RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498534.5

CNOT4-211, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

TSL 2

Gene CNOT4, Length 481 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4-211ENST00000498534 S100PP25815 95 aa6.99□□□□□ -1.29
CNOT4-211ENST00000498534 FA2HQ7L5A8 372 aa6.99□□□□□ -1.29
CNOT4-211ENST00000498534 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.98□□□□□ -1.29
CNOT4-211ENST00000498534 SCO1O75880 301 aa6.98□□□□□ -1.29
CNOT4-211ENST00000498534 NDUFA6P56556 154 aa6.98□□□□□ -1.29
CNOT4-211ENST00000498534 PRLHP81277 87 aa6.98□□□□□ -1.29
CNOT4-211ENST00000498534 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.98□□□□□ -1.29
CNOT4-211ENST00000498534 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6.98□□□□□ -1.29
CNOT4-211ENST00000498534 COX17Q14061 63 aa6.97□□□□□ -1.29
CNOT4-211ENST00000498534 TPRXLQ17RH7 258 aa6.97□□□□□ -1.29
CNOT4-211ENST00000498534 TMEM126AQ9H061 195 aa6.97□□□□□ -1.29
CNOT4-211ENST00000498534 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.97□□□□□ -1.29
CNOT4-211ENST00000498534 ERG28Q9UKR5 140 aa6.97□□□□□ -1.29
CNOT4-211ENST00000498534 TMEM238C9JI98 176 aa6.96□□□□□ -1.3
CNOT4-211ENST00000498534 VPREB1P12018 145 aa6.96□□□□□ -1.3
CNOT4-211ENST00000498534 COX19Q49B96 90 aa6.96□□□□□ -1.3
CNOT4-211ENST00000498534 CBLN2Q8IUK8 224 aa6.96□□□□□ -1.3
CNOT4-211ENST00000498534 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.95□□□□□ -1.3
CNOT4-211ENST00000498534 IGLC3P0DOY3 106 aa6.95□□□□□ -1.3
CNOT4-211ENST00000498534 FABP9Q0Z7S8 132 aa6.95□□□□□ -1.3
CNOT4-211ENST00000498534 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.95□□□□□ -1.3
CNOT4-211ENST00000498534 TMEM218A2RU14 115 aa6.94□□□□□ -1.3
CNOT4-211ENST00000498534 CLLU1Q5K131 121 aa6.94□□□□□ -1.3
CNOT4-211ENST00000498534 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.94□□□□□ -1.3
CNOT4-211ENST00000498534 SFTA2Q6UW10 78 aa6.94□□□□□ -1.3
CNOT4-211ENST00000498534 UQCC3Q6UW78 93 aa6.94□□□□□ -1.3
CNOT4-211ENST00000498534 M0R378 163 aa6.93□□□□□ -1.3
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CNOT4-211ENST00000498534 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.93□□□□□ -1.3
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CNOT4-211ENST00000498534 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.92□□□□□ -1.3
CNOT4-211ENST00000498534 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.91□□□□□ -1.3
CNOT4-211ENST00000498534 LINC00614P0C842 121 aa6.91□□□□□ -1.3
CNOT4-211ENST00000498534 LINC00158P58513 81 aa6.91□□□□□ -1.3
CNOT4-211ENST00000498534 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.91□□□□□ -1.3
CNOT4-211ENST00000498534 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.91□□□□□ -1.3
CNOT4-211ENST00000498534 BAGE3Q86Y29 109 aa6.9□□□□□ -1.3
CNOT4-211ENST00000498534 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.9□□□□□ -1.3
CNOT4-211ENST00000498534 SEC11CQ9BY50 192 aa6.9□□□□□ -1.3
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CNOT4-211ENST00000498534 ATP6V1G1O75348 118 aa6.89□□□□□ -1.31
CNOT4-211ENST00000498534 HBDP02042 147 aa6.89□□□□□ -1.31
CNOT4-211ENST00000498534 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CNOT4-211ENST00000498534 Q8NDZ9 215 aa6.88□□□□□ -1.31
CNOT4-211ENST00000498534 SPRR4Q96PI1 79 aa6.88□□□□□ -1.31
CNOT4-211ENST00000498534 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.88□□□□□ -1.31
CNOT4-211ENST00000498534 MUC17Q685J3 4493 aa6.88□□□□□ -1.31
CNOT4-211ENST00000498534 A0A096LNJ9 63 aa6.87□□□□□ -1.31
CNOT4-211ENST00000498534 C11orf86A6NJI1 115 aa6.87□□□□□ -1.31
CNOT4-211ENST00000498534 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa6.87□□□□□ -1.31
CNOT4-211ENST00000498534 A0A0U1RRA0 63 aa6.86□□□□□ -1.31
