RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498443.5

TSPAN1-209, Transcript of tetraspanin 1, humanhuman

TSL 5

Gene TSPAN1, Length 1,071 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN1-209ENST00000498443 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
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TSPAN1-209ENST00000498443 DAND5Q8N907 189 aa6.91□□□□□ -1.3
TSPAN1-209ENST00000498443 CDIP1Q9H305 208 aa6.91□□□□□ -1.3
TSPAN1-209ENST00000498443 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.91□□□□□ -1.3
TSPAN1-209ENST00000498443 A0A096LPF7 62 aa6.9□□□□□ -1.3
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TSPAN1-209ENST00000498443 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.71□□□□□ -1.34
TSPAN1-209ENST00000498443 TNP2Q05952 138 aa6.71□□□□□ -1.34
TSPAN1-209ENST00000498443 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.71□□□□□ -1.34
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TSPAN1-209ENST00000498443 C2orf48Q96LS8 159 aa6.71□□□□□ -1.34
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