RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510193.1

SH3BP2-216, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 407 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-216ENST00000510193 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
SH3BP2-216ENST00000510193 A0A087X002 238 aa7.52□□□□□ -1.21
SH3BP2-216ENST00000510193 TMEM223A0PJW6 202 aa7.52□□□□□ -1.21
SH3BP2-216ENST00000510193 GAGE10A6NGK3 116 aa7.52□□□□□ -1.21
SH3BP2-216ENST00000510193 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
SH3BP2-216ENST00000510193 PMCHL2Q9BQD1 86 aa7.52□□□□□ -1.21
SH3BP2-216ENST00000510193 HSPB8Q9UJY1 196 aa7.52□□□□□ -1.21
SH3BP2-216ENST00000510193 ATP6V1G1O75348 118 aa7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2-216ENST00000510193 PFN2P35080 140 aa7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2-216ENST00000510193 Q8NDZ9 215 aa7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2-216ENST00000510193 VPREB1P12018 145 aa7.5□□□□□ -1.21
SH3BP2-216ENST00000510193 RPL28P46779 137 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
SH3BP2-216ENST00000510193 S100A1P23297 94 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP2-216ENST00000510193 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP2-216ENST00000510193 ERG28Q9UKR5 140 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP2-216ENST00000510193 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa7.48□□□□□ -1.21
SH3BP2-216ENST00000510193 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2-216ENST00000510193 A0A0U1RRA0 63 aa7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2-216ENST00000510193 DPM2O94777 84 aa7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2-216ENST00000510193 IGKV2D-28P01615 120 aa7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2-216ENST00000510193 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2-216ENST00000510193 ANAPC11Q9NYG5 84 aa7.47□□□□□ -1.21
SH3BP2-216ENST00000510193 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa7.46□□□□□ -1.22
SH3BP2-216ENST00000510193 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa7.45□□□□□ -1.22
SH3BP2-216ENST00000510193 IGKCP01834 107 aa7.45□□□□□ -1.22
SH3BP2-216ENST00000510193 PLNP26678 52 aa7.45□□□□□ -1.22
SH3BP2-216ENST00000510193 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.45□□□□□ -1.22
SH3BP2-216ENST00000510193 COX17Q14061 63 aa7.45□□□□□ -1.22
SH3BP2-216ENST00000510193 TMEM238C9JI98 176 aa7.44□□□□□ -1.22
SH3BP2-216ENST00000510193 M0R378 163 aa7.44□□□□□ -1.22
SH3BP2-216ENST00000510193 UBE2AP49459 152 aa7.44□□□□□ -1.22
SH3BP2-216ENST00000510193 LINC00158P58513 81 aa7.44□□□□□ -1.22
SH3BP2-216ENST00000510193 PRLHP81277 87 aa7.44□□□□□ -1.22
SH3BP2-216ENST00000510193 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
SH3BP2-216ENST00000510193 TMEM126AQ9H061 195 aa7.44□□□□□ -1.22
SH3BP2-216ENST00000510193 LEPROTO15243 131 aa7.43□□□□□ -1.22
SH3BP2-216ENST00000510193 TSPAN13O95857 204 aa7.43□□□□□ -1.22
SH3BP2-216ENST00000510193 SMIM13P0DJ93 91 aa7.43□□□□□ -1.22
SH3BP2-216ENST00000510193 CRYGAP11844 174 aa7.43□□□□□ -1.22
SH3BP2-216ENST00000510193 PRR4Q16378 134 aa7.43□□□□□ -1.22
SH3BP2-216ENST00000510193 SFTA2Q6UW10 78 aa7.43□□□□□ -1.22
SH3BP2-216ENST00000510193 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.43□□□□□ -1.22
SH3BP2-216ENST00000510193 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.42□□□□□ -1.22
SH3BP2-216ENST00000510193 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.42□□□□□ -1.22
SH3BP2-216ENST00000510193 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.42□□□□□ -1.22
SH3BP2-216ENST00000510193 C3orf79P0CE67 100 aa7.41□□□□□ -1.22
SH3BP2-216ENST00000510193 HERVK_113P61574 105 aa7.41□□□□□ -1.22
SH3BP2-216ENST00000510193 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.4□□□□□ -1.22
SH3BP2-216ENST00000510193 J3QQQ9 107 aa7.4□□□□□ -1.22