CNOT4-211ENST00000498534 PMCHL1Q16048 86 aa6.86□□□□□ -1.31
CNOT4-211ENST00000498534 C18orf32Q8TCD1 76 aa6.86□□□□□ -1.31
CNOT4-211ENST00000498534 RPS10P5Q9NQ39 176 aa6.86□□□□□ -1.31
CNOT4-211ENST00000498534 RHEBQ15382 184 aa6.85□□□□□ -1.31
CNOT4-211ENST00000498534 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.85□□□□□ -1.31
CNOT4-211ENST00000498534 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CNOT4-211ENST00000498534 PRYO14603 147 aa6.84□□□□□ -1.31
CNOT4-211ENST00000498534 SPINK1P00995 79 aa6.84□□□□□ -1.31
CNOT4-211ENST00000498534 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.84□□□□□ -1.31
CNOT4-211ENST00000498534 DAND5Q8N907 189 aa6.84□□□□□ -1.31
CNOT4-211ENST00000498534 Q8NBF4 154 aa6.84□□□□□ -1.31
CNOT4-211ENST00000498534 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.84□□□□□ -1.31
CNOT4-211ENST00000498534 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.83□□□□□ -1.32
CNOT4-211ENST00000498534 LINC00587B1AMM8 73 aa6.83□□□□□ -1.32
CNOT4-211ENST00000498534 S100A12P80511 92 aa6.83□□□□□ -1.32
CNOT4-211ENST00000498534 TMEM223A0PJW6 202 aa6.82□□□□□ -1.32
CNOT4-211ENST00000498534 SMIM13P0DJ93 91 aa6.82□□□□□ -1.32
CNOT4-211ENST00000498534 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.82□□□□□ -1.32
CNOT4-211ENST00000498534 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.82□□□□□ -1.32
CNOT4-211ENST00000498534 HERV-K104P63124 156 aa6.81□□□□□ -1.32
CNOT4-211ENST00000498534 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.81□□□□□ -1.32
CNOT4-211ENST00000498534 C10orf91Q5T1B1 145 aa6.81□□□□□ -1.32
CNOT4-211ENST00000498534 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.81□□□□□ -1.32
CNOT4-211ENST00000498534 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.81□□□□□ -1.32
CNOT4-211ENST00000498534 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.8□□□□□ -1.32
CNOT4-211ENST00000498534 NCR3O14931 201 aa6.8□□□□□ -1.32
CNOT4-211ENST00000498534 SPRR1AP35321 89 aa6.8□□□□□ -1.32
CNOT4-211ENST00000498534 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CNOT4-211ENST00000498534 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CNOT4-211ENST00000498534 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.8□□□□□ -1.32
CNOT4-211ENST00000498534 COMMD7Q86VX2 200 aa6.8□□□□□ -1.32
CNOT4-211ENST00000498534 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.8□□□□□ -1.32
CNOT4-211ENST00000498534 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.8□□□□□ -1.32
CNOT4-211ENST00000498534 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.79□□□□□ -1.32
CNOT4-211ENST00000498534 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.79□□□□□ -1.32
CNOT4-211ENST00000498534 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.78□□□□□ -1.32
CNOT4-211ENST00000498534 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
CNOT4-211ENST00000498534 IFITM2Q01629 132 aa6.78□□□□□ -1.32
CNOT4-211ENST00000498534 LINC00483Q53H64 154 aa6.78□□□□□ -1.32
CNOT4-211ENST00000498534 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.78□□□□□ -1.32
CNOT4-211ENST00000498534 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.77□□□□□ -1.33
CNOT4-211ENST00000498534 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CNOT4-211ENST00000498534 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.76□□□□□ -1.33
CNOT4-211ENST00000498534 FAM19A2Q8N3H0 131 aa6.76□□□□□ -1.33
CNOT4-211ENST00000498534 B5MCH6 92 aa6.75□□□□□ -1.33
CNOT4-211ENST00000498534 SLC25A20O43772 301 aa6.75□□□□□ -1.33
CNOT4-211ENST00000498534 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CNOT4-211ENST00000498534 MOBPQ13875 183 aa6.75□□□□□ -1.33
CNOT4-211ENST00000498534 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.75□□□□□ -1.33
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