RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 HIVEP1P15822 2718 aa8.85□□□□□ -0.99
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RABGEF1-211ENST00000503687 WFDC10BQ8IUB3 73 aa8.85□□□□□ -0.99
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RABGEF1-211ENST00000503687 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-211ENST00000503687 CITED1Q99966 193 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-211ENST00000503687 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa8.84□□□□□ -0.99
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RABGEF1-211ENST00000503687 Q8N814 137 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-211ENST00000503687 C19orf73Q9NVV2 129 aa8.84□□□□□ -0.99
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RABGEF1-211ENST00000503687 RPL37AP8A6NKH3 93 aa8.81□□□□□ -1
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RABGEF1-211ENST00000503687 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-211ENST00000503687 A0A096LNI7 61 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-211ENST00000503687 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
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RABGEF1-211ENST00000503687 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP8.73□□□□□ -1.015e-9■□□□□ 10.5
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RABGEF1-211ENST00000503687 J3KT08 172 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-211ENST00000503687 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-211ENST00000503687 Q8N9L7 120 aa8.68□□□□□ -1.02
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RABGEF1-211ENST00000503687 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-211ENST00000503687 Q6ZVQ6 151 aa8.64□□□□□ -1.03
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RABGEF1-211ENST00000503687 LINC00612Q8N6U2 182 aa8.59□□□□□ -1.03
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RABGEF1-211ENST00000503687 Q6ZRP5 223 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-211ENST00000503687 C7orf33Q8WU49 177 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGEF1-211ENST00000503687 Q6ZQT0 140 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-211ENST00000503687 Q8NDZ9 215 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-211ENST00000503687 PDZD2O15018 2839 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-211ENST00000503687 KRTAP10-11P60412 298 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-211ENST00000503687 TMEM258P61165 79 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-211ENST00000503687 C1orf137Q5JT78 98 aa8.54□□□□□ -1.04
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