RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498694.1

CTPS1-212, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 599 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-212ENST00000498694 APOMO95445 188 aa2.6□□□□□ -1.99
CTPS1-212ENST00000498694 SPINK8P0C7L1 97 aa2.6□□□□□ -1.99
CTPS1-212ENST00000498694 S100A2P29034 98 aa2.6□□□□□ -1.99
CTPS1-212ENST00000498694 CXCL5P42830 114 aa2.6□□□□□ -1.99
CTPS1-212ENST00000498694 KRTDAPP60985 99 aa2.6□□□□□ -1.99
CTPS1-212ENST00000498694 Q6ZSA8 131 aa2.6□□□□□ -1.99
CTPS1-212ENST00000498694 STPG4Q8N801 248 aa2.6□□□□□ -1.99
CTPS1-212ENST00000498694 CARD19Q96LW7 228 aa2.6□□□□□ -1.99
CTPS1-212ENST00000498694 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa2.59□□□□□ -1.99
CTPS1-212ENST00000498694 E9PLD3 99 aa2.59□□□□□ -1.99
CTPS1-212ENST00000498694 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
CTPS1-212ENST00000498694 TMEM170BQ5T4T1 132 aa2.59□□□□□ -1.99
CTPS1-212ENST00000498694 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
CTPS1-212ENST00000498694 Q6ZRU5 148 aa2.59□□□□□ -1.99
CTPS1-212ENST00000498694 LINC00526Q96FQ7 95 aa2.59□□□□□ -1.99
CTPS1-212ENST00000498694 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
CTPS1-212ENST00000498694 C6orf48Q9UBA6 75 aa2.59□□□□□ -1.99
CTPS1-212ENST00000498694 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa2.58□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa2.58□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 NDUFA1O15239 70 aa2.58□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 LEPROTO15243 131 aa2.58□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 TLX1NBP0CAT3 122 aa2.58□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP2.58□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 AKR1D1P51857 326 aa2.58□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 HERVK_113P61574 105 aa2.58□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 SYCNQ0VAF6 134 aa2.58□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 PYY3Q5JQD4 70 aa2.58□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 SFTA2Q6UW10 78 aa2.58□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 C2orf82Q6UX34 121 aa2.58□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 C9orf163Q8N9P6 203 aa2.58□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 COX7B2Q8TF08 81 aa2.58□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 CAMK2N2Q96S95 79 aa2.58□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 A0A096LNI7 61 aa2.57□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 C16orf90A8MZG2 172 aa2.57□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 PANO1I0J062 215 aa2.57□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 J3QQQ9 107 aa2.57□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 NMUP48645 174 aa2.57□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 KRTAP10-1P60331 282 aa2.57□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 ATOH7Q8N100 152 aa2.57□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 SPACA4Q8TDM5 124 aa2.57□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 PLEKHB2Q96CS7 222 aa2.57□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 PRAC1Q96KF2 57 aa2.57□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 PPDPFQ9H3Y8 114 aa2.57□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 TOMM7Q9P0U1 55 aa2.57□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 PKIGQ9Y2B9 76 aa2.57□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 EPM2AB3EWF7 344 aa2.56□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa2.56□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 SMIM6P0DI80 62 aa2.56□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa2.56□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 SDIM1Q6ZPB5 146 aa2.56□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 Q6ZRP5 223 aa2.56□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 TTTY13Q9BZ97 58 aa2.56□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 TP73-AS1Q9UF72 201 aa2.56□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 NDUFA12Q9UI09 145 aa2.56□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 FAT3Q8TDW7 4589 aa2.56□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa2.55□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa2.55□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 TSPAN13O95857 204 aa2.55□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 CHTF8P0CG12 524 aa2.55□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 CKS1BP61024 79 aa2.55□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 SCXQ7RTU7 201 aa2.55□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 SMIM29Q86T20 159 aa2.55□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 LITAFQ99732 161 aa2.55□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 ERG28Q9UKR5 140 aa2.55□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 A0A087WYN8 130 aa2.54□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 A0A0J9YXY3 114 aa2.54□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa2.54□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 ZNF815PA8K554 130 aa2.54□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 TIMM17BO60830 172 aa2.54□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 COX17Q14061 63 aa2.54□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa2.54□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 PCP2Q8IVA1 136 aa2.54□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 Q8NDZ9 215 aa2.54□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 VAMP8Q9BV40 100 aa2.54□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 PLAC8Q9NZF1 115 aa2.54□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 MYCBP2O75592 4640 aa2.53□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa2.53□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa2.53□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 DLEU1O43261 78 aa2.53□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 SMIM13P0DJ93 91 aa2.53□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 COX8AP10176 69 aa2.53□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 HAMPP81172 84 aa2.53□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 SPATA45Q537H7 98 aa2.53□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 MEIG1Q5JSS6 88 aa2.53□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa2.53□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 C2orf91Q6ZV80 131 aa2.53□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 ARL17AQ8IVW1 177 aa2.53□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 BOD1L2Q8IYS8 172 aa2.53□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa2.53□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa2.53□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 SPANXDQ9BXN6 97 aa2.53□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa2.53□□□□□ -2
CTPS1-212ENST00000498694 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
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