RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 HIST1H2BJP06899 126 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP2-218ENST00000511185 HIST1H2BOP23527 126 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP2-218ENST00000511185 HIST1H2BBP33778 126 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP2-218ENST00000511185 HIST1H2BDP58876 126 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP2-218ENST00000511185 HIST1H2BCP62807 126 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP2-218ENST00000511185 HIST2H2BEQ16778 126 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP2-218ENST00000511185 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
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SH3BP2-218ENST00000511185 HIST1H2BHQ93079 126 aa11.22□□□□□ -0.61
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SH3BP2-218ENST00000511185 HIST1H2BMQ99879 126 aa11.22□□□□□ -0.61
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SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM126AQ9H061 195 aa11.14□□□□□ -0.63
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SH3BP2-218ENST00000511185 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa11.12□□□□□ -0.63
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SH3BP2-218ENST00000511185 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 HERVK_113P61574 105 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 ANAPC11Q9NYG5 84 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 ATP6V1G1O75348 118 aa11.08□□□□□ -0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
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SH3BP2-218ENST00000511185 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
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SH3BP2-218ENST00000511185 ARL17AQ8IVW1 177 aa11□□□□□ -0.65
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SH3BP2-218ENST00000511185 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 TYMSOSQ8TAI1 123 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 LITAFQ99732 161 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM229BQ4G0N7 80 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 MIEN1Q9BRT3 115 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 RNF213Q63HN8 5207 aa10.94□□□□□ -0.66
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SH3BP2-218ENST00000511185 NDUFC2O95298 119 aa10.91□□□□□ -0.66
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SH3BP2-218ENST00000511185 IGLV6-57P01721 117 aa10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-218ENST00000511185 B5MCH6 92 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 LINC00308Q8TCZ7 52 aa10.88□□□□□ -0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 ERC2-IT1O76042 136 aa10.87□□□□□ -0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 S100A1P23297 94 aa10.87□□□□□ -0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 PRR4Q16378 134 aa10.87□□□□□ -0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 S100A7L2Q5SY68 101 aa10.87□□□□□ -0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 LINC00304Q8N9R0 145 aa10.87□□□□□ -0.67
SH3BP2-218ENST00000511185 Q9BRP9 147 aa10.87□□□□□ -0.67
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