7.59	□□□□□ -1.19
FAM53C-208	ENST00000511276	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		7.58	□□□□□ -1.2
FAM53C-208	ENST00000511276	C11orf86	A6NJI1	115 aa		7.58	□□□□□ -1.2
FAM53C-208	ENST00000511276	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
FAM53C-208	ENST00000511276	IGKC	P01834	107 aa		7.58	□□□□□ -1.2
FAM53C-208	ENST00000511276	SMIM6	P0DI80	62 aa		7.58	□□□□□ -1.2
FAM53C-208	ENST00000511276	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
FAM53C-208	ENST00000511276	LCE2C	Q5TA81	110 aa		7.58	□□□□□ -1.2
FAM53C-208	ENST00000511276	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		7.58	□□□□□ -1.2
FAM53C-208	ENST00000511276	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
FAM53C-208	ENST00000511276	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
FAM53C-208	ENST00000511276	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		7.57	□□□□□ -1.2
FAM53C-208	ENST00000511276	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		7.56	□□□□□ -1.2
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	7.56	□□□□□ -1.2
FAM53C-208	ENST00000511276	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		7.55	□□□□□ -1.2
FAM53C-208	ENST00000511276	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		7.55	□□□□□ -1.2
FAM53C-208	ENST00000511276		H3BRM9	83 aa		7.54	□□□□□ -1.2
FAM53C-208	ENST00000511276	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
FAM53C-208	ENST00000511276	CTAG1A	P78358	180 aa		7.54	□□□□□ -1.2
FAM53C-208	ENST00000511276	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		7.54	□□□□□ -1.2
FAM53C-208	ENST00000511276	ATOH7	Q8N100	152 aa		7.54	□□□□□ -1.2
FAM53C-208	ENST00000511276	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		7.54	□□□□□ -1.2
FAM53C-208	ENST00000511276	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		7.53	□□□□□ -1.2
FAM53C-208	ENST00000511276	BCE1	O60756	84 aa		7.53	□□□□□ -1.2
FAM53C-208	ENST00000511276	CFC1B	P0CG36	223 aa		7.53	□□□□□ -1.2
FAM53C-208	ENST00000511276	MT1H	P80294	61 aa		7.53	□□□□□ -1.2
FAM53C-208	ENST00000511276	C22orf24	Q9Y442	160 aa		7.53	□□□□□ -1.2
FAM53C-208	ENST00000511276	TMEM223	A0PJW6	202 aa		7.52	□□□□□ -1.21
FAM53C-208	ENST00000511276	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		7.52	□□□□□ -1.21
FAM53C-208	ENST00000511276	HERVK_113	P61574	105 aa		7.52	□□□□□ -1.21
FAM53C-208	ENST00000511276	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		7.52	□□□□□ -1.21
FAM53C-208	ENST00000511276	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		7.51	□□□□□ -1.21
FAM53C-208	ENST00000511276	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		7.51	□□□□□ -1.21
FAM53C-208	ENST00000511276	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		7.51	□□□□□ -1.21
FAM53C-208	ENST00000511276	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
FAM53C-208	ENST00000511276	VAMP8	Q9BV40	100 aa		7.51	□□□□□ -1.21
FAM53C-208	ENST00000511276	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		7.5	□□□□□ -1.21
FAM53C-208	ENST00000511276	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		7.5	□□□□□ -1.21
FAM53C-208	ENST00000511276		E9PLD3	99 aa		7.5	□□□□□ -1.21
FAM53C-208	ENST00000511276	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
FAM53C-208	ENST00000511276	S100A12	P80511	92 aa		7.5	□□□□□ -1.21
FAM53C-208	ENST00000511276	KIAA0087	Q14695	138 aa		7.5	□□□□□ -1.21
FAM53C-208	ENST00000511276	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
FAM53C-208	ENST00000511276	SPINK8	P0C7L1	97 aa		7.49	□□□□□ -1.21
FAM53C-208	ENST00000511276	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		7.49	□□□□□ -1.21
FAM53C-208	ENST00000511276	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		7.49	□□□□□ -1.21
FAM53C-208	ENST00000511276	C2orf82	Q6UX34	121 aa		7.49	□□□□□ -1.21
FAM53C-208	ENST00000511276	LEPROT	O15243	131 aa		7.48	□□□□□ -1.21
FAM53C-208	ENST00000511276	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		7.48	□□□□□ -1.21
FAM53C-208	ENST00000511276	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		7.48	□□□□□ -1.21
FAM53C-208	ENST00000511276	C12orf57	Q99622	126 aa		7.48	□□□□□ -1.21
FAM53C-208	ENST00000511276	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
FAM53C-208	ENST00000511276	SPATA45	Q537H7	98 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FAM53C-208	ENST00000511276	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FAM53C-208	ENST00000511276	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
FAM53C-208	ENST00000511276		Q8IZM0	81 aa		7.46	□□□□□ -1.22
FAM53C-208	ENST00000511276		J3QQQ9	107 aa		7.45	□□□□□ -1.22
FAM53C-208	ENST00000511276	SFTA2	Q6UW10	78 aa		7.45	□□□□□ -1.22
FAM53C-208	ENST00000511276	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		7.45	□□□□□ -1.22
FAM53C-208	ENST00000511276	COX7B2	Q8TF08	81 aa		7.45	□□□□□ -1.22
FAM53C-208	ENST00000511276	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		7.45	□□□□□ -1.22
FAM53C-208	ENST00000511276	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		7.45	□□□□□ -1.22
FAM53C-208	ENST00000511276	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
FAM53C-208	ENST00000511276	CXCL5	P42830	114 aa		7.44	□□□□□ -1.22
FAM53C-208	ENST00000511276	NMU	P48645	174 aa		7.44	□□□□□ -1.22
FAM53C-208	ENST00000511276	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		7.44	□□□□□ -1.22
FAM53C-208	ENST00000511276	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FAM53C-208	ENST00000511276	PRSS2	P07478	247 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FAM53C-208	ENST00000511276	COX8A	P10176	69 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FAM53C-208	ENST00000511276	UBE2A	P49459	152 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FAM53C-208	ENST00000511276	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FAM53C-208	ENST00000511276	DLEU1	O43261	78 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FAM53C-208	ENST00000511276	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FAM53C-208	ENST00000511276	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
FAM53C-208	ENST00000511276	LINC00167	Q96N53	147 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FAM53C-208	ENST00000511276	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FAM53C-208	ENST00000511276	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		7.41	□□□□□ -1.22
FAM53C-208	ENST00000511276	PCP2	Q8IVA1	136 aa		7.41	□□□□□ -1.22
FAM53C-208	ENST00000511276	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		7.41	□□□□□ -1.22
FAM53C-208	ENST00000511276	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		7.4	□□□□□ -1.22
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF815P	A8K554	130 aa		7.4	□□□□□ -1.22
FAM53C-208	ENST00000511276	CKS1B	P61024	79 aa		7.4	□□□□□ -1.22

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