SH3BP2-216ENST00000510193 KRTDAPP60985 99 aa7.4□□□□□ -1.22
SH3BP2-216ENST00000510193 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
SH3BP2-216ENST00000510193 FAM229BQ4G0N7 80 aa7.4□□□□□ -1.22
SH3BP2-216ENST00000510193 LINC01545Q5VT33 79 aa7.4□□□□□ -1.22
SH3BP2-216ENST00000510193 PET117Q6UWS5 81 aa7.4□□□□□ -1.22
SH3BP2-216ENST00000510193 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa7.4□□□□□ -1.22
SH3BP2-216ENST00000510193 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2-216ENST00000510193 HERV-K104P63124 156 aa7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2-216ENST00000510193 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.39□□□□□ -1.23
SH3BP2-216ENST00000510193 E9PLD3 99 aa7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2-216ENST00000510193 DAND5Q8N907 189 aa7.37□□□□□ -1.23
SH3BP2-216ENST00000510193 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.36□□□□□ -1.23
SH3BP2-216ENST00000510193 LINC00587B1AMM8 73 aa7.35□□□□□ -1.23
SH3BP2-216ENST00000510193 NMUP48645 174 aa7.35□□□□□ -1.23
SH3BP2-216ENST00000510193 C3orf22Q8N5N4 141 aa7.35□□□□□ -1.23
SH3BP2-216ENST00000510193 LINC00304Q8N9R0 145 aa7.35□□□□□ -1.23
SH3BP2-216ENST00000510193 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.35□□□□□ -1.23
SH3BP2-216ENST00000510193 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.34□□□□□ -1.23
SH3BP2-216ENST00000510193 ATOH7Q8N100 152 aa7.34□□□□□ -1.23
SH3BP2-216ENST00000510193 HIST3H2BBQ8N257 126 aa7.34□□□□□ -1.23
SH3BP2-216ENST00000510193 A0A0J9YXY3 114 aa7.33□□□□□ -1.24
SH3BP2-216ENST00000510193 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SH3BP2-216ENST00000510193 NCR3O14931 201 aa7.33□□□□□ -1.24
SH3BP2-216ENST00000510193 SPRR1AP35321 89 aa7.33□□□□□ -1.24
SH3BP2-216ENST00000510193 HIGD2AQ9BW72 106 aa7.33□□□□□ -1.24
SH3BP2-216ENST00000510193 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.33□□□□□ -1.24
SH3BP2-216ENST00000510193 MUC2Q02817 5179 aa7.32□□□□□ -1.24
SH3BP2-216ENST00000510193 C20orf202A1L168 122 aa7.32□□□□□ -1.24
SH3BP2-216ENST00000510193 PRYO14603 147 aa7.32□□□□□ -1.24
SH3BP2-216ENST00000510193 S100A2P29034 98 aa7.32□□□□□ -1.24
SH3BP2-216ENST00000510193 NPC2P61916 151 aa7.32□□□□□ -1.24
SH3BP2-216ENST00000510193 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.32□□□□□ -1.24
SH3BP2-216ENST00000510193 SPRR4Q96PI1 79 aa7.32□□□□□ -1.24
SH3BP2-216ENST00000510193 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.32□□□□□ -1.24
SH3BP2-216ENST00000510193 S100A6P06703 90 aa7.31□□□□□ -1.24
SH3BP2-216ENST00000510193 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.31□□□□□ -1.24
SH3BP2-216ENST00000510193 MUC17Q685J3 4493 aa7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2-216ENST00000510193 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2-216ENST00000510193 ZNF815PA8K554 130 aa7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2-216ENST00000510193 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2-216ENST00000510193 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2-216ENST00000510193 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2-216ENST00000510193 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2-216ENST00000510193 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2-216ENST00000510193 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.29□□□□□ -1.24
SH3BP2-216ENST00000510193 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.29□□□□□ -1.24
SH3BP2-216ENST00000510193 SMCR5Q8TEV8 140 aa7.28□□□□□ -1.24
SH3BP2-216ENST00000510193 LITAFQ99732 161 aa7.28□□□□□ -1.24
SH3BP2-216ENST00000510193 CTAG1AP78358 180 aa7.27□□□□□ -1.25
SH3BP2-216ENST00000510193 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.27□□□□□ -1.25
SH3BP2-216ENST00000510193 TPRXLQ17RH7 258 aa7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